| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-15页 |
| 第一章 前言 | 第15-41页 |
| 第一节 遗传多样性概述 | 第15-20页 |
| 1 表现形式 | 第15页 |
| 2 检测方法 | 第15-19页 |
| ·形态标记 | 第16页 |
| ·细胞学标记 | 第16-17页 |
| ·蛋白标记 | 第17页 |
| ·DNA标记 | 第17-19页 |
| 3 研究意义 | 第19页 |
| 4 遗传多样性与景观遗传学 | 第19-20页 |
| 第二节 微卫星DNA及其在软体动物中的应用 | 第20-25页 |
| 1 微卫星DNA的结构 | 第20页 |
| 2 微卫星DNA的分类 | 第20页 |
| 3 形成机制 | 第20-21页 |
| 4 分离方法 | 第21页 |
| 5 检测方法 | 第21-22页 |
| 6 微卫星标记的特性 | 第22页 |
| 7 软体动物中微卫星DNA研究现状 | 第22-25页 |
| 第三节 线粒体基因组及其在软体动物中的研究概况 | 第25-33页 |
| 1 基因组学 | 第25-26页 |
| 2 线粒体基因组 | 第26-30页 |
| ·线粒体概述 | 第26-27页 |
| ·研究内容 | 第27-28页 |
| ·测序方法 | 第28-30页 |
| 3 线粒体基因组研究的意义 | 第30-31页 |
| 4 软体动物全线粒体基因组研究概况 | 第31-33页 |
| 第四节 湖北钉螺遗传多样性研究进展 | 第33-39页 |
| 1 湖北钉螺的发现 | 第34页 |
| 2 早期分类研究 | 第34-35页 |
| 3 遗传多样性研究进展 | 第35-38页 |
| 4 种下分类新进展 | 第38-39页 |
| 第五节 本研究的主要内容 | 第39-41页 |
| 1 目标 | 第39页 |
| 2 研究内容和技术路线 | 第39-41页 |
| 第二章 湖北钉螺空间遗传信息管理系统的构建 | 第41-49页 |
| 1 材料与方法 | 第41-43页 |
| ·样本采集与处置 | 第41-42页 |
| ·数据库的设计 | 第42页 |
| ·管理系统的设计 | 第42-43页 |
| ·管理系统的表述 | 第43页 |
| 2 结果 | 第43-47页 |
| ·样本收集 | 第43页 |
| ·数据库的构建 | 第43-45页 |
| ·管理系统的构建 | 第45-46页 |
| ·管理系统的初步实现 | 第46-47页 |
| 3 讨论 | 第47-49页 |
| 第三章 基于微卫星DNA的湖北钉螺群体遗传结构研究 | 第49-91页 |
| 第一节 湖北钉螺微卫星DNA库构建 | 第49-63页 |
| 1 材料与方法 | 第49-57页 |
| ·样本来源 | 第49-50页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第50页 |
| ·基因组DNA提取 | 第50-51页 |
| ·寡核苷酸探针和引物接头序列 | 第51页 |
| ·酶切和回收基因组DNA片段 | 第51-52页 |
| ·杂交、亲和素富集 | 第52-54页 |
| ·PCR产物克隆 | 第54-57页 |
| ·序列测定与分析 | 第57页 |
| 2 结果 | 第57-61页 |
| ·酶切基因组DNA、胶回收酶切片段 | 第57页 |
| ·第一次PCR扩增富集连接产物 | 第57-58页 |
| ·第二次PCR富集微卫星DNA | 第58-59页 |
| ·PCR扩增再次富集微卫星DNA | 第59页 |
| ·克隆测序 | 第59-60页 |
| ·微卫星DNA库 | 第60-61页 |
| 3 分析与讨论 | 第61-63页 |
| 第二节 湖北钉螺微卫星DNA多态位点筛选 | 第63-74页 |
| 1 材料与方法 | 第64-67页 |
| ·样本来源 | 第64页 |
| ·微卫星位点引物设计 | 第64页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第64页 |
| ·基因组DNA提取 | 第64-65页 |
| ·微卫星DNA位点PCR扩增 | 第65页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选多态性位点 | 第65-66页 |
| ·基因扫描 | 第66-67页 |
| ·数据分析 | 第67页 |
| 2 结果 | 第67-72页 |
