| 摘要 | 第9-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 缩略语 | 第16-17页 |
| 绪论 | 第17-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-38页 |
| 1.1 刀鲚研究进展 | 第19-22页 |
| 1.1.1 刀鲚生物学研究 | 第19-21页 |
| 1.1.1.1 刀鲚形态分类学研究 | 第19-20页 |
| 1.1.1.2 刀鲚同工酶分类学研究 | 第20页 |
| 1.1.1.3 刀鲚DNA分子水平分类学研究 | 第20-21页 |
| 1.1.2 刀鲚繁养殖研究 | 第21页 |
| 1.1.3 刀鲚应激研究 | 第21-22页 |
| 1.1.4 刀鲚洄游机理研究 | 第22页 |
| 1.2 环境因子对主要洄游性鱼类影响的研究进展 | 第22-26页 |
| 1.2.1 洄游以及洄游性鱼类 | 第22-23页 |
| 1.2.2 盐度对主要洄游性鱼类的影响研究 | 第23-24页 |
| 1.2.2.1 盐度对鲑鱼的影响研究 | 第23-24页 |
| 1.2.2.2 盐度对鲟鱼的影响研究 | 第24页 |
| 1.2.3 低温对主要洄游性鱼类的影响研究 | 第24-25页 |
| 1.2.3.1 低温对鲑鱼的影响研究 | 第24-25页 |
| 1.2.3.2 低温对鲟鱼的影响研究 | 第25页 |
| 1.2.4 饥饿对主要洄游性鱼类的影响研究 | 第25-26页 |
| 1.2.4.1 饥饿对鲑鱼的影响研究 | 第25页 |
| 1.2.4.2 饥饿对鲟鱼的影响研究 | 第25-26页 |
| 1.3 水产动物抗环境因子变化的关键调控基因研究 | 第26-30页 |
| 1.3.1 核因子相关因子2的相关研究 | 第26-27页 |
| 1.3.1.1 核因子相关因子2的概念及作用机理 | 第26-27页 |
| 1.3.1.2 核因子相关因子2在哺乳动物及水产动物上的相关研究 | 第27页 |
| 1.3.2 渗透调节蛋白水通道蛋白的研究进展 | 第27-28页 |
| 1.3.2.1 水通道蛋白的概念及作用机理 | 第27-28页 |
| 1.3.2.2 水通道蛋白在人、植物、水产动物上开展的研究 | 第28页 |
| 1.3.3 水产动物脂蛋白酯酶的相关研究 | 第28-29页 |
| 1.3.4 水产动物磷酸烯醇式丙酮酸羧基酶的相关研究 | 第29-30页 |
| 1.4 高通量测序技术在主要洄游性鱼类研究中的应用 | 第30-36页 |
| 1.4.1 转录组概念 | 第31页 |
| 1.4.2 Illumina测序原理及工作流程 | 第31-32页 |
| 1.4.3 Illumina测序技术中生物信息分析相关数据库概念 | 第32页 |
| 1.4.4 高通量测序技术在主要洄游性鱼类研究中的应用 | 第32-36页 |
| 1.4.4.1 高通量测序技术在鲑鱼研究中的应用 | 第33-34页 |
| 1.4.4.2 高通量测序技术在鲟鱼研究中的应用 | 第34-35页 |
| 1.4.4.3 高通量测序技术在刀鲚研究中的应用 | 第35-36页 |
| 1.5 本论文的研究内容、技术路线、目的与意义 | 第36-38页 |
| 1.5.1 本论文的研究内容 | 第36页 |
| 1.5.2 本论文的目的与意义 | 第36-37页 |
| 1.5.3 本研究的技术路线 | 第37-38页 |
| 第二章 刀鲚幼鱼对降温升盐协同作用响应的脑组织转录组分析 | 第38-52页 |
| 引言 | 第38页 |
| 2.1 材料与方法 | 第38-40页 |
| 2.1.1 实验鱼饲养管理 | 第38页 |
| 2.1.2 实验设计与样品采集 | 第38-39页 |
| 2.1.3 RNA的提取与检测、cDNA文库构建、测序及转录本装配 | 第39页 |
| 2.1.4 基因功能注释 | 第39页 |
| 2.1.5 差异基因的富集分析 | 第39-40页 |
| 2.1.6 差异表达基因的荧光定量PCR验证 | 第40页 |
| 2.2 结果 | 第40-48页 |
| 2.2.1 转录组测序及从头装配 | 第40-41页 |
| 2.2.2 基因KOG注释 | 第41-42页 |
| 2.2.3 差异表达基因的聚类分析 | 第42页 |
| 2.2.4 差异表达基因的GO富集分析 | 第42-43页 |
| 2.2.5 差异表达基因的KEGG富集分析 | 第43-44页 |
| 2.2.6 差异表达基因分析 | 第44-47页 |
| 2.2.7 荧光定量PCR验证 | 第47-48页 |
