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杂交鹅掌楸体细胞胚胎发生标志基因克隆及表达分析

致谢第1-4页
摘要第4-5页
Abstract第5-14页
第一章 植物体细胞胚胎发生分子机理研究概述第14-38页
 引言第14页
 1 诱导植物体细胞胚发生的影响因素第14-18页
   ·基因型和外植体生理状态是限制因素第14页
   ·内源激素平衡是诱导体胚发生的关键第14-16页
   ·逆境胁迫反应能够诱导体细胞胚发生第16-17页
   ·条件培养基提高体胚发生的诱导频率第17页
   ·氮源及其他培养基附加物的促进作用第17-18页
 2 胚性愈伤组织的长期保持的研究第18页
 3 次生胚、畸形胚和再生植株的研究第18-20页
 4 基因表达调控在体胚发生中的作用第20-29页
   ·胡萝卜胚性组织中分离到的基因第20-22页
     ·SERK 基因的功能及其表达调控第20-21页
     ·BM 基因(BABY BOOM)第21-22页
     ·AGL15 基因(AGAMOUS‐LIKE15)第22页
   ·从拟南芥合子胚突变体分离到的基因第22-24页
     ·LEAFY COTYLEDON1 基因 (LEC1)第22-23页
     ·LEC2 基因和FUS3 基因第23-24页
     ·胚性基因的顺式作用元件1(CEE1)第24页
   ·拟南芥胚后发育突变体中分离的基因第24-26页
     ·WUS 基因和CLV 基因第24-25页
     ·PKL 基因第25-26页
     ·PT 基因和AMP1 基因第26页
   ·其他与植物体细胞胚胎发生相关的基因第26-28页
     ·LEA 基因和ECP40 基因第26-27页
     ·ABI3 基因对LEA 基因的调控第27-28页
     ·HSPs 基因第28页
     ·GRP23 基因第28页
     ·ATML1 基因第28页
   ·体细胞胚发生中的表观遗传学现象第28-29页
 5 体细胞胚发生中的细胞生物学研究第29-32页
   ·从体细胞到体胚发生感受态细胞第29-30页
   ·能标记胚性细胞的生物化学特征第30-31页
   ·胚性细胞的极性建立和生理隔离第31-32页
   ·生长素极性运输和分生组织形成第32页
 6 胚性细胞形成中复杂的信号转导途径第32-36页
   ·质外体是决定体胚发生的重要信号源第32-34页
   ·内源激素信号途径对体细胞胚发生的作用第34-35页
     ·胚胎发育中内源IAA 是的变化是有规律的第34页
     ·ABA 介导植物中环境胁迫的应答反应第34页
     ·GA 信号途径对种子萌发和体胚形成的作用第34-35页
   ·胁迫反应促进体细胞胚发生的分子机理第35页
   ·钙调素等相关的第二信使的变化规律第35-36页
 7 悬浮培养与体细胞胚发生同步化调控第36-37页
 8 体细胞胚发生在农林业中的应用价值第37-38页
第二章 杂交鹅掌楸胚胎发育相关 LEC1-like 基因的克隆及表达分析第38-63页
 1 材料与方法第38-52页
   ·材料第38-40页
   ·RNA 提取方法以及cDNA 的合成第40-42页
     ·杂交鹅掌楸的RNA 的提取方法第40页
     ·对提取的RNA 质量的检测第40页
     ·使用DNaseI 处理以除去DNA 杂质第40-41页
     ·cDNA 第一链的合成第41-42页
   ·引物设计与目的基因特异性片段的获得第42-43页
   ·回收目的基因的片段以及单克隆测序第43-44页
     ·切胶回收、纯化DNA第43页
     ·pGE-T-easy 载体连接第43页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第43-44页
     ·质粒转化大肠杆菌第44页
     ·筛选阳性克隆的菌株第44页
     ·单克隆测序以及峰值分析第44页
   ·利用 RACE 技术获得基因片段的侧翼序列第44-48页
     ·采用3’RACE 技术获得基因下游序列第44-45页
     ·采用5’RACE 技术获得基因上游序列第45-48页
   ·序列拼接以及LhL1L 基因全长ORF 的获得第48-49页
   ·目的基因1301 表达载体的构建第49-51页
   ·对 LhL1L 基因的序列比对和进化树分析第51页
   ·利用 RT-PCR 技术半定量分析 LhL1L 差异表达第51-52页
   ·利用 LhL1L 转基因烟草体系的建立第52页
     ·农杆菌EHA105 感受态的制备第52页
     ·表达载体向农杆菌感受态细胞的转化第52页
     ·EHA105 农杆菌阳性克隆的鉴定第52页
 2 结果与分析第52-59页
   ·总 RNA 的提取以及cDNA 第一链的合成第52-53页
   ·采用 RACE 技术得到 LhL1L 基因的全长第53-54页
   ·对 LhL1L 基因的序列分析和功能预测第54-56页
     ·LhL1L 基因的核苷酸和蛋白质结构特征第54-55页
     ·LhL1L 在 B 结构上更相似于 L1L 基因第55-56页
