| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第10-18页 |
| 1.1 类胡萝卜素结构、分布与功能 | 第10页 |
| 1.2 水产动物体内类胡萝卜素的研究进展 | 第10-11页 |
| 1.3 类胡萝卜素在动物体内的转运与代谢 | 第11-12页 |
| 1.4 新一代高通量测序技术的转录组测序(RNA-seq) | 第12-13页 |
| 1.4.1 新一代高通量测序技术简介 | 第12-13页 |
| 1.4.2 新一代高通量测序技术的转录组测序的应用 | 第13页 |
| 1.5 单核苷酸多态性(SNP)简介与应用 | 第13-16页 |
| 1.5.1 单核苷酸多态性的特点 | 第13-14页 |
| 1.5.2 单核苷酸多态性分型方法 | 第14-15页 |
| 1.5.3 SNP在水产动物遗传学与育种学研究中的运用 | 第15-16页 |
| 1.6 贝类类胡萝卜素抗逆性的研究 | 第16页 |
| 1.7 本研究的目的及意义 | 第16-17页 |
| 1.8 本研究的技术路线 | 第17-18页 |
| 2 RNA-seq技术筛选类胡萝卜素代谢相关差异基因 | 第18-31页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-21页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第18页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第18-21页 |
| 2.2 实验结果与分析 | 第21-29页 |
| 2.2.1 类胡萝卜素含量与RNA质量的检测 | 第21-23页 |
| 2.2.2 测序结果及质量分析 | 第23-29页 |
| 2.3 讨论 | 第29-31页 |
| 3 马氏珠母贝类胡萝卜素代谢相关基因的克隆和表达分析 | 第31-55页 |
| 3.1 材料与方法 | 第31-39页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第31-32页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第32-39页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第39-52页 |
| 3.2.1 候选基因的克隆 | 第39-46页 |
| 3.2.2 候选基因的生物学信息分析 | 第46-52页 |
| 3.3 候选基因的组织特异性表达分析 | 第52页 |
| 3.4 讨论 | 第52-55页 |
| 4 PmSR-BI-b和PmβCDIOX基因SNPs的筛选及与类胡萝卜素含量的关联性分析 | 第55-73页 |
| 4.1 实验材料 | 第55页 |
| 4.1.1 实验动物 | 第55页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第55页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第55页 |
| 4.2 实验方法 | 第55-60页 |
| 4.2.1 基因组DNA提取 | 第55页 |
| 4.2.2 闭壳肌总类胡萝卜素的提取 | 第55页 |
| 4.2.3 PmSR-BI-b和PmβCDIOX外显子区与5′调控区重测序实验 | 第55-60页 |
| 4.2.4 SNP位点与类胡萝卜素含量相关性分析 | 第60页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第60-70页 |
| 4.3.1 PmSR-BI-b外显子区和5′调控区SNP位点的遗传多态性分析 | 第60-63页 |
| 4.3.2 PmSR-BI-b基因SNP位点的连锁不平衡分析 | 第63页 |
| 4.3.3 PmSR-BI-b基因位点及单倍型与类胡萝卜素含量的关联分析 | 第63-65页 |
| 4.3.4 PmβCDIOX基因外显子区和5′调控区SNP位点的遗传多态性分析 | 第65-68页 |
| 4.3.5 PmβCDIOX基因SNP位点的连锁不平衡分析 | 第68页 |
| 4.3.6 PmβCDIOX基因位点及单倍型与类胡萝卜素含量的关联分析 | 第68-70页 |
| 4.4 讨论 | 第70-73页 |
| 5 外显子区非同义突变点的验证 | 第73-77页 |
| 5.1 材料与方法 | 第73-74页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第73页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第73-74页 |
| 5.2 实验结果与分析 | 第74-75页 |
| 5.2.1 PmSR-BI-b基因位点g.87315G>A的验证 | 第74-75页 |
| 5.2.2 PmβCDIOX位点g.204216T>A的验证 | 第75页 |
| 5.3 讨论 | 第75-77页 |
| 6 结论 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-89页 |
| 附录1 PmSR-BI-b外显子区和5′调控区引物序列 | 第89-91页 |
| 附录2 PmβCDIOX外显子区物序列 | 第91-92页 |
| 附录3 PmβCDIOX5′调控区引物序列 | 第92-93页 |
| 附录4 PmSR-BI-b基因分型电泳图 | 第93-95页 |
| 附录5 PmβCDIOX基因分型电泳图 | 第95-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 作者简介 | 第98-99页 |
| 导师简介 | 第99页 |
