| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略词表 | 第8-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-34页 |
| 1.1 表观遗传学概述 | 第13页 |
| 1.2 表观遗传分子机制 | 第13-19页 |
| 1.2.1 DNA甲基化 | 第14-15页 |
| 1.2.2 组蛋白修饰 | 第15-17页 |
| 1.2.3 染色质重塑 | 第17-18页 |
| 1.2.4 RNA干扰与RNA指导的基因沉默 | 第18-19页 |
| 1.3 染色质重塑复合物 | 第19-24页 |
| 1.3.1 重塑概念 | 第19页 |
| 1.3.2 重塑家族分类和作用机制 | 第19-20页 |
| 1.3.3 重塑功能分类 | 第20-22页 |
| 1.3.3.1 核小体的组装和组织 | 第21页 |
| 1.3.3.2 染色质的接近 | 第21页 |
| 1.3.3.3 组蛋白变体的置换 | 第21-22页 |
| 1.3.4 重塑酶的靶向调控 | 第22-23页 |
| 1.3.4.1 组蛋白修饰和变体对重塑酶的靶向调控 | 第22-23页 |
| 1.3.4.2 DNA结合蛋白对重塑酶的靶向调控 | 第23页 |
| 1.3.5 重塑酶的研究展望 | 第23-24页 |
| 1.4 INO80染色质重塑复合物 | 第24-29页 |
| 1.4.1 INO80复合物组成和结构 | 第24-26页 |
| 1.4.2 INO80的功能 | 第26-29页 |
| 1.4.2.1 INO80与转录 | 第27-28页 |
| 1.4.2.2 INO80与DNA复制 | 第28页 |
| 1.4.2.3 INO80与DNA损伤修复 | 第28-29页 |
| 1.5 MOF复合物结构和功能 | 第29-31页 |
| 1.6 立题依据及研究意义 | 第31-34页 |
| 第二章 材料与方法 | 第34-49页 |
| 2.1 实验材料 | 第34-37页 |
| 2.1.1 实验仪器 | 第34-35页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第35-36页 |
| 2.1.3 实验抗体 | 第36页 |
| 2.1.4 实验质粒 | 第36-37页 |
| 2.1.5 实验细胞系 | 第37页 |
| 2.2 实验方法 | 第37-49页 |
| 2.2.1 细胞培养 | 第37页 |
| 2.2.2 质粒瞬时转染 | 第37-38页 |
| 2.2.3 siRNA瞬时转染 | 第38页 |
| 2.2.4 免疫印迹(Westernblot)实验 | 第38-39页 |
| 2.2.5 RNA提取 | 第39页 |
| 2.2.6 cDNA合成 | 第39-40页 |
| 2.2.7 qRT-PCR | 第40-41页 |
| 2.2.8 蛋白复合物的亲和纯化 | 第41-42页 |
| 2.2.9 体外重组核小体 | 第42-43页 |
| 2.2.10 体外乙酰化实验(HATAssays) | 第43-44页 |
| 2.2.11 体外置换实验(ExchangeAssays) | 第44-45页 |
| 2.2.12 ChIP/Re-ChIP | 第45-48页 |
| 2.2.13 ChIP-seq数据分析 | 第48-49页 |
| 第三章 实验结果与分析 | 第49-80页 |
| 3.1 INO80通过对H2A.Z的置换作用调控p21转录激活 | 第49-61页 |
| 3.1.1 引言 | 第49-50页 |
| 3.1.2 Doxo诱导p21转录激活 | 第50-51页 |
| 3.1.3 INO80调控Doxo诱导的p21转录激活 | 第51-53页 |
| 3.1.4 H2A.Z调控Doxo诱导的p21转录激活 | 第53-55页 |
| 3.1.5 INO80与H2A.Z共募集在p21启动子上 | 第55-57页 |
| 3.1.6 INO80调控H2A.Z在p21启动子的募集 | 第57页 |
| 3.1.7 INO80调控H2A.Z置换出p21启动子 | 第57-60页 |
| 3.1.8 小结 | 第60-61页 |
| 3.2 INO80调控H2A.Z在基因组上的分布 | 第61-66页 |
| 3.2.1 引言 | 第61-62页 |
| 3.2.2 INO80调控H2A.Z在基因组TSSs区的分布 | 第62-64页 |
| 3.2.3 INO80调控H2A.Z在染色质上的相对量 | 第64页 |
| 3.2.4 小结 | 第64-66页 |
| 3.3 INO80调控H2A.Z在体外置换反应 | 第66-71页 |
| 3.3.1 引言 | 第66页 |
| 3.3.2 H2A替换核小体中H2A.Z的置换反应 | 第66-69页 |
| 3.3.3 H2A.Z替换核小体中H2A的置换反应 | 第69-71页 |
| 3.3.4 小结 | 第71页 |
| 3.4 MOF乙酰化组蛋白促进INO80对H2A.Z的体外置换反应 | 第71-75页 |
| 3.4.1 引言 | 第71-72页 |
| 3.4.2 MOF乙酰化组蛋白八聚体 | 第72-73页 |
| 3.4.3 MOF调控INO80的置换活性 | 第73-75页 |
| 3.4.4 小结 | 第75页 |
| 3.5 MOF乙酰化组蛋白参与INO80对p21的转录调控 | 第75-80页 |
| 3.5.1 引言 | 第75-76页 |
| 3.5.2 MOF与INO80协同调控Doxo诱导的p21转录激活 | 第76-77页 |
| 3.5.3 MOF乙酰化活性调控INO80对p21启动子区H2A.Z的置换作用 | 第77-79页 |
| 3.5.4 小结 | 第79-80页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第80-86页 |
| 4.1 研究结果与讨论 | 第80-83页 |
| 4.2 研究结论 | 第83-84页 |
| 4.3 研究创新性 | 第84页 |
| 4.4 研究展望 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-95页 |
| 作者简介及博士期间获得的科研成果 | 第95-97页 |
| 致谢 | 第97页 |
