| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第1章 前言 | 第11-21页 |
| 1.1 线粒体的主要特征 | 第11-12页 |
| 1.1.1 线粒体的发现 | 第11页 |
| 1.1.2 线粒体形态及分布 | 第11页 |
| 1.1.3 线粒体的起源与进化 | 第11-12页 |
| 1.2 线粒体基因组的主要特征 | 第12-14页 |
| 1.2.1 结构特征 | 第12-13页 |
| 1.2.2 遗传特征 | 第13页 |
| 1.2.3 进化特征 | 第13-14页 |
| 1.3 线粒体基因组各组分的特征 | 第14-15页 |
| 1.3.1 蛋白质编码基因 | 第14页 |
| 1.3.2 rRNA基因 | 第14-15页 |
| 1.3.3 tRNA | 第15页 |
| 1.3.4 非编码区 | 第15页 |
| 1.4 高通量测序技术概述 | 第15-17页 |
| 1.4.1 Solexa测序技术 | 第16页 |
| 1.4.2 454测序技术 | 第16页 |
| 1.4.3 SOLiD测序技术 | 第16-17页 |
| 1.5 高通量测序技术在动物线粒体基因组研究领域中的应用 | 第17-18页 |
| 1.6 蜻蜓目及研究的物种介绍 | 第18-19页 |
| 1.6.1 蜻蜓目概述 | 第18页 |
| 1.6.2 白扇蟌和黑色蟌的物种介绍 | 第18-19页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第19-21页 |
| 第2章 材料与方法 | 第21-27页 |
| 2.1 实验材料 | 第21页 |
| 2.2 实验仪器 | 第21-22页 |
| 2.3 实验试剂 | 第22页 |
| 2.4 实验方法 | 第22-24页 |
| 2.4.1 提取DNA过程所用的试剂 | 第22页 |
| 2.4.2 总DNA提取 | 第22-23页 |
| 2.4.3 总DNA质量的检测 | 第23页 |
| 2.4.4 DNA送测样品的纯化与DNA文库构建、测序 | 第23-24页 |
| 2.5 数据处理及分析 | 第24-25页 |
| 2.5.1 线粒体DNA的拼接与组装 | 第24页 |
| 2.5.2 线粒体基因组序列的注释 | 第24页 |
| 2.5.3 线粒体基因组序列分析 | 第24-25页 |
| 2.6 蜻蜓目的系统发育分析 | 第25-27页 |
| 2.6.1 序列数据来源 | 第25-26页 |
| 2.6.2 序列比对 | 第26页 |
| 2.6.3 序列组成分析 | 第26页 |
| 2.6.4 构建系统发育树 | 第26-27页 |
| 第3章 白扇蟌和黑扇蟌线粒体基因组的基本特征 | 第27-41页 |
| 3.1 白扇蟌线粒体基因组的基本特征 | 第27-33页 |
| 3.1.1 基因组的结构 | 第27页 |
| 3.1.2 碱基偏向性分析 | 第27-30页 |
| 3.1.3 蛋白质编码基因 | 第30-31页 |
| 3.1.4 tRNA基因和rRNA基因 | 第31-33页 |
| 3.1.5 控制区 | 第33页 |
| 3.2 黑色蟌线粒体基因组的基本特征 | 第33-41页 |
| 3.2.1 基因组的结构 | 第33-36页 |
| 3.2.2 碱基偏向性分析 | 第36页 |
| 3.2.3 蛋白质编码基因 | 第36-38页 |
| 3.2.4 tRNA基因与rRNA基因 | 第38-40页 |
| 3.2.5 控制区 | 第40-41页 |
| 第4章 蜻蜓目线粒体基因组的组成研究 | 第41-59页 |
| 4.1 序列长度变异 | 第41页 |
| 4.2 线粒体全基因组的碱基组成情况 | 第41-42页 |
| 4.2.1 线粒体全基因组的碱基组成 | 第41-42页 |
| 4.2.2 线粒体全基因组的A+T含量(AT%) | 第42页 |
| 4.2.3 线粒体全基因组的AT偏斜和GC偏斜 | 第42页 |
| 4.3 线粒体蛋白质编码基因分链的碱基组成情况 | 第42-49页 |
| 4.3.1 线粒体蛋白质编码基因分链的碱基组成 | 第42-43页 |
| 4.3.2 线粒体蛋白质编码基因分链的A+T含量(AT%) | 第43页 |
| 4.3.3 线粒体蛋白质编码基因分链的AT偏斜和GC偏斜 | 第43-49页 |
| 4.4 线粒体蛋白质编码基因的碱基组成情况 | 第49-50页 |
| 4.4.1 线粒体蛋白质编码基因的碱基组成 | 第49页 |
| 4.4.2 线粒体蛋白质编码基因的A+T含量(AT%) | 第49-50页 |
| 4.4.3 线粒体蛋白质编码基因的AT偏斜和GC偏斜 | 第50页 |
| 4.5 线粒体蛋白质编码基因的密码子偏好性 | 第50-59页 |
| 4.5.1 线粒体蛋白质编码基因H链的密码子偏好性 | 第50-53页 |
| 4.5.2 线粒体蛋白质编码基因L链的密码子偏好性 | 第53-55页 |
| 4.5.3 线粒体蛋白质编码基因的密码子偏好性 | 第55-59页 |
| 第5章 蜻蜓目的系统发育分析 | 第59-67页 |
| 5.1 多种方法构建系统发育树 | 第59-65页 |
| 5.1.1 最大简约法 | 第59-61页 |
| 5.1.2 最大似然法 | 第61-63页 |
| 5.1.3 贝叶斯推论法 | 第63-65页 |
| 5.2 系统发育结果分析与讨论 | 第65-67页 |
| 第6章 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 致谢 | 第77-79页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第79页 |
