| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-24页 |
| §1．1 概述 | 第10-11页 |
| §1．2 遗传学发展简史与遗传流行病学 | 第11-13页 |
| §1．3 单倍型分析的重要性与研究现状 | 第13-21页 |
| §1．3．1 单倍型分析的重要性 | 第14-16页 |
| §1．3．2 单倍型推断的研究现状 | 第16-19页 |
| §1．3．3 单倍型关联分析的研究现状 | 第19-21页 |
| §1．4 基因型测量误差 | 第21-22页 |
| §1．5 本文的主要工作和结构安排 | 第22-24页 |
| 第二章 遗传学基本概念与统计定义 | 第24-32页 |
| §2．1 概述 | 第24页 |
| §2．2 遗传学基本术语与部分统计学描述 | 第24-31页 |
| §2．3 说明与小结 | 第31-32页 |
| 第三章 带有测量误差群体数据的单倍型推断方法 | 第32-68页 |
| §3．1 引言 | 第32-34页 |
| §3．2 双重抽样与多次测量的基因型分类方法 | 第34-47页 |
| §3．2．1 双重抽样设计与“基因图谱” | 第35-40页 |
| §3．2．2 多次测量设计与“基因图谱” | 第40-47页 |
| §3．3 单倍型推断的DS-EM算法和MG-EM算法 | 第47-51页 |
| §3．3．1 DS-EM算法 | 第48-50页 |
| §3．3．2 MG-EM算法 | 第50-51页 |
| §3．4 相对样本大小的计算 | 第51-56页 |
| §3．4．1 DS-EM的观测信息阵 | 第52-55页 |
| §3．4．2 MG-EM的观测信息阵 | 第55-56页 |
| §3．5 模拟研究 | 第56-64页 |
| §3．5．1 模拟设计 | 第57-58页 |
| §3．5．2 DS-EM、MG-EM与传统EM方法的比较研究 | 第58-62页 |
| §3．5．3 基于真实数据的模拟研究 | 第62-64页 |
| §3．6 例子 | 第64页 |
| §3．7 讨论 | 第64-68页 |
| 第四章 带有测量误差家系数据的单倍型推断方法 | 第68-88页 |
| §4．1 引言 | 第68-70页 |
| §4．2 记号与“基因图谱” | 第70-73页 |
| §4．3 基于家系结构估计单倍型频率的GS-PEM方法 | 第73-78页 |
| §4．4 参数估计的标准差 | 第78-80页 |
| §4．5 模拟与模拟结果 | 第80-85页 |
| §4．5．1 模拟设计 | 第80-82页 |
| §4．5．2 模拟结果 | 第82-85页 |
| §4．6 讨论 | 第85-88页 |
| 第五章 病例-对照研究中基因型带有测量误差时单倍型关联分析的似然方法 | 第88-106页 |
| §5．1 引言 | 第88-90页 |
| §5．2 记号和“基因图谱” | 第90-91页 |
| §5．3 统计模型 | 第91-92页 |
| §5．4 基因型不确定时估计模型参数的加权EM方法 | 第92-95页 |
| §5．5 参数估计的标准差 | 第95-98页 |
| §5．6 检验统计量 | 第98-99页 |
| §5．7 模拟与结果 | 第99-104页 |
| §5．7．1 模拟设计 | 第99-101页 |
| §5．7．2 模拟结果 | 第101-104页 |
| §5．8 讨论 | 第104-106页 |
| 结论 | 第106-108页 |
| 附录 | 第108-110页 |
| 参考文献 | 第110-120页 |
| 在学期间公开发表(投稿)论文情况 | 第120-122页 |
| 致谢 | 第122页 |