| ·引物优化和PCR扩增 | 第67-70页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果 | 第70-71页 |
| ·基因扫描 | 第71-72页 |
| 3 分析与讨论 | 第72-74页 |
| 第三节 长江中下游地区湖北钉螺群体遗传结构研究 | 第74-89页 |
| 1 材料与方法 | 第74-77页 |
| ·样本来源 | 第74-75页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第75页 |
| ·基因组DNA提取 | 第75-76页 |
| ·基因扫描 | 第76页 |
| ·遗传多样性指标 | 第76-77页 |
| ·统计分析 | 第77页 |
| 2 结果 | 第77-87页 |
| ·基因扫描 | 第77-78页 |
| ·数据分析前处理 | 第78页 |
| ·群体内遗传多样性分析 | 第78-84页 |
| ·群体间遗传多样性分析 | 第84-87页 |
| 3 分析与讨论 | 第87-89页 |
| ·群体内遗传变异 | 第87-88页 |
| ·群体间遗传变异 | 第88-89页 |
| 第四节 本章小结 | 第89-91页 |
| 1 湖北钉螺微卫星DNA库的构建 | 第89页 |
| 2 微卫星DNA特征及多态位点筛选 | 第89-90页 |
| 3 长江中下游地区湖北钉螺群体遗传结构 | 第90-91页 |
| 第四章 基于线粒体基因的湖北钉螺遗传多样性研究 | 第91-128页 |
| 第一节 湖北钉螺线粒体基因组的研究 | 第91-114页 |
| 1 材料与方法 | 第92-99页 |
| ·样本来源 | 第92页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第92页 |
| ·基因组DNA提取 | 第92-93页 |
| ·线粒体基因结构和排序预测 | 第93-94页 |
| ·短片段扩增及测序 | 第94页 |
| ·同源序列分析及长片段引物设计 | 第94-95页 |
| ·长片段PCR扩增及步移测序 | 第95-96页 |
| ·SubPCR引物设计及克隆测序 | 第96-98页 |
| ·序列拼接和组装 | 第98页 |
| ·mtDNA序列生物信息学分析 | 第98-99页 |
| 2 结果 | 第99-111页 |
| ·线粒体基因组研究方法 | 第99页 |
| ·线粒体基因组总DNA提取 | 第99-100页 |
| ·mtDNA短片段扩增 | 第100页 |
| ·mtDNA长片段扩增及步移测序 | 第100-101页 |
| ·SubPCR扩增及测序 | 第101-102页 |
| ·序列片段的拼装 | 第102-106页 |
| ·mtDNA序列生物信息学分析 | 第106-111页 |
| 3 讨论 | 第111-114页 |
| 第二节 湖北钉螺不同景观群体遗传多样性的研究 | 第114-126页 |
| 1 材料与方法 | 第115-118页 |
| ·钉螺来源 | 第115页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第115页 |
| ·基因组DNA提取 | 第115-116页 |
| ·PCR扩增及克隆测序 | 第116-117页 |
| ·序列分析 | 第117-118页 |
| ·遗传变异的统计分析 | 第118页 |
| 2 结果 | 第118-123页 |
| ·序列分析 | 第118-120页 |
| ·遗传关系关系分析 | 第120-122页 |
| ·空间相关性分析 | 第122-123页 |
| 3 讨论 | 第123-126页 |
| ·景观生态环境隔断是否引起遗传隔断 | 第124页 |
| ·广西丘陵地区钉螺群体是否为单系群 | 第124-125页 |
| ·福建钉螺群体与其他钉螺群体是否存在趋同进化 | 第125-126页 |
| 第三节 本章小结 | 第126-128页 |
| 第五章 全文总结 | 第128-132页 |
| 1 主要研究结果 | 第128-130页 |
| 2 本研究创新点 | 第130-131页 |
| 3 本研究不足之处 | 第131页 |
| 4 今后研究重点 | 第131-132页 |
| 参考文献 | 第132-143页 |
| 致谢 | 第143-144页 |
| 附录1 主要仪器和试剂 | 第144-149页 |
| 1 主要仪器 | 第144-145页 |
| 2 主要试剂 | 第145页 |
| 3 主要溶液 | 第145-149页 |
| 附录2 发表论文题录和主要论著正文 | 第149-150页 |
| 附录3 | 第150-164页 |