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芸薹属内含子长度多态性和EST单核苷酸多态性研究

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
前言第13-14页
第一章 文献综述第14-25页
   ·内含子位点和内含子长度变异的相关研究第14-18页
     ·内含子的起源和内含子位点进化模式第14-16页
     ·内含子长度变异相关研究第16-18页
   ·芸薹属比较基因组学研究第18-25页
     ·早期的芸薹属分类和进化研究第18页
     ·芸薹属的叶绿体和线粒体DNA分析第18-19页
     ·芸薹属的核基因组比较研究第19-22页
     ·拟南芥与芸薹属之间的比较研究第22-25页
第二章 芸薹属内含子长度变异规律的研究第25-39页
   ·材料与方法第25-28页
     ·芸薹属内含子长度多态性引物的设计第25-26页
     ·芸薹属材料第26-28页
     ·PCR扩增和电泳分离第28页
     ·电泳条带的统计以及系统发生树的构建第28页
   ·结果和分析第28-33页
     ·芸薹属PIP引物的开发第28页
     ·电泳分离结果第28-29页
     ·ILP在不同基因组型之间的变异规律第29-31页
     ·芸薹属系统发生树的构建第31-33页
   ·讨论第33-39页
     ·内含子变异在系统发生学研究上的应用第33页
     ·内含子在各分类水平的变异规律第33页
     ·不同类型序列所构建系统发生树的比较第33-35页
     ·ILP特点总结第35-39页
第三章 芸薹属EST-SNP的发掘与分析第39-46页
   ·材料与方法第39-40页
     ·EST序列的获得第39-40页
     ·EST序列的聚类和拼接第40页
     ·SNP和Indel的挖掘第40页
   ·结果与分析第40-44页
     ·芸薹属EST-SNP挖掘概况第40-42页
     ·芸薹属EST-SNP分析第42-44页
     ·芸薹属EST序列中InDel分析第44页
   ·讨论第44-46页
结论第46-47页
参考文献第47-58页
附录第58-66页
致谢第66-67页
硕士研究生期间发表的论文第67页

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