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水稻细菌性条斑病菌Ⅲ型效应因子功能的研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
缩略词表第10-12页
第一章 绪论第12-23页
    1.1 重要的水稻病害及研究进展概述第12-13页
    1.2 水稻细菌性条斑病(Bacterial leaf streak,BLS)第13页
    1.3 水稻免疫机制研究进展第13-19页
        1.3.1 植物免疫机制概述第13-14页
        1.3.2 PAMP触发的免疫第14-16页
            1.3.2.1 Flagellin-OsFLS2介导的免疫第15页
            1.3.2.2 Chitin-LysM结构蛋白介导的免疫第15-16页
            1.3.2.3 PGN-LysM结构蛋白介导的免疫第16页
            1.3.2.4 Ax21-XA21介导的免疫第16页
        1.3.3 PAMP引发的下游信号传导第16-18页
            1.3.3.1 OsSERK2与水稻免疫第16-17页
            1.3.3.2 OsRAC1与水稻免疫第17页
            1.3.3.3 外源调节与PAMP信号传导第17-18页
        1.3.4 效应因子触发的免疫第18页
        1.3.5 激素与植物免疫信号传导第18-19页
    1.4 效应因子抑制PAMP信号传导第19-22页
        1.4.1 non-TAL效应因子概述第20-21页
        1.4.2 TAL效应因子概述第21-22页
    1.5 本研究的目的和意义第22-23页
第二章 Xoc效应因子缺失突变体的构建及表型鉴定第23-42页
    2.1 试验材料第23-27页
        2.1.1 供试细菌菌株和质粒第23-24页
        2.1.2 本章试验所用的引物序列第24-26页
        2.1.3 培养基和溶液第26-27页
        2.1.4 抗生素第27页
    2.2 试验方法第27-35页
        2.2.1 细菌基因组DNA的提取第27页
        2.2.2 用于基因敲除的载体构建(以xopC2为例)第27-31页
            2.2.2.1 目的片段上游下游基因的扩增第27-28页
            2.2.2.2 目的片段的纯化回收第28-29页
            2.2.2.3 目的片段上下游的拼接第29页
            2.2.2.4 拼接片段与pEASY-Blunt的连接与转化第29-30页
            2.2.2.5 质粒DNA的提取第30页
            2.2.2.6 pUFR80重组载体的构建第30-31页
        2.2.3 突变体的构建(以△xopC2为例)第31-33页
        2.2.4 Southern blot验证突变体第33-34页
        2.2.5 Xoc致病性检测第34页
        2.2.6 Xoc在水稻叶片中菌量的测定第34-35页
    2.3 结果与分析第35-41页
        2.3.1 Xoc中26个non-TAL效应因子保守性分析第35-36页
        2.3.2 Xoc non-TAL效应因子缺失突变体的构建第36-37页
        2.3.3 效应因子突变体的Southern blot验证第37-38页
        2.3.4 Xoc中14个non-TAL效应因子突变体的致病性分析第38-41页
    2.4 小结与讨论第41-42页
第三章 AvrBs2抑制水稻防卫反应并提高病原菌在寄主中的致病性第42-65页
    3.1 试验材料第42-49页
        3.1.1 供试细菌菌株和质粒第42-43页
        3.1.2 本章试验所用的引物序列第43页
        3.1.3 植物品种第43-44页
        3.1.4 培养基和溶液第44-49页
            3.1.4.1 用于诱导及培养水稻愈伤的培养基第44-46页
            3.1.4.2 用于测定愈伤ROS的培养基第46页
            3.1.4.3 用于水稻原生质体转化的培养基第46-47页
            3.1.4.4 用于Western blot的溶液第47-49页
            3.1.4.5 其他培养基和溶液第49页
        3.1.5 抗生素第49页
    3.2 试验方法第49-57页
        3.2.1 转基因水稻抗性愈伤的诱导和培养第49页
        3.2.2 TPS小量法转基因水稻基因组的提取第49-50页
        3.2.3 蛋白提取和Western blot检测第50-51页
            3.2.3.1 AvrBs2蛋白的提取第50页
