| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 1 引言 | 第12-27页 |
| ·研究的目的和意义 | 第12页 |
| ·文献综述 | 第12-25页 |
| ·水稻冷胁迫耐受机制的研究进展 | 第12-15页 |
| ·miRNA研究进展 | 第15-25页 |
| ·主要研究内容及技术路线 | 第25页 |
| ·本研究的创新点 | 第25-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-32页 |
| ·水稻miRNA基因与cDNA序列的获得与整理 | 第27页 |
| ·实验材料 | 第27页 |
| ·实验方法 | 第27页 |
| ·水稻miRNA靶基因的预测 | 第27页 |
| ·实验材料 | 第27页 |
| ·实验方法 | 第27页 |
| ·水稻冷胁迫相关miRNA家族的预测 | 第27-28页 |
| ·实验材料 | 第27-28页 |
| ·实验方法 | 第28页 |
| ·Real-time PCR验证预测结果 | 第28-32页 |
| ·实验材料 | 第28页 |
| ·实验方法 | 第28-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-86页 |
| ·水稻miRNA序列的提取 | 第32-40页 |
| ·miRNA数据库的获得 | 第32页 |
| ·水稻miRNA序列提取程序的编制 | 第32-33页 |
| ·提取结果 | 第33-40页 |
| ·水稻miRNA靶基因的预测 | 第40-48页 |
| ·水稻cDNA数据库的获得 | 第40页 |
| ·水稻miRNA靶基因的预测 | 第40-42页 |
| ·预测结果的整理 | 第42-48页 |
| ·水稻冷胁迫相关miRNA的筛选 | 第48-81页 |
| ·靶基因的BLASTx比对 | 第48-55页 |
| ·蛋白数据中GO注释信息的抽取 | 第55-56页 |
| ·冷胁迫相关GO term的筛选 | 第56-59页 |
| ·基于GO term信息冷胁迫相关靶基因筛选 | 第59-60页 |
| ·基于TIGR数据库功能注释冷胁迫相关靶基因的筛选 | 第60-79页 |
| ·获得水稻冷胁迫相关miRNA家族 | 第79-81页 |
| ·水稻冷胁迫相关miRNA家族预测结果的Real-time PCR验证 | 第81-86页 |
| ·用于real-time PCR验证miRNA基因的选择 | 第81页 |
| ·osa-miR393和osa-miR396c上游顺式作用元件生物信息学分析 | 第81页 |
| ·cDNA模板的制备 | 第81-82页 |
| ·miRNA基因Real-time PCR检测 | 第82-86页 |
| 4 讨论 | 第86-88页 |
| ·利用生物信息学方法预测某一特定功能miRNA的可行性 | 第86页 |
| ·2个miRNA基因表达量在冷胁迫后变化不大的原因 | 第86-87页 |
| ·miRNA靶基因的功能分析 | 第87页 |
| ·研究展望 | 第87-88页 |
| 5 结论 | 第88-91页 |
| ·水稻miRNA序列的提取和整理 | 第88页 |
| ·水稻miRNA靶基因的预测 | 第88页 |
| ·基于GOterm注释信息冷胁迫相关靶基因的筛选 | 第88页 |
| ·基于TIGR数据库功能注释冷胁迫相关靶基因的筛选 | 第88-89页 |
| ·水稻冷胁迫相关miRNA基因家族的预测 | 第89-90页 |
| ·osa-miR393和osa-miR396c与冷胁迫相关性的验证 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-98页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第98页 |