| 2.3 讨论 | 第48-51页 |
| 2.3.1 降温升盐协同作用下刀鲚脑组织的信号转导调节 | 第48-49页 |
| 2.3.2 降温升盐协同作用下刀鲚脑组织的渗透调节 | 第49页 |
| 2.3.3 降温升盐协同作用下刀鲚脑组织的抗应激应答 | 第49-51页 |
| 2.4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第三章 刀鲚幼鱼对饥饿响应的肝组织转录组分析 | 第52-66页 |
| 引言 | 第52页 |
| 3.1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 3.1.1 实验鱼饲养管理 | 第52页 |
| 3.1.2 实验设计与组织采集 | 第52-53页 |
| 3.1.3 RNA的提取与检测、cDNA文库构建、测序及转录本装配 | 第53页 |
| 3.1.4 基因功能注释 | 第53页 |
| 3.1.5 差异基因的富集分析 | 第53-54页 |
| 3.1.6 差异表达基因的荧光定量PCR验证 | 第54页 |
| 3.2 结果 | 第54-62页 |
| 3.2.1 转录组测序及从头装配 | 第54-55页 |
| 3.2.2 基因GO注释 | 第55页 |
| 3.2.3 差异表达基因的聚类分析 | 第55-56页 |
| 3.2.4 差异表达基因的GO富集分析 | 第56-57页 |
| 3.2.5 差异表达基因的KEGG富集分析 | 第57-58页 |
| 3.2.6 差异表达基因分析 | 第58-61页 |
| 3.2.7 荧光定量PCR验证 | 第61-62页 |
| 3.3 讨论 | 第62-64页 |
| 3.3.1 饥饿作用下刀鲚肝组织差异表达基因的KEGG富集分析 | 第62-63页 |
| 3.3.2 饥饿作用下刀鲚肝组织中差异表达基因分析 | 第63-64页 |
| 3.3.2.1 免疫应答相关基因 | 第63页 |
| 3.3.2.2 能源物质代谢相关基因 | 第63-64页 |
| 3.4 本章小结 | 第64-66页 |
| 第四章 刀鲚核因子相关因子2的分子克隆及不同环境因子作用下的表达研究 | 第66-81页 |
| 引言 | 第66页 |
| 4.1 材料与方法 | 第66-70页 |
| 4.1.1 实验鱼 | 第66页 |
| 4.1.2 盐度实验 | 第66-67页 |
| 4.1.3 降温实验 | 第67页 |
| 4.1.4 总RNA的提取和Nrf2基因中间序列的获得 | 第67页 |
| 4.1.5 刀鲚Nrf2基因5'、3'RACE扩增试验 | 第67-68页 |
| 4.1.6 Nrf2核酸及推导的氨基酸序列分析 | 第68页 |
| 4.1.7 刀鲚Nrf2基因的组织表达分析 | 第68-70页 |
| 4.1.7.1 刀鲚Nrf2基因在各组织中的表达分析 | 第68-69页 |
| 4.1.7.2 刀鲚Nrf2基因在盐度作用下的组织表达分析 | 第69页 |
| 4.1.7.3 刀鲚Nrf2基因在降温作用下的组织表达分析 | 第69-70页 |
| 4.2 结果 | 第70-79页 |
| 4.2.1 刀鲚Nrf2的序列及结构分析 | 第70页 |
| 4.2.2 刀鲚Nrf2的系统进化分析 | 第70-75页 |
| 4.2.3 刀鲚Nrf2基因在不同组织中的表达分析 | 第75-76页 |
| 4.2.4 刀鲚Nrf2基因在盐度作用下的组织表达分析 | 第76-78页 |
| 4.2.5 刀鲚Nrf2基因在降温作用下的组织表达分析 | 第78-79页 |
| 4.3 讨论 | 第79-80页 |
| 4.3.1 刀鲚Nrf2的进化分析 | 第79页 |
| 4.3.2 刀鲚Nrf2的组织差异表达分析 | 第79-80页 |
| 4.4 小结 | 第80-81页 |
| 第五章 刀鲚水通道蛋白1的分子克隆及不同环境因子作用下的表达分析 | 第81-96页 |
| 引言 | 第81页 |
| 5.1 材料与方法 | 第81-85页 |
| 5.1.1 实验鱼 | 第81页 |
| 5.1.2 盐度实验 | 第81-82页 |
| 5.1.3 降温实验 | 第82页 |
| 5.1.4 总RNA的提取和AQP1基因中间序列的获得 | 第82页 |
| 5.1.5 刀鲚AQP1基因5'、3'RACE扩增实验 | 第82-83页 |
| 5.1.6 AQP1核酸及推导的氨基酸序列分析 | 第83-84页 |
| 5.1.7 刀鲚AQP1基因的组织表达分析 | 第84-85页 |
| 5.1.7.1 刀鲚AQP1基因在不同组织中的表达分析 | 第84页 |
