| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-26页 |
| ·冠状病毒简介与分类 | 第10-13页 |
| ·冠状病毒转录复制机制的病毒学研究 | 第13-16页 |
| ·冠状病毒转录复制相关蛋白的研究 | 第16-23页 |
| ·已知功能的冠状病毒蛋白 | 第16-21页 |
| ·未知功能的冠状病毒蛋白 | 第21-23页 |
| ·本课题研究的方法和目的 | 第23-24页 |
| ·本论文的内容安排和主要贡献 | 第24-26页 |
| 第2章 SARS 冠状病毒非结构蛋白nsp7-nsp8 底物复合物的结构研究 | 第26-38页 |
| ·研究思路 | 第26-29页 |
| ·实验材料与方法 | 第29-35页 |
| ·蛋白质的克隆表达及纯化 | 第29-31页 |
| ·非结构蛋白nsp7-nsp8 目的晶体的获得 | 第31页 |
| ·非结构蛋白nsp7-nsp8 母体晶体的浸泡 | 第31-32页 |
| ·非结构蛋白nsp7-nsp8-GDP 晶体的数据收集与处理 | 第32-33页 |
| ·非结构蛋白nsp7-nsp8-GDP 结构的解析 | 第33-35页 |
| ·非结构蛋白nsp7-nsp8-GDP 复合物晶体的结构分析 | 第35-37页 |
| ·非结构蛋白nsp7-nsp8 底物进入通道的确定 | 第35-37页 |
| ·nsp7-nsp8-GDP 复合物结构的底物结合区 | 第37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第3章 非结构蛋白nsp7-nsp8 复合物的模板进入机制研究 | 第38-60页 |
| ·本章引论 | 第38页 |
| ·实验材料与方法 | 第38-49页 |
| ·非结构蛋白nsp8 的C 端结构域的指认与克隆 | 第38-40页 |
| ·nsp7,nsp8c 的表达与纯化 | 第40-42页 |
| ·引物酶活性测定 | 第42-43页 |
| ·SARS 冠状病毒nsp7-nsp8c 母体结晶、数据收集和结构解析 | 第43-46页 |
| ·DNA 浸泡/共晶数据收集与结构解析 | 第46-49页 |
| ·实验结果 | 第49-59页 |
| ·nsp8 的三种不同状态 | 第49-51页 |
| ·引物酶片段与模板类似物的精细相互作用 | 第51-53页 |
| ·全长引物酶结构中模板结合区域 | 第53-55页 |
| ·酶-模板相互作用关键氨基酸的突变试验 | 第55-58页 |
| ·引物酶的工作模型 | 第58-59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 第4章 人冠状病毒HCoV-HKU1 非结构蛋白nsp5 的研究 | 第60-80页 |
| ·人冠状病毒HCoV-HKU1 非结构蛋白nsp5 的纯化,表达与结晶 | 第60-64页 |
| ·HCoV-HKU1 nsp5 的克隆构建 | 第60页 |
| ·HCoV-HKU1 冠状病毒主蛋白酶的表达与纯化 | 第60-63页 |
| ·HCoV-HKU1 nsp5 的活性分析 | 第63页 |
| ·HCoV-HKU1 nsp5 的晶体筛选与优化 | 第63-64页 |
| ·人冠状病毒HCoV-HKU1 非结构蛋白nsp5 的结构解析 | 第64-68页 |
| ·人冠状病毒HCoV-HKU1 nsp5 复合物晶体数据收集 | 第64页 |
| ·人冠状病毒HCoV-HKU1 nsp5 复合物晶体的数据处理 | 第64-66页 |
| ·人冠状病毒HCoV-HKU1 nsp5 复合物结构解析和模型搭建 | 第66-68页 |
| ·人冠状病毒HCoV-HKU1 非结构蛋白nsp5 的结构分析 | 第68-79页 |
| ·整体结构与聚合形式 | 第68-72页 |
| ·底物结合位点与推测的反应机理 | 第72-73页 |
| ·P1、P2 底物位点结合口袋的比较分析 | 第73-77页 |
| ·底物P3 位点的讨论与优化 | 第77-79页 |
| ·总结 | 第79-80页 |
| 第5章 结 论 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第94页 |