            3.2.3.2 Western blot检测第50-51页
        3.2.4 水稻悬浮细胞ROS的测定第51页
        3.2.5 水稻原生质体的分离和转化第51-52页
        3.2.6 质粒DNA的大量提取第52-53页
        3.2.7 总RNA的提取和荧光定量PCR第53-55页
            3.2.7.1 总RNA的提取第53-54页
            3.2.7.2 RNA的反转录第54页
            3.2.7.3 荧光定量PCR检测转基因水稻PR基因表达第54-55页
        3.2.8 AvrBs2亚细胞定位第55-57页
            3.2.8.1 本试验相关的载体构建第55页
            3.2.8.2 农杆菌感受态细胞的制备与转化第55-56页
            3.2.8.3 AvrBs2原生质体中的定位第56页
            3.2.8.4 AvrBs2在本生烟中的定位第56-57页
    3.3 结果与分析第57-64页
        3.3.1 转基因水稻纯合体的鉴定第57页
        3.3.2 AvrBs2抑制水稻愈伤组织中PTI信号传导第57-59页
        3.3.3 AvrBs2抑制水稻PTI信号传导并促进病原菌菌量生长第59-63页
        3.3.4 AvrBs2分布于整个植物细胞内第63-64页
    3.4 小结与讨论第64-65页
第四章 Xoc效应因子XopC2靶标OsSLR1和JAZs并促进病原菌在植物中生长第65-91页
    4.1 试验材料第66-74页
        4.1.1 供试细菌菌株和质粒第66-69页
        4.1.2 本章试验所用的引物序列第69-71页
        4.1.3 植物品种第71页
        4.1.4 培养基和溶液第71-74页
            4.1.4.1 用于酵母双杂交试验所用的培养基第71-72页
            4.1.4.2 用于pull-down试验的溶液第72-73页
            4.1.4.3 其他培养基和溶液第73-74页
    4.2 试验方法第74-81页
        4.2.1 酵母双杂交筛选互作蛋白第74页
            4.2.1.1 酵母感受态细胞的制备与转化第74页
            4.2.1.2 互作蛋白的筛选第74页
        4.2.2 双分子荧光互补验证互作蛋白第74-75页
        4.2.3 pull-down验证互作蛋白第75-78页
            4.2.3.1 表达菌株构建第75页
            4.2.3.2 融合蛋白的表达及可溶性检测第75-76页
            4.2.3.3 蛋白纯化第76页
            4.2.3.4 BCA法测蛋白浓度第76-77页
            4.2.3.5 体外GST pull-down实验第77-78页
        4.2.4 免疫共沉淀验证蛋白互作第78-79页
            4.2.4.1 载体构建第78页
            4.2.4.2 水稻原生质体的分离及转化第78页
            4.2.4.3 烟草接种方法第78页
            4.2.4.4 总蛋白提取第78-79页
            4.2.4.5 免疫共沉淀(Co-IP)第79页
        4.2.5 转基因拟南芥的构建第79-80页
            4.2.5.1 载体构建第79页
            4.2.5.2 浸花侵染法构建转基因拟南芥第79-80页
            4.2.5.3 转基因拟南芥的筛选第80页
        4.2.6 转基因拟南芥JA或SA下游响应机制的检测第80页
        4.2.7 转基因拟南芥中菌量生长第80-81页
    4.3 结果与分析第81-90页
        4.3.1 XopC2与OsSLR1的互作验证第81-82页
        4.3.2 OsSLR1与OsJAZs在体内与体外互作第82-83页
        4.3.3 XopC2与OsJAZs在体内与体外互作第83-84页
        4.3.4 XopC2、OsSLR1和OsJAZ9的互作区域第84-86页
        4.3.5 XopC2与AtJAZs相互作用第86页
        4.3.6 XopC2促进拟南芥JA信号的传导第86-87页
        4.3.7 XopC2抑制拟南芥PR基因的表达和气孔开放第87-88页
        4.3.8 XopC2促进病原菌在植物中的生长第88-90页
    4.4 小结与讨论第90-91页
第五章 全文总结与研究展望第91-92页
参考文献第92-102页
致谢第102-103页
作者简介第103页

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