   ·对 LhL1L 基因的进化树分析第56-57页
   ·半定量分析 LhL1L 在不同器官中的表达特性第57-59页
   ·对 Lh-L1L 基因的 1301 表达载体的构建第59页
 3 讨论第59-63页
   ·对 LhL1L 基因全长的克隆以及半定量差异表达分析第59-60页
   ·LhL1L 的诱导表达作为EC 中体细胞胚胎发生的标记第60-61页
   ·LEC1-Like 基因标记不同营养器官中的预决定胚性细胞第61-63页
第三章 杂交鹅掌楸 FUSCA3 基因的分离克隆及其表达分析第63-74页
 1 材料与方法第63-68页
   ·材料第63-64页
   ·LhFUS3 基因全长的获得第64页
   ·LhFUS3 的序列比对和进化树分析第64页
   ·LhFUS3 基因表达载体构建第64页
   ·LhFUS3 基因的表达分析第64页
   ·LhFUS3 基因全长探针的制备第64-65页
     ·对含有全长 LhFUS3 的 pGEM-T 载体线性化第65页
     ·体外转录反应制备地高辛标记的RNA 探针第65页
   ·杂交鹅掌楸胚性愈伤组织切片的制备第65-66页
     ·切片样品的制备第65-66页
     ·切片操作方法第66页
   ·LhFUS3 基因内含子的克隆第66-68页
     ·杂交鹅掌楸DNA 的提取方法以及检测第66-67页
     ·使用长片段PCR 法扩增LhFUS3 基因内含子第67-68页
 2 结果与分析第68-72页
   ·LhFUS3 基因全长的获得及结构分析第68-69页
   ·LhFUS3 的序列比对和进化树分析第69-71页
   ·LhFUS3 基因的差异表达分析第71-72页
 3 讨论第72-74页
   ·LhFUS3 基因的表达调控具有胚胎发育特征性第72-73页
   ·LhFUS3 的表达调控受到生长激素2,4‐D 的诱导第73-74页
第四章 杂交鹅掌楸 WUS-LIKE 的克隆及其对细胞多潜能性的作用第74-87页
 1 LhWOX1 的克隆、表达分析及载体构建第75-80页
   ·材料与方法第75-76页
     ·材料第75页
     ·LhWOX1 兼并引物设计和目的基因获得第75-76页
     ·LhWOX1 的序列比对和结构分析第76页
     ·LhWOX1 在不同营养器官中的表达分析第76页
   ·结果与分析第76-79页
     ·LhWOX1 基因的目的片段扩增第76-78页
     ·LhWOX1 基因在不同营养器官中的表达分析第78-79页
   ·讨论第79-80页
     ·高GC 含量的LhWOX1 基因克隆的技术路线第79页
     ·LhWOX1 与 LhL1L 在标记幼嫩器官中的协同作用第79-80页
 2 杂交鹅掌楸LhWOX4 的克隆、表达分析和载体构建第80-87页
   ·材料与方法第80-82页
     ·材料第80页
     ·LhWOX4 兼并引物设计和目的基因获得第80-81页
     ·LhWOX4 的表达载体的构建第81页
     ·LhWOX1 和LhWOX4 的序列比对和进化树分析第81页
     ·LhWOX4 基因的差异表达分析第81-82页
   ·结果与分析第82-86页
     ·LhWOX4 基因全长的获得和结构分析第82-83页
     ·LhWOX4 基因的序列比对和进化树分析第83-85页
     ·LhWOX4 基因在不同器官中的表达分析第85-86页
   ·讨论第86-87页
第五章 杂交鹅掌楸 KNOTTED1-LIKE 的克隆及其维持细胞未分化的 功能第87-101页
 1 LhKN1 基因的分离克隆以及表达分析第88-94页
   ·材料与方法第88-89页
     ·材料第88页
     ·LhKN1 兼并引物设计和目的基因获得第88页
     ·LhKN1 的基因表达分析第88-89页
   ·结果与分析第89-93页
     ·LhKN1 基因全长及其预测产物的结构分析第89-91页
     ·LhKN1 基因的序列比对和进化树构建第91-93页
     ·LhKN1 基因的表达分析第93页
   ·讨论第93-94页
 2 LhKN2 基因的克隆、载体构建以及表达分析第94-101页
   ·材料与方法第94-95页
     ·材料第94页
     ·LhKN2 兼并引物设计和目的基因获得第94页
     ·LhKN1 和 LhKN2 的序列比对和进化树分析第94-95页
     ·LhKN2 的1301 表达载体的构建第95页
     ·LhKN2 的基因表达分析第95页
   ·结果与分析第95-99页
     ·LhKN2 基因全长的获得及结构分析第95页
     ·LhKN2 基因的序列比对和进化树分析第95-98页
     ·LhKN2 基因的表达分析第98-99页
     ·LhKN1 和 LhKN2 基因的载体构建第99页
   ·讨论第99-101页
     ·LhKN2 与 LhKN1 在调控营养器官发育中的不同作用第99-100页
     ·LhKN2 基因在胚性愈伤组织中被相对地抑制表达第100页
