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脊椎动物激肽原基因的系统发育分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 激肽原基因的研究进展第11-18页
   ·哺乳动物激肽原基因研究进展第11-16页
     ·哺乳动物激肽原基因结构第11-13页
     ·人体内激肽原的功能第13-16页
   ·非哺乳动物激肽原基因研究进展第16页
   ·小结第16-18页
第二章 脊椎动物激肽原基因的系统发育分析第18-34页
   ·引言第18页
   ·材料和方法第18-20页
     ·激肽原的识别第18页
     ·序列比对和系统发育分析第18-19页
     ·基因结构分析第19页
     ·信号肽预测和基序分析第19页
     ·两栖动物缓激肽结构域的变化位点分析第19-20页
   ·结果第20-29页
     ·激肽原家族新成员的识别第20页
     ·脊椎动物激肽原的系统发育分析第20页
     ·相对于氨基酸序列比对的基因结构第20-25页
     ·激肽原的保守性第25-28页
     ·两栖动物缓激肽的结构多样性第28-29页
   ·讨论第29-32页
     ·不同数据库中序列的差异第29-30页
     ·激肽原的系统发育关系第30页
     ·激肽原基因内含子位置和相位的进化趋势第30页
     ·激肽原结构域的进化第30-32页
     ·两栖动物缓激肽的多样性第32页
   ·结论第32-34页
第三章 日本七鳃鳗肝脏组织中激肽原基因的克隆与分析第34-48页
   ·引言第34页
   ·材料和方法第34-40页
     ·材料第34-35页
     ·总RNA 的提取第35页
     ·已知序列验证第35-37页
     ·cDNA3’末端快速扩增反应(3’RACE)第37-38页
     ·cDNA5’末端快速扩增反应(5’RACE)第38页
     ·序列拼接及最终验证第38-39页
     ·三极结构预测第39页
     ·序列比对和系统发育分析第39页
     ·组织分布分析第39-40页
   ·结果第40-46页
     ·七鳃鳗肝脏总RNA 的提取第40-41页
     ·七鳃鳗肝脏激肽原的扩增及蛋白结构域预测第41-43页
     ·系统发育分析第43-44页
     ·组织分布第44-46页
   ·讨论第46-47页
     ·3’非翻译区的可变性第46页
     ·kng_lamprey 结构域的特点第46-47页
     ·七鳃鳗激肽原的组织分布特点第47页
   ·结论第47-48页
第四章 全文总结第48-51页
参考文献第51-57页
附录第57-91页
 附录1 激肽原基因的相关信息第57-60页
 附录2 FASTA 格式的激肽原氨基酸序列第60-74页
 附录3 SignalP 3.0 在线软件预测的激肽原信号肽序列第74-78页
 附录4 运用MEME 在线软件,在所有激肽原氨基酸序列(无信号肽序列)中发现的保守基序的类型和分布第78-79页
 附录5 运用MEME 在线软件,在所有激肽原氨基酸序列(无信号肽序列)中发现的保守基序第79-80页
 附录6 运用MEME 在线软件,在两栖动物激肽原氨基酸序列(无信号肽序列)中发现的保守基序的类型和分布第80-81页
 附录7 运用MEME 在线软件,在两栖动物激肽原氨基酸序列(无信号肽序列)中发现的保守基序第81-82页
 附录8 用作可变位点分析的两栖动物缓激肽第82-87页
 附录9 3’RACE 测得的4 个克隆子的序列比对第87-91页
发表论文第91-92页
致谢第92页

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