基于基因芯片的母猪妊娠相关基因调控网络构建
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| ·研究背景 | 第11-12页 |
| ·基因芯片技术 | 第12-15页 |
| ·基因芯片技术的基本原理 | 第12页 |
| ·基因芯片技术的发展历史 | 第12-13页 |
| ·基因芯片技术的特点 | 第13页 |
| ·基因芯片技术的应用 | 第13-14页 |
| ·基因芯片技术新发展 | 第14-15页 |
| ·基因调控网络研究现状 | 第15-20页 |
| ·基因调控网络特点 | 第15-16页 |
| ·基因调控网络构建实验技术 | 第16页 |
| ·基因调控网络构建建模及统计分析方法 | 第16-19页 |
| ·可用网络资源 | 第19-20页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第20-22页 |
| ·原理 | 第20-21页 |
| ·检测技术 | 第21-22页 |
| ·本研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 材料和方法 | 第23-36页 |
| ·试验材料 | 第23-27页 |
| ·试验猪种来源 | 第23页 |
| ·组织样的采集与保存 | 第23页 |
| ·药品和酶 | 第23页 |
| ·常用试剂配制 | 第23-25页 |
| ·主要仪器 | 第25-27页 |
| ·试验方法 | 第27-32页 |
| ·试验流程 | 第27页 |
| ·总RNA的提取和纯化 | 第27-28页 |
| ·cDNA的合成和纯化 | 第28-30页 |
| ·cRNA的合成和纯化 | 第30-31页 |
| ·cRNA片段化、配制杂交液 | 第31-32页 |
| ·芯片杂交 | 第32页 |
| ·洗脱芯片 | 第32页 |
| ·扫描芯片 | 第32页 |
| ·数据处理方法 | 第32-36页 |
| ·数据预处理 | 第32-33页 |
| ·差异基因筛选 | 第33页 |
| ·差异基因生物信息学分析 | 第33页 |
| ·基因调控网络构建 | 第33-36页 |
| 第三章 结果与分析 | 第36-47页 |
| ·RNA的提取、纯化 | 第36页 |
| ·RNA的提取 | 第36页 |
| ·RNA的纯化 | 第36页 |
| ·基因芯片杂交及数据标准化 | 第36-38页 |
| ·基因芯片杂交效果 | 第36-38页 |
| ·数据预处理 | 第38页 |
| ·Q-PCR验证结果 | 第38-40页 |
| ·Q-PCR结果 | 第38-40页 |
| ·Q-PCR结果与基因芯片结果对比 | 第40页 |
| ·差异基因筛选 | 第40-41页 |
| ·差异基因生物信息学分析 | 第41-45页 |
| ·差异基因聚类 | 第41-42页 |
| ·差异基因本体论分析 | 第42-43页 |
| ·差异基因生物通路分析 | 第43-45页 |
| ·基因调控网络构建 | 第45-46页 |
| ·新候选基因筛选及功能预测 | 第46-47页 |
| 第四章 讨论 | 第47-54页 |
| ·试验方法讨论 | 第47-48页 |
| ·RNA 的提取 | 第47页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第47页 |
| ·基因芯片杂交 | 第47-48页 |
| ·统计分析结果讨论 | 第48-54页 |
| ·基因芯片数据中弱表达及缺失值的处理 | 第48页 |
| ·网络构建模型讨论 | 第48-49页 |
| ·妊娠所涉及的生物通路研究 | 第49-50页 |
| ·基因个体注释研究 | 第50-51页 |
| ·母猪妊娠相关基因调控网络研究 | 第51-54页 |
| 第五章 全文结论 | 第54-55页 |
| ·全文结论 | 第54页 |
| ·研究展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 作者简历 | 第63页 |
