芸薹属内含子长度多态性和EST单核苷酸多态性研究
摘要 | 第1-11页 |
Abstract | 第11-13页 |
前言 | 第13-14页 |
第一章 文献综述 | 第14-25页 |
·内含子位点和内含子长度变异的相关研究 | 第14-18页 |
·内含子的起源和内含子位点进化模式 | 第14-16页 |
·内含子长度变异相关研究 | 第16-18页 |
·芸薹属比较基因组学研究 | 第18-25页 |
·早期的芸薹属分类和进化研究 | 第18页 |
·芸薹属的叶绿体和线粒体DNA分析 | 第18-19页 |
·芸薹属的核基因组比较研究 | 第19-22页 |
·拟南芥与芸薹属之间的比较研究 | 第22-25页 |
第二章 芸薹属内含子长度变异规律的研究 | 第25-39页 |
·材料与方法 | 第25-28页 |
·芸薹属内含子长度多态性引物的设计 | 第25-26页 |
·芸薹属材料 | 第26-28页 |
·PCR扩增和电泳分离 | 第28页 |
·电泳条带的统计以及系统发生树的构建 | 第28页 |
·结果和分析 | 第28-33页 |
·芸薹属PIP引物的开发 | 第28页 |
·电泳分离结果 | 第28-29页 |
·ILP在不同基因组型之间的变异规律 | 第29-31页 |
·芸薹属系统发生树的构建 | 第31-33页 |
·讨论 | 第33-39页 |
·内含子变异在系统发生学研究上的应用 | 第33页 |
·内含子在各分类水平的变异规律 | 第33页 |
·不同类型序列所构建系统发生树的比较 | 第33-35页 |
·ILP特点总结 | 第35-39页 |
第三章 芸薹属EST-SNP的发掘与分析 | 第39-46页 |
·材料与方法 | 第39-40页 |
·EST序列的获得 | 第39-40页 |
·EST序列的聚类和拼接 | 第40页 |
·SNP和Indel的挖掘 | 第40页 |
·结果与分析 | 第40-44页 |
·芸薹属EST-SNP挖掘概况 | 第40-42页 |
·芸薹属EST-SNP分析 | 第42-44页 |
·芸薹属EST序列中InDel分析 | 第44页 |
·讨论 | 第44-46页 |
结论 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-58页 |
附录 | 第58-66页 |
致谢 | 第66-67页 |
硕士研究生期间发表的论文 | 第67页 |