| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·信息论的建立与意义 | 第10-11页 |
| ·信息论研究的最新动态 | 第11-13页 |
| ·与本文研究有关的问题 | 第13-16页 |
| 第二章 信息散度的一些研究 | 第16-32页 |
| ·常见的信息散度 | 第16-18页 |
| ·信息散度与度量 | 第18-20页 |
| ·一类由概率分布生成的新度量 | 第20-29页 |
| ·函数L_λ(p,q)的性质 | 第20-25页 |
| ·函数D_λ(P,Q)成为度量的讨论 | 第25-28页 |
| ·D_λ(P,Q)的最值问题 | 第28-29页 |
| ·Jensen-Shannon散度的其他讨论 | 第29-32页 |
| 第三章 Alignment空间的概念 | 第32-50页 |
| ·引言 | 第32-34页 |
| ·F_q上的Alignment空间的相关定义 | 第34-37页 |
| ·Alignment距离的计算方法 | 第37-41页 |
| ·Needleman-Wunsch算法的基本步骤 | 第38-40页 |
| ·动态规划算法的讨论 | 第40-41页 |
| ·广义差错的Levenshtein距离以及与Alignment距离的关系 | 第41-46页 |
| ·广义差错的Levenshtein距离的定义 | 第41-43页 |
| ·最大得分比对序列的定义 | 第43-44页 |
| ·最小罚分比对序列与最大得分比对序列的关系 | 第44-46页 |
| ·Alignment空间中的一些简单性质 | 第46-50页 |
| 第四章 虚拟符号的数据结构理论与运算 | 第50-68页 |
| ·模结构理论 | 第50-57页 |
| ·序列扩张的模结构的定义 | 第50-53页 |
| ·模结构的运算 | 第53-55页 |
| ·比对序列的模结构分析 | 第55-56页 |
| ·模结构产生的运算子 | 第56-57页 |
| ·比对序列的虚拟符号运算 | 第57-68页 |
| ·虚拟符号运算子的定义 | 第57-59页 |
| ·比对序列之间的虚拟符号运算子 | 第59-63页 |
| ·序列虚拟符号的保距运算子和微调运算子 | 第63-68页 |
| 第五章 Alignment空间中的计数问题 | 第68-85页 |
| ·Alignment空间中计数的概念 | 第68-71页 |
| ·Alignment空间中计数问题的分类 | 第68-69页 |
| ·F_2上的n维Alignment子空间中的计数问题 | 第69-71页 |
| ·F_2上的n维Alignment子空间中Alignment距离为n的序列对 | 第71-75页 |
| ·F-2上的n维Alignment子空间中Alignment距离为2的序列对 | 第75-85页 |
| 第六章 由一般拓扑度量空间所产生的Alignment空间 | 第85-98页 |
| ·一般状态下的Alignment空间的概念 | 第85-87页 |
| ·Alignment距离与相关的一类Levenshtein距离的等价性 | 第87-90页 |
| ·模结构理论概述以及定理6.1的证明 | 第90-94页 |
| ·V~+中模结构的定义 | 第90-92页 |
| ·定理6.1的证明 | 第92-94页 |
| ·应用:蛋白质三维结构形态的比对问题 | 第94-98页 |
| 第七章 结束语 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 个人简历与科研成果 | 第110页 |
