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大菱鲆受哈维氏弧菌感染后的基因差异表达研究

摘要第1-9页
Abstract第9-12页
1 前言第12-31页
   ·抑制性消减杂交技术第13-15页
     ·抑制性消减杂交技术基本原理第13页
     ·抑制消减杂交技术的操作过程第13-14页
     ·抑制消减杂交技术的特点第14-15页
   ·SSH 技术与其它差异显示技术的比较第15-21页
     ·限制性酶切片段差异显示技术第16-17页
     ·代表性差异分析第17-18页
     ·mRNA 差异显示技术第18-19页
     ·基因表达系列分析第19-20页
     ·cDNA 微阵列技术第20-21页
     ·SSH 技术与其它差异显示方法的比较第21页
   ·SSH 技术在鱼类免疫基因克隆中的应用第21-29页
     ·鱼类的白细胞介素(interleukins,ILs)基因第22-23页
     ·趋化因子(chemokine)基因第23-24页
     ·肿瘤坏死因子(Tumor necrosis factor,TNF)基因第24-25页
     ·溶菌酶(Lysozyme)基因第25-26页
     ·NK细胞增强因子(NKEF)基因第26页
     ·补体(complement component)基因第26-28页
     ·干扰素基因第28-29页
   ·本论文研究的目的和意义第29-31页
2 材料与方法第31-56页
   ·实验动物和菌株来源第31页
   ·培养基第31页
   ·试剂和仪器第31-32页
   ·菌液制备第32页
   ·大菱鲆的感染和组织的获取第32页
   ·大菱鲆肾组织和脾组织总RNA 的提取第32-33页
   ·mRNA 的纯化第33页
     ·mRNA 的纯化准备第33页
     ·mRNA 的纯化步骤第33页
   ·差减cDNA 文库的建立第33-41页
     ·合成双链cDNA第34-35页
     ·cDNA RsaI 酶切第35-36页
     ·Tester cDNA 的制备——接头连接第36-38页
     ·二轮差减杂交第38-39页
     ·二轮差减 PCR 鉴定第39-41页
   ·差减文库克隆第41-44页
   ·斑点杂交第44-45页
   ·阳性克隆序列测序第45页
   ·RACE 技术扩增 MHC class Ia 全长第45-53页
     ·RACE 的原理和技术路线第45-47页
     ·RACE 步骤第47-53页
       ·引物的设计第47-48页
       ·反转录合成第一链第48-49页
       ·5’和3’RACE PCR 反应第49-51页
       ·RACE PCR 扩增片断的纯化与回收第51-52页
       ·RACE PCR 扩增片断的克隆第52-53页
   ·Real-time PCR第53-56页
     ·标准品的制备第53页
     ·定量 PCR 引物的设计第53-54页
     ·标准品和待测样品 Ct 值范围的校正第54页
     ·MHC class Ia 基因的Real-time PCR 表达分析第54-56页
3. 结果与分析第56-73页
   ·大菱鲆总RNA 的电泳检测第56页
   ·mRNA 纯度及浓度的检测第56-57页
   ·差减文库的构建第57-59页
     ·cDNA RsaI 酶切第57页
     ·Tester cDNA 接头连接效率的检测第57-58页
     ·消减效率的检测第58-59页
   ·差减文库的克隆鉴定第59-60页
   ·斑点杂交第60-62页
   ·阳性克隆片断的同源性分析第62-64页
   ·MHC class Ia 基因全序列扩增第64-69页
     ·MHC class Ia 基因的 3’RACE PCR 和5’RACE PCR 的扩增第64-65页
     ·MHC class Ia 序列分析第65-67页
     ·MHC class Ia 氨基酸序列同源性分析第67-69页
   ·Real-time PCR第69-73页
     ·Real-time PCR 标准品的制备第69-70页
     ·MHC class Ia 基因的Real-time PCR 表达分析第70-72页
     ·MHC class Ia 基因在实验组和对照组的相对表达量第72-73页
4 讨论第73-77页
5 小结第77-78页
参考文献第78-84页
附录 I 溶液配方第84-85页
附录 II PCR primer1, adaptor1, adaptor2R和Rsa I酶切位 点序列第85-87页
附录 IV 攻读硕士期间发表和撰写的文章第87-88页
致谢第88页

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