基于代谢路径的生物网络比对算法
摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第一章 绪论 | 第7-13页 |
·生物信息学背景 | 第7-8页 |
·研究的目的及意义 | 第8-11页 |
·国内外研究现状 | 第11-12页 |
·论文章节安排 | 第12-13页 |
第二章 生物网络及相关问题 | 第13-27页 |
·生物网络介绍 | 第13-18页 |
·蛋白质交互作用网络(PPI) | 第13-15页 |
·基因调控网络 | 第15-16页 |
·代谢网络 | 第16-18页 |
·生物网络比对问题 | 第18-20页 |
·生物网络比对方法的分类 | 第20-22页 |
·比对模式 | 第20-21页 |
·集成模式 | 第21-22页 |
·查询模式 | 第22页 |
·常用比对算法研究与分析 | 第22-27页 |
·NetworkBLAST方法 | 第22-23页 |
·CAPPI方法 | 第23页 |
·NetAlign方法 | 第23-25页 |
·其它比对方法 | 第25-27页 |
第三章 基于代谢网络的比对算法 | 第27-37页 |
·相关理论与模型 | 第27-32页 |
·图相关的问题 | 第27-29页 |
·比对模型的建立 | 第29-31页 |
·相似度值计算 | 第31-32页 |
·算法设计 | 第32-37页 |
·部分嵌入和扩展 | 第33-34页 |
·算法基本思想 | 第34页 |
·算法流程 | 第34-37页 |
第四章 实验结果与分析 | 第37-43页 |
·实验数据介绍 | 第37-38页 |
·KEGG介绍 | 第37-38页 |
·PATHWAY等相关信息介绍 | 第38页 |
·实验结论以及相关讨论 | 第38-43页 |
第五章 总结与展望 | 第43-45页 |
致谢 | 第45-47页 |
参考文献 | 第47-51页 |
研究成果 | 第51页 |