| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-16页 |
| ·引言 | 第12页 |
| ·基因组研究中的生物信息学 | 第12-16页 |
| ·生物信息学 | 第12-13页 |
| ·生物信息学发展概况 | 第13页 |
| ·基因组研究中的生物信息学 | 第13-16页 |
| ·功能基因组信息学 | 第13-14页 |
| ·比较基因组学 | 第14-16页 |
| 第二章 纤维素酶新分类模式 | 第16-28页 |
| ·研究背景 | 第16-17页 |
| ·本章研究方法 | 第17-20页 |
| ·序列获取整理与初分类 | 第17-18页 |
| ·使用HMMER检索序列中的结构域 | 第18-19页 |
| ·数据挖掘准备工作及数据挖掘 | 第19页 |
| ·分类 | 第19-20页 |
| ·本章分析结果 | 第20-26页 |
| ·本章讨论 | 第26-28页 |
| 第三章 SouthLoc:一种优化Southern杂交方案和定位序列插入位点的工具 | 第28-55页 |
| ·本章研究背景 | 第28-35页 |
| ·研究基因功能的方法 | 第28-32页 |
| ·传统的研究方法 | 第28页 |
| ·适合于功能基因组研究的方法 | 第28-32页 |
| ·插入片段的检测 | 第32-35页 |
| ·普通PCR | 第32页 |
| ·Southern杂交 | 第32-33页 |
| ·TAIL-PCR | 第33页 |
| ·反向PCR | 第33-34页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第34页 |
| ·一般的技术路线 | 第34-35页 |
| ·本文的工作 | 第35页 |
| ·SouthLoc的设计思路 | 第35-44页 |
| ·基本思路 | 第35-37页 |
| ·基因组序列的预处理 | 第37-38页 |
| ·两种评分策略 | 第38-39页 |
| ·多种酶的组合方案 | 第39-41页 |
| ·问题的图论表示及解法 | 第41-44页 |
| ·其它的细节 | 第44页 |
| ·SouthLoc主要功能和部分算法介绍 | 第44-50页 |
| ·SouthLoc主要功能 | 第44-45页 |
| ·通用的处理函数 | 第45页 |
| ·最小回路的计算 | 第45-50页 |
| ·SouthLoc的典型分析流程及结果讨论 | 第50-55页 |
| ·SouthLoc的典型分析流程 | 第50-53页 |
| ·结果讨论 | 第53-55页 |
| 全文总结 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 致谢 | 第63页 |