全基因组关联分析和全基因组预测法解析犬髋关节疾病
摘要 | 第1-8页 |
ABSTRACT | 第8-12页 |
第一章 髋关节发育不良和关节炎的全基因组关联分析 | 第12-42页 |
·综述 | 第12-25页 |
·犬髋关节发育不良的临床表现与诊断 | 第12-15页 |
·全基因组关联分析(GWAS)的研究背景 | 第15-16页 |
·全基因组关联分析的统计方法 | 第16-24页 |
·巢式关联分析群体 | 第24-25页 |
·材料与方法 | 第25-31页 |
·试验群体和影像诊断方法 | 第25-29页 |
·基因型测定 | 第29-30页 |
·统计方法 | 第30-31页 |
·结果 | 第31-37页 |
·全基因组标记的属性 | 第31-33页 |
·易感位点与基因 | 第33-37页 |
·讨论 | 第37-42页 |
·群体分层的校正与统计策略 | 第37-39页 |
·易感基因的功能分析 | 第39-42页 |
第二章 髋关节发育不良的基因组预测 | 第42-60页 |
·综述 | 第42-46页 |
·动物全基因组选择的概念 | 第42-43页 |
·疾病的基因组预测 | 第43-44页 |
·非线性基因组选择模型 | 第44-46页 |
·材料和方法 | 第46-49页 |
·研究群体 | 第46-47页 |
·统计方法 | 第47-48页 |
·预测公式的验证 | 第48-49页 |
·缺失基因型的填补 | 第49页 |
·敏感性、特异性、阳性和阴性的预测值 | 第49页 |
·结果 | 第49-57页 |
·估计育种值 | 第49-50页 |
·基因组预测 | 第50-51页 |
·交叉验证 | 第51-53页 |
·独立验证 | 第53-55页 |
·临床诊断和预测 | 第55-57页 |
·讨论 | 第57-60页 |
·全基因组选择的影响因素 | 第57-58页 |
·疾病的基因组预测评价 | 第58-60页 |
第三章 基因组预测的新算法-cBLUPg | 第60-77页 |
·综述 | 第60-62页 |
·材料与方法 | 第62-67页 |
·数据 | 第62-63页 |
·统计方法 | 第63-66页 |
·交叉验证 | 第66-67页 |
·压缩的影响因素 | 第67页 |
·结果 | 第67-74页 |
·预测准确性 | 第68-70页 |
·计算时间 | 第70-72页 |
·模拟研究 | 第72-74页 |
·讨论 | 第74-77页 |
·最佳压缩比 | 第74-75页 |
·计算时间 | 第75-76页 |
·压缩的理论 | 第76-77页 |
参考文献 | 第77-85页 |
附录 | 第85-86页 |
致谢 | 第86-87页 |
作者简介 | 第87页 |