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团头鲂高糖代谢microRNAs转录组分析及miR-34a对糖脂代谢的调控

摘要第10-13页
ABSTRACT第13-16页
绪论第17-21页
    1 本研究工作的实用价值与理论意义第17页
    2 研究背景及国内外文献综述第17-18页
    3 本论文所要解决的问题第18-19页
    本研究的技术路线图第19-21页
第一章 鱼类糖脂代谢稳态的调控第21-39页
    1 鱼类葡萄糖稳态的调控第21-26页
        1.1 鱼类的血糖稳态第21-24页
        1.2 日粮碳水化合物对葡萄糖代谢的调控第24-26页
    2 日粮中可消化糖对鱼类脂肪代谢的影响第26-31页
        2.1 鱼类营养代谢中糖脂代谢的相互关系第26页
        2.2 日粮中不同水平和来源可消化糖对鱼类脂代谢的影响第26-29页
        2.3 日粮中不同水平糖脂比例对鱼类生长和免疫的影响第29-31页
    3 MiRNA在糖代谢中的调控作用第31-34页
        3.2 MiRNA调节胰岛素的生成第31-32页
        3.3 MiRNA对胰岛素敏感性和胰岛素信号的调控第32-34页
        3.4 MiRNA与葡萄糖代谢和脂肪代谢第34页
    4 MiR-34a在糖脂代谢中的调控作用第34-39页
        4.1 SIRT1调控机体糖脂代谢稳态第34-37页
        4.2 miR-34a调控SIRT1研究进展第37-39页
第二章 团头鲂摄食高糖日粮不同组织miRNAs的表达谱分析第39-67页
    1 前言第39-40页
    2 材料与方法第40-44页
        2.1 试验材料第40-42页
        2.2 样品处理和分析第42-44页
    3 结果与分析第44-63页
        3.1 团头鲂miRNAs文库第44-50页
        3.2 已知miRNAs的鉴定和识别第50-52页
        3.3 新miRNAs(novel miRNAs)预测第52页
        3.4 DEMs的鉴定与识别第52-55页
        3.5 DEMs靶基因的预测第55页
        3.6 DEMs靶基因的功能分析第55-62页
        3.7 蛋白互作(PPI)分析第62-63页
    4 讨论第63-65页
    5 小结第65-67页
第三章 miR-34a的生物信息学分析第67-79页
    1前言第67-68页
    2 材料与方法第68-70页
        2.1 试验材料第68页
        2.2 试验方法第68-70页
    3 结果与讨论第70-78页
        3.1 MiR-34的位点和保守性分析第70-73页
        3.2 MiR-34靶基因预测第73页
        3.3 MiR-34靶基因GO富集分析第73-74页
        3.4 MiR-34靶基因KEGG通路富集分析第74-75页
        3.5 MiR-34和潜在调控基因在糖代谢中的功能分析第75-78页
    4 小结第78-79页
第四章 高糖日粮对团头鲂生长、肌肉品质和脂肪代谢的影响第79-93页
    1 前言第79页
    2 材料与方法第79-83页
        2.1 试验日粮第79-81页
        2.2 试验鱼第81页
        2.3 饲养管理第81页
        2.4 样品采集第81页
        2.5 测定方法第81-83页
        2.6 数据统计与分析第83页
    3 结果与分析第83-89页
        3.1 高糖日粮对团头鲂生长和肌肉品质的影响第84-87页
        3.2 高糖日粮对团头鲂血液和肝脏脂质代谢的影响第87-88页
        3.3 高糖日粮对团头鲂肝脏脂肪沉积和组织结构的影响第88-89页
    4 讨论第89-91页
        4.1 高糖日粮对团头鲂生长和肌肉品质的影响第89-90页
        4.2 高糖日粮对团头鲂血液和肝脏脂质代谢的影响第90-91页
        4.3 高糖日粮对团头鲂肝脏脂肪沉积和组织结构的影响第91页
    5 小结第91-93页
第五章 团头鲂SIRT1和FoxO1基因的全序列克隆和分析第93-109页
    1 前言第93-94页
    2 材料与方法第94-95页
        2.1 试验鱼第94页
        2.2 样品采集第94页
        2.3 肝脏RNA提取第94页
        2.4 团头鲂SIRT1和FoxO1 cDNAs克隆第94-95页
        2.5 序列的生物信息学分析第95页
        2.6 RT-PCR反应第95页
    3 结果与分析第95-106页
        3.1 团头鲂SIRT1和FoxO1基因分子克隆和结构分析第96-99页
        3.2 团头鲂SIRT1和FoxO1氨基酸序列比对和系统发育树构建第99-103页
        3.3 团头鲂SIRT1和FoxO1蛋白结构预测第103-104页
        3.4 团头鲂SIRT1和FoxO1在不同组织中的表达分析第104-106页
    4 讨论第106-107页
    5 小结第107-109页
第六章 MiR-34a沉默对团头鲂肝脏转录组的影响第109-123页
    1 前言第109页
    2 材料与方法第109-112页
        2.1 试验日粮第109-110页
        2.2 试验鱼第110页
        2.3 饲养管理第110页
        2.4 样品采集第110页
        2.5 转录组测序与分析第110-112页
    3 测序结果与分析第112-120页
        3.1 数据产出及质控分析第112页
        3.2 转录本数据组装第112-113页
        3.3 转录组功能注释第113-117页
        3.4 SSR分析第117-118页
        3.5 差异表达(DEGs)分析第118-120页
    4 讨论第120-121页
    5 小结第121-123页
第七章 SIRT1/FoxO1介导的miR-34a对团头鲂糖脂代谢和免疫调控的影响第123-145页
    1 前言第123页
    2 材料与方法第123-129页
        2.1 试验日粮第123页
        2.2 试验鱼第123-124页
        2.3 饲养管理第124页
        2.4 样品采集与分析第124页
        2.5 团头鲂SIRT1多克隆抗体的制备第124-128页
        2.6 组织miR-34a和基因mRNA表达水平第128-129页
        2.7 Western Blot方法检测肝脏SIRT1蛋白表达第129页
        2.8 数据统计与分析第129页
    3 结果与分析第129-139页
        3.1 miR-34a沉默和过表达效果分析第129-131页
        3.2 MiR-34a沉默和过表达对团头鲂肝脏SIRT1表达的影响第131-133页
        3.3 SIRT1介导的miR34a干扰对肝脏糖代谢基因的影响第133-135页
        3.4 SIRT1介导的miR34a干扰对肝脏脂肪代谢基因的影响第135-137页
        3.5 SIRT1介导的miR34a干扰对肝脏抗炎症基因的影响第137-139页
    4 讨论第139-142页
        4.1 MiR-34a对摄食高糖高能日粮团头鲂SIRT1表达的影响第139页
        4.2 SIRT1介导的miR-34a对团头鲂糖代谢酶基因表达的调控第139-140页
        4.3 SIRT1介导的miR-34a对团头鲂脂肪代谢酶基因表达的调控第140-141页
        4.4 SIRT1介导的miR-34a对团头鲂炎症反应的调控第141-142页
    5 小结第142-145页
全文总结第145-147页
创新点第147-149页
参考文献第149-183页
附录第183-213页
    一、常用符号及缩略语第183-185页
    二、Western blot试验常用试剂第185-187页
    三、附表第187-213页
致谢第213-215页
攻读博士学位期间发表的学术论文及获得荣誉第215页

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