杏主要经济性状遗传分析及仁甜苦相关基因初步定位
| 摘要 | 第10-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 缩略词 | 第13-14页 |
| 1 前言 | 第14-20页 |
| 1.1 主要经济性状遗传研究 | 第14-17页 |
| 1.1.1 物候期遗传 | 第14页 |
| 1.1.2 果实单果重遗传 | 第14-15页 |
| 1.1.3 果实肉质遗传 | 第15页 |
| 1.1.4 果实硬度遗传 | 第15页 |
| 1.1.5 可溶性固形物遗传 | 第15-16页 |
| 1.1.6 果实香气遗传 | 第16页 |
| 1.1.7 粘离核遗传 | 第16页 |
| 1.1.8 果实内质遗传 | 第16-17页 |
| 1.1.9 丰产性遗传 | 第17页 |
| 1.1.10 仁甜苦遗传 | 第17页 |
| 1.2 仁甜苦相关基因分子标记的研究 | 第17-18页 |
| 1.2.1 仁甜苦合成代谢机制 | 第17页 |
| 1.2.2 仁甜苦有关分子标记 | 第17-18页 |
| 1.3 BSA在功能基因定位上的研究 | 第18页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第18-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-24页 |
| 2.1 试验材料 | 第20页 |
| 2.1.1 试验试材 | 第20页 |
| 2.1.2 试验仪器 | 第20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-24页 |
| 2.2.1 杏主要经济性状调查 | 第20页 |
| 2.2.2 果实内质评价指标 | 第20-21页 |
| 2.2.3 丰产性指标 | 第21页 |
| 2.2.4 BSA测序 | 第21-22页 |
| 2.2.4.1 田间取样 | 第21-22页 |
| 2.2.4.2 DNA提取检查 | 第22页 |
| 2.2.4.3 DNA混合池测序 | 第22页 |
| 2.2.4.4 低质量数据过滤 | 第22页 |
| 2.2.4.5 参考梅基因组信息 | 第22页 |
| 2.2.5 数据统计和分析 | 第22-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-37页 |
| 3.1 杏主要经济性状遗传分析 | 第24-31页 |
| 3.1.1 杏杂交后代物候期遗传分析 | 第24-26页 |
| 3.1.2 杏杂交后代果实单果重遗传分析 | 第26页 |
| 3.1.3 杏杂交后代果实肉质遗传分析 | 第26-27页 |
| 3.1.4 杏杂交后代果实硬度遗传分析 | 第27-28页 |
| 3.1.5 杏杂交后代可溶性固形物含量遗传分析 | 第28页 |
| 3.1.6 杏杂交后代果实香气遗传分析 | 第28页 |
| 3.1.7 杏杂交后代粘离核遗传分析 | 第28-29页 |
| 3.1.8 杏杂交后代果实内质遗传分析 | 第29-30页 |
| 3.1.9 杏杂交后代丰产性遗传分析 | 第30页 |
| 3.1.10 杏杂交后代仁甜苦遗传分析 | 第30-31页 |
| 3.2 杏仁甜苦相关基因的初步定位 | 第31-37页 |
| 3.2.1 测序数据统计 | 第31页 |
| 3.2.2 与梅基因组比对 | 第31-32页 |
| 3.2.3 数据质控 | 第32-34页 |
| 3.2.3.1 碱基类型分布 | 第32页 |
| 3.2.3.2 插入片段分布 | 第32-33页 |
| 3.2.3.3 覆盖深度和覆盖比率统计 | 第33页 |
| 3.2.3.4 覆盖深度分布 | 第33-34页 |
| 3.2.3.5 SNP检测 | 第34页 |
| 3.2.3.6 高质量SNP筛选 | 第34页 |
| 3.2.4 ED方法关联分析结果 | 第34-35页 |
| 3.2.5 InDel-index方法关联结果 | 第35-36页 |
| 3.2.6 候选区域筛选 | 第36-37页 |
| 4 讨论 | 第37-41页 |
| 4.1 杏主要经济性状遗传趋势及亲本选择策略 | 第37-39页 |
| 4.1.1 杏花期和果实成熟期的遗传趋势 | 第37页 |
| 4.1.2 杏丰产性的遗传趋势 | 第37-38页 |
| 4.1.3 杏果实品质遗传趋势 | 第38-39页 |
| 4.2 杏仁甜苦相关基因的初步定位 | 第39-41页 |
| 5 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-50页 |
| 附录 | 第50-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
