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全基因组关联分析和全基因组预测法解析犬髋关节疾病

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-12页
第一章 髋关节发育不良和关节炎的全基因组关联分析第12-42页
   ·综述第12-25页
     ·犬髋关节发育不良的临床表现与诊断第12-15页
     ·全基因组关联分析(GWAS)的研究背景第15-16页
     ·全基因组关联分析的统计方法第16-24页
     ·巢式关联分析群体第24-25页
   ·材料与方法第25-31页
     ·试验群体和影像诊断方法第25-29页
     ·基因型测定第29-30页
     ·统计方法第30-31页
   ·结果第31-37页
     ·全基因组标记的属性第31-33页
     ·易感位点与基因第33-37页
   ·讨论第37-42页
     ·群体分层的校正与统计策略第37-39页
     ·易感基因的功能分析第39-42页
第二章 髋关节发育不良的基因组预测第42-60页
   ·综述第42-46页
     ·动物全基因组选择的概念第42-43页
     ·疾病的基因组预测第43-44页
     ·非线性基因组选择模型第44-46页
   ·材料和方法第46-49页
     ·研究群体第46-47页
     ·统计方法第47-48页
     ·预测公式的验证第48-49页
     ·缺失基因型的填补第49页
     ·敏感性、特异性、阳性和阴性的预测值第49页
   ·结果第49-57页
     ·估计育种值第49-50页
     ·基因组预测第50-51页
     ·交叉验证第51-53页
     ·独立验证第53-55页
     ·临床诊断和预测第55-57页
   ·讨论第57-60页
     ·全基因组选择的影响因素第57-58页
     ·疾病的基因组预测评价第58-60页
第三章 基因组预测的新算法-cBLUPg第60-77页
   ·综述第60-62页
   ·材料与方法第62-67页
     ·数据第62-63页
     ·统计方法第63-66页
     ·交叉验证第66-67页
     ·压缩的影响因素第67页
   ·结果第67-74页
     ·预测准确性第68-70页
     ·计算时间第70-72页
     ·模拟研究第72-74页
   ·讨论第74-77页
     ·最佳压缩比第74-75页
     ·计算时间第75-76页
     ·压缩的理论第76-77页
参考文献第77-85页
附录第85-86页
致谢第86-87页
作者简介第87页

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