| 5.1.7.2 刀鲚AQP1基因在盐度作用下的组织表达分析 | 第84页 |
| 5.1.7.3 刀鲚AQP1基因在降温作用下的组织表达分析 | 第84-85页 |
| 5.2 结果 | 第85-93页 |
| 5.2.1 刀鲚AQP1的序列及结构分析 | 第85页 |
| 5.2.2 刀鲚AQP1的同源性分析 | 第85-88页 |
| 5.2.3 刀鲚AQP1的系统进化分析 | 第88页 |
| 5.2.4 刀鲚AQP1基因在不同组织中的表达分析 | 第88-89页 |
| 5.2.5 刀鲚AQP1基因在盐度作用下的组织表达分析 | 第89-91页 |
| 5.2.6 刀鲚AQP1基因在降温作用下的组织表达分析 | 第91-93页 |
| 5.3 讨论 | 第93-95页 |
| 5.3.1 刀鲚AQP1的序列特征 | 第93页 |
| 5.3.2 刀鲚AQP1的进化分析 | 第93页 |
| 5.3.3 刀鲚AQP1的组织表达差异 | 第93-95页 |
| 5.4 本章小结 | 第95-96页 |
| 第六章 刀鲚脂蛋白酯酶和磷酸烯醇式丙酮酸羧基酶基因的分子克隆和表达研究 | 第96-119页 |
| 引言 | 第96页 |
| 6.1 材料与方法 | 第96-101页 |
| 6.1.1 实验鱼饲养管理 | 第96-97页 |
| 6.1.2 实验设计与组织采集 | 第97页 |
| 6.1.3 总RNA的提取和LPL基因中间序列的获得 | 第97页 |
| 6.1.4 刀鲚LPL基因5'、3'RACE扩增试验 | 第97-98页 |
| 6.1.5 总RNA的提取和PEPCK基因中间序列的获得 | 第98页 |
| 6.1.6 刀鲚PEPCK基因5'、3'RACE扩增试验验 | 第98页 |
| 6.1.7 LPL及PEPCK核酸及推导的氨基酸序列分析 | 第98-100页 |
| 6.1.8 刀鲚LPL基因的组织表达分析 | 第100页 |
| 6.1.8.1 刀鲚LPL基因在各组织中的表达分析 | 第100页 |
| 6.1.8.2 刀鲚LPL基因在饥饿作用下肝组织中的表达分析 | 第100页 |
| 6.1.9 刀鲚PEPCK基因的组织表达分析 | 第100-101页 |
| 6.1.9.1 刀鲚PEPCK基因在各组织中的表达分析 | 第100页 |
| 6.1.9.2 刀鲚PEPCK基因在饥饿作用下肝组织中的表达分析 | 第100-101页 |
| 6.1.10 刀鲚形态参数及血清指标的测定 | 第101页 |
| 6.2 结果 | 第101-115页 |
| 6.2.1 刀鲚LPL的序列及结构分析 | 第101页 |
| 6.2.2 刀鲚LPL的系统进化分析 | 第101-106页 |
| 6.2.3 刀鲚LPL的组织表达分析 | 第106-108页 |
| 6.2.3.1 刀鲚LPL基因的组织差异表达分析 | 第106页 |
| 6.2.3.2 饥饿作用下刀鲚肝组织中LPL基因的表达分析 | 第106-108页 |
| 6.2.4 刀鲚PEPCK的序列及结构分析 | 第108-112页 |
| 6.2.5 刀鲚PEPCK的系统进化分析 | 第112-113页 |
| 6.2.6 刀鲚PEPCK基因的组织表达分析 | 第113-114页 |
| 6.2.6.1 刀鲚PEPCK基因在各组织中的差异表达分析 | 第113页 |
| 6.2.6.2 饥饿作用下刀鲚肝组织中PEPCK基因的表达分析 | 第113-114页 |
| 6.2.7 饥饿对刀鲚形态指标及血清激素、免疫指标的影响 | 第114-115页 |
| 6.3 讨论 | 第115-117页 |
| 6.3.1 刀鲚LPL序列及结构的保守性及进化分析 | 第115-116页 |
| 6.3.2 饥饿作用下刀鲚LPL对鱼体的调控作用 | 第116页 |
| 6.3.3 刀鲚PEPCK的序列、结构及进化分析 | 第116页 |
| 6.3.4 饥饿作用下刀鲚PEPCK对鱼体的调控作用 | 第116-117页 |
| 6.3.5 饥饿作用对刀鲚形态、血清生化指标的影响 | 第117页 |
| 6.4 本章小结 | 第117-119页 |
| 全文结论 | 第119-120页 |
| 全文创新点 | 第120-121页 |
| 参考文献 | 第121-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第138页 |
| 攻读博士学位期间已获授权的专利 | 第138页 |
| 攻读博士学位期间参与的科研项目 | 第138页 |
| 攻读博士学位期间获得的奖励 | 第138-139页 |
| 攻读博士学位期间参与的学术活动 | 第139页 |
