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利用全基因组高通量SNP标记定位猪乳头数和断奶体重QTL

第一部分 利用全基因组高通量SNP标记定位猪乳头数QTL第1-7页
 中文摘要第4-5页
 ABSTRACT第5-7页
第二部分 利用全基因组高通量SNP标记定位45日龄仔猪断奶体重QTL第7-12页
 中文摘要第7-8页
 ABSTRACT第8-12页
第一章 文献综述第12-39页
 1 畜禽数量性状QTL定位及主效基因鉴别第12-26页
   ·QTL定位第12-18页
     ·QTL定位的概念第12页
     ·QTL定位的策略与基本步骤第12页
     ·QTL定位常用的群体设计第12-13页
     ·QTL定位常用的遗传标记第13-14页
     ·QTL定位的统计分析方法第14-15页
     ·QTL精细定位及其影响因素第15-16页
     ·QTL精细定位的常用方法第16-18页
       ·利用连锁不平衡(LD)进行QTL精细定位第16-17页
       ·利用LDLA进行QTL精细定位第17页
       ·利用后裔同源(IBD)分析进行QTL精细定位第17-18页
       ·利用选择性清除(Selective Sweep)效应分析进行QTL精细定位第18页
   ·主效基因的鉴别第18-26页
     ·猪主效基因鉴别的经典策略第18-19页
     ·猪主效基因鉴别的成功案例第19-26页
       ·单基因性状(Monogenic trait)的主效基因第19-23页
       ·数量性状的主效基因第23-26页
     ·猪主效基因鉴别的发展趋势第26页
 2 母猪繁殖性状研究概述第26-32页
   ·研究猪繁殖性状的科学意义及经济价值第26页
   ·度量母猪繁殖性状的常用指标第26-32页
     ·排卵率第26-27页
     ·产仔数第27页
     ·初生体重第27页
     ·初情期第27-28页
     ·子宫容积第28页
     ·断奶体重第28页
     ·乳头数第28-32页
       ·乳头的分类第29页
       ·乳头乳腺形成与发育的阶段第29-30页
       ·调控胚胎期乳头和乳腺形成与发育的信号通路第30-31页
       ·调控乳头和乳腺形成与发育的相关基因第31-32页
 3 猪乳头数QTL定位及候选基因研究进展第32-36页
 4 仔猪断奶体重QTL定位及候选基因研究进展第36-37页
 5 本研究的目的、意义第37-39页
   ·本研究的目的第37-38页
   ·本研究的意义第38-39页
第二章 利用全基因组高通量SNP标记定位猪乳头数QTL第39-63页
 1 引言第39-40页
 2 材料与方法第40-42页
   ·实验群体构建与表型测定第40-41页
     ·实验群体的构建第40页
       ·二花脸猪×通城猪F_2资源群体第40页
       ·二花脸猪×荣昌猪F_2资源群体第40页
       ·二花脸猪×巴马香猪F_2资源群体第40页
       ·二花脸猪×沙子岭猪F_2资源群体第40页
     ·实验群体的饲养管理与表型测定第40-41页
   ·DNA提取及全基因组60k芯片判型第41页
   ·统计分析第41页
   ·位置候选基因搜寻第41-42页
 3 结果第42-56页
   ·乳头数表型值的统计结果第42-43页
   ·全基因组高通量SNP基因分型结果第43页
   ·乳头数QTL定位及候选基因搜寻结果第43-56页
     ·二花脸×通城猪资源群体第43-44页
     ·二花脸×荣昌猪资源群体第44页
     ·二花脸×巴马香猪资源群体第44页
     ·二花脸×沙子岭猪资源群体第44-56页
 4 讨论第56-62页
   ·影响猪乳头数的因素第56页
   ·猪两侧乳头数的对称性发育调控第56-57页
   ·本研究结果与前人报道的异同之处第57-60页
     ·前人已报道的乳头数QTL第57-58页
     ·本研究定位的乳头数QTL与前人报道的异同之处第58-60页
       ·总乳头数QTL定位结果异同点第58-59页
       ·左右侧乳头数QTL定位结果异同点第59-60页
   ·增加乳头数的有利等位基因来源第60页
   ·乳头数QTL遗传结构的复杂性第60页
   ·影响猪乳头数的位置候选基因第60-62页
 5 小结第62-63页
第三章 利用全基因组高通量SNP标记定位45日龄仔猪断奶体重QTL第63-76页
 1 引言第63-64页
 2 材料与方法第64-66页
   ·实验群体构建与表型测定第64-65页
     ·实验群体的构建第64页
       ·二花脸猪×通城猪F_2资源群体第64页
       ·二花脸猪×荣昌猪F_2资源群体第64页
       ·二花脸猪×巴马香猪F_2资源群体第64页
       ·二花脸猪×沙子岭猪F_2资源群体第64页
     ·实验群体的管理与断奶体重表型测定第64-65页
   ·DNA提取及全基因组60k芯片判型第65页
   ·统计分析第65页
   ·位置候选基因搜寻第65-66页
 3 结果第66-71页
   ·仔猪45日龄断奶个体体重表型值统计结果第66页
   ·全基因组高通量SNP基因分型结果第66页
   ·仔猪45日龄断奶体重QTL定位及候选基因搜寻结果第66-71页
     ·二花脸×通城猪F_2资源群体第67页
     ·二花脸×荣昌猪F_2资源群体第67页
     ·二花脸×巴马香猪F_2资源群体第67页
     ·二花脸×沙子龄猪F_2资源群体第67-71页
 4 讨论第71-74页
   ·研究群体和标记密度对仔猪断奶体重QTL定位结果的影响第71页
   ·本研究的仔猪断奶体重QTL定位结果与前人报道结果的比较第71-72页
     ·已报道的仔猪断奶体重QTL结果第71-72页
     ·本研究仔猪断奶体重QTL定位结果及与前人报道的异同之处第72页
   ·影响仔猪断奶体重的位置候选基因及其功能第72-74页
   ·仔猪断奶体重和乳头数QTL定位结果比较第74页
 5 小结第74-76页
参考文献第76-91页
附录 作者简历及博士学习期间科研工作第91-92页
致谢第92页

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