     ·LhKN2 与 LhKN1 可以标记不同类型的未分化细胞第100-101页
第六章 杂交鹅掌楸 SERK 基因的克隆及其对胚性感受态细胞的意义第101-117页
 1 杂交鹅掌楸 LhSERK1 的克隆和表达分析第102-110页
   ·材料与方法第102-103页
     ·材料第102页
     ·LhSERK1 兼并引物的设计和基因全长的获得第102-103页
     ·LhSERK1 基因的序列比对第103页
     ·LhSERK1 基因表达的半定量分析第103页
   ·结果与分析第103-109页
     ·LhSERK1 基因全长的获得和结构域分析第103-104页
     ·LhSERK1 基因的序列比对和进化树分析第104-109页
     ·LhSERK1 基因在不同营养器官中的表达分析第109页
   ·讨论第109-110页
 2 杂交鹅掌楸 LhSERK2 的克隆和表达分析第110-117页
   ·材料与方法第110-111页
     ·材料第110页
     ·LhSERK2 基因全长的获得第110-111页
     ·LhSERK2 基因的序列比对和进化树分析第111页
     ·LhSERK2 基因表达的半定量分析第111页
   ·结果与分析第111-115页
     ·LhSERK2 基因全长的分离克隆第111-112页
     ·LhSERK2 基因的序列比对和进化树分析第112-113页
     ·LhSERK1 基因和 LhSERK2 基因的进化树分析第113-115页
     ·LhSERK2 基因的表达分析第115页
   ·讨论第115-117页
     ·在高度保守区域设计引物以获得新的基因成员第115-116页
     ·LhSERK2 在体细胞再生植株的早期事件中起作用第116-117页
第七章 杂交鹅掌楸的 FERONIA 基因的分离克隆与表达分析第117-124页
 1 材料与方法第117-118页
   ·材料第117-118页
   ·LhFER1 兼并引物的设计和基因片段的获得第118页
   ·LhFER1 和LhFER2 基因的蛋白质预测和序列比对第118页
   ·LhFER1 基因的表达分析第118页
 2 结果与分析第118-122页
   ·LhFER1 基因的分离克隆以及 LhFER2 基因的鉴别第118-119页
   ·LhFER1 和 LhFER2 基因的序列比对第119-122页
   ·LhFER1 基因的差异表达分析第122页
 3 讨论第122-124页
   ·聚合酶链式反应造成的基因内部片段缺失第122页
   ·LhFER1 对体细胞向受精卵方向转分化中的作用第122-124页
第八章 杂交鹅掌楸的泛素途径相关基因、以及扩展蛋白基因的克隆第124-131页
 1 LhUBI 基因的克隆和结构域分析第125-128页
   ·材料与方法第125页
     ·材料第125页
     ·LhUBI1 基因的克隆以及 LhUBQ2-5 基因的获得第125页
     ·LhUBI1-5 基因的序列比对和结构域分析第125页
   ·结果与分析第125-127页
     ·LhUBI1-5 基因的克隆及重复结构分析第125-126页
     ·LhUBI 蛋白与其他泛素蛋白的序列比对分析第126-127页
   ·讨论第127-128页
 2 LhEXP1 基因的克隆第128-131页
   ·材料与方法第128-129页
     ·材料第128页
     ·LhEXP1 基因的分离克隆以及序列比对第128-129页
   ·结果与分析第129页
   ·讨论第129-131页
第九章 主要结论和展望第131-141页
 1 主要结论第131-138页
   ·LhLEC1-LIKE 基因的分离克隆与叶柄中的预决定胚性细胞第131-132页
   ·LhFUS3 基因的分离克隆及其对胚性细胞的标记作用第132页
   ·杂交鹅掌楸同源异形框基因 LhWOX1、 LhWOX4、LhKN1 和 LhKN2 对不同营养器官和愈伤组织中的多潜能细胞的标记作用第132-133页
   ·LhSERK1 和 LhSERK2 基因的分离克隆及其表达分析第133-134页
   ·杂交鹅掌楸 LhFER 基因、UBI 基因和 EXP 基因的分离克隆第134-135页
   ·讨论第135-138页
 2 存在的问题第138-139页
   ·相对定量 PCR 对基因表达分析中存在误差第138页
   ·对基因表达分析没有定位到组织细胞水平第138页
   ·缺乏基因功能验证和蛋白质组学上的分析第138-139页
 3 展望第139-141页
   ·使用 LhL1L 和LhFUS3 基因标记出愈伤组织内部胚性细胞团第139页
   ·使用 LhL1L、LhWOX1 和LhKN1 基因标记不同分化类型的体细胞第139-140页
   ·分析 LhSERK 和 LhFER 基因在特定环境下与胚性形成的相关性第140页
   ·继续未完成的转基因拟南芥和烟草的功能验证试验第140-141页
附录第141-143页
参考文献第143-154页
详细摘要第154-158页

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