| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 第一章 文蛤选择育种研究背景 | 第12-27页 |
| 1、文蛤生物学 | 第12-15页 |
| ·文蛤分类地位和经济价值 | 第12页 |
| ·文蛤的地理分布和形态标记 | 第12-13页 |
| ·影响文蛤生长发育的因素 | 第13-14页 |
| ·影响文蛤抗性的因素 | 第14-15页 |
| 2、贝类性状改良技术 | 第15-18页 |
| ·选配制度 | 第15-16页 |
| ·育种性状的选择 | 第16-18页 |
| 3、分子标记辅助选育 | 第18-21页 |
| ·分子标记辅助选择的遗传学基础 | 第18-20页 |
| ·分子标记辅助选择的用途 | 第20-21页 |
| 4、可用于育种的DNA 分子标记 | 第21-27页 |
| ·分子标记的类型 | 第22页 |
| ·SNP 标记在贝类育种中运用的可行性 | 第22-23页 |
| ·新一代测序平台加速了SNP 的运用 | 第23-24页 |
| ·SNP 分型技术 | 第24-27页 |
| 第二章 文蛤选育群体的建立和不同群体生长的比较 | 第27-36页 |
| 1、材料方法 | 第27-31页 |
| ·文蛤群体的建立 | 第27-29页 |
| ·四个文蛤群体幼虫和稚贝的繁育 | 第29页 |
| ·四个文蛤群体的养成 | 第29-30页 |
| ·数据采集和处理 | 第30-31页 |
| 2、实验结果 | 第31-34页 |
| ·不同壳纹群体的生长性状比较 | 第31-32页 |
| ·G×E 交互作用对文蛤生长性状的影响 | 第32-33页 |
| ·JSH 的遗传获得 | 第33-34页 |
| 3、讨论 | 第34-36页 |
| 第三章 果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因的克隆及其SNP 位点与文蛤生长性状的关联分析 | 第36-51页 |
| 1、材料方法 | 第36-41页 |
| ·实验材料 | 第36-37页 |
| ·RNA 提取和第一链cDNA 合成 | 第37-38页 |
| ·文蛤果糖-1,6-二磷酸醛缩酶（MmeFBA）基因的克隆 | 第38-39页 |
| ·MmeFBA 基因序列分析 | 第39-40页 |
| ·MmeFBA 基因在文蛤不同组织和不同发育阶段的表达 | 第40页 |
| ·检测MmeFBA cDNA 中的SNP | 第40页 |
| ·MmeFBA 三级结构分析 | 第40页 |
| ·文蛤个体SNP 分型 | 第40-41页 |
| ·数据分析 | 第41页 |
| 2、实验结果 | 第41-48页 |
| ·MmeFBA 基因序列分析 | 第41-43页 |
| ·MmeFBA 基因在文蛤不同组织和幼虫不同发育阶段的表达 | 第43-44页 |
| ·MmeFBA 基因中SNP 的检测 | 第44-47页 |
| ·MmeFBA 基因中SNP 在JSF 和JSC 的分布 | 第47-48页 |
| 3、讨论 | 第48-51页 |
| 第四章 转硫酶样基因中SNP 发掘及其与文蛤生长性状的关联分析 | 第51-64页 |
| 1、材料方法 | 第51-55页 |
| ·实验材料 | 第51-52页 |
| ·文蛤转硫酶样（MmeSUl）基因中SNP 的发现与验证 | 第52-53页 |
| ·MmeSUl 三级结构分析 | 第53页 |
| ·改进的Tm-shift 法对SNP 分型 | 第53-54页 |
| ·数据分析 | 第54-55页 |
| 2、实验结果 | 第55-60页 |
| ·MmeSUl 基因序列分析 | 第55-56页 |
| ·MmeSUl 基因中SNP 的验证 | 第56-58页 |
| ·Tm-shift 法对SNP 分型 | 第58页 |
| ·SNP 基因型在家系和群体中的分布 | 第58-59页 |
| ·SNP 位点与文蛤生长性状的关联分析 | 第59-60页 |
| ·SNP 单倍型与文蛤生长性状的关联分析 | 第60页 |
| 3、讨论 | 第60-64页 |
| 第五章 硒代谷胱甘肽过氧化物酶基因的克隆及其在文蛤抗性群体中的表达分析 | 第64-80页 |
| 1、材料方法 | 第64-68页 |
| ·实验材料 | 第64-66页 |
| ·弧菌刺激实验 | 第66页 |
| ·RNA 提取和SMART RACE 方法第一链cDNA 合成 | 第66页 |
| ·MmeGPx 基因的克隆和序列分析 | 第66-67页 |
| ·MmeGPx 基因组DNA 序列 | 第67页 |
| ·MmeGPx 基因在文蛤不同组织和不同发育阶段的表达 | 第67-68页 |
| ·GPx 酶活测定 | 第68页 |
| ·弧菌刺激后文蛤MmeGPx 的表达变化 | 第68页 |
| ·数据分析 | 第68页 |
| 2、实验结果 | 第68-77页 |
| ·MmeGPx 基因序列分析 | 第68-73页 |
| ·MmeGPx 基因结构 | 第73页 |
| ·MmeGPx 基因在各组织中的表达 | 第73-74页 |
| ·文蛤不同组织中GPx 的酶活 | 第74页 |
| ·MmeGPx 基因在文蛤幼虫不同发育阶段的表达 | 第74-75页 |
| ·自然群体中MmeGPx 基因的应激表达 | 第75页 |
| ·09RP 和09CP 累积死亡率的比较 | 第75-76页 |
| ·09RP 和09CP 中MmeGPx 基因的应激表达 | 第76-77页 |
| 3、讨论 | 第77-80页 |
| 结论 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-96页 |
| 硕士期间发表和完成的文章 | 第96-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
