生物信息学中序列比对方法的研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 引言 | 第9-15页 |
| ·研究背景与意义 | 第9-12页 |
| ·生物信息学 | 第9-11页 |
| ·序列比对的研究意义 | 第11-12页 |
| ·研究现状及算法问题 | 第12-14页 |
| ·研究现状 | 第12-13页 |
| ·算法问题 | 第13-14页 |
| ·文章结构与内容安排 | 第14-15页 |
| 2 生物序列比对基础 | 第15-29页 |
| ·生物基础知识 | 第15-18页 |
| ·序列比对的分类数学描述 | 第18-20页 |
| ·双序列比对 | 第18-19页 |
| ·多序列比对 | 第19-20页 |
| ·序列比对的相关概念 | 第20-29页 |
| ·空位罚分概念及策略 | 第20-21页 |
| ·相似替换矩阵 | 第21-25页 |
| ·目标函数 | 第25-27页 |
| ·多序列比对结果的评判标准 | 第27-29页 |
| 3 生物序列比对算法 | 第29-36页 |
| ·双序列比对算法 | 第29-32页 |
| ·双序列比对的点阵图法 | 第29-30页 |
| ·动态规划算法 | 第30-32页 |
| ·多序列比对算法 | 第32-36页 |
| ·渐近比对算法 | 第32-34页 |
| ·迭代算法 | 第34-36页 |
| 4 免疫遗传算法原理 | 第36-43页 |
| ·遗传算法及其缺陷 | 第36-39页 |
| ·遗传算法原理及流程 | 第36-37页 |
| ·遗传算法基本要素 | 第37-39页 |
| ·基本遗传算法的缺陷 | 第39页 |
| ·免疫遗传算法的原理及方法 | 第39-43页 |
| ·生物免疫学基本原理 | 第39-40页 |
| ·免疫系统特点及对改进遗传算法的启示 | 第40-41页 |
| ·免疫遗传算法 | 第41-43页 |
| 5 改进免疫遗传算法的序列比对算法的分析设计 | 第43-52页 |
| ·改进免疫遗传序列比对算法的设计 | 第43-47页 |
| ·编码设计 | 第43-44页 |
| ·初始群体的产生 | 第44页 |
| ·抗体适应度计算与免疫选择 | 第44-46页 |
| ·遗传算子设计 | 第46页 |
| ·记忆库的设计及算法终止准则 | 第46-47页 |
| ·算法的实现 | 第47-52页 |
| ·测试环境与用例 | 第47页 |
| ·相关参数设置 | 第47-49页 |
| ·实验结果及分析 | 第49-52页 |
| 6 总结与展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-55页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第55-56页 |
| 作者简历 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
