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棉花苗期耐盐和耐热的生理机制及其基因转录调控分析

摘要第4-7页
Abstract第7-10页
缩写词说明第11-16页
第一章 文献综述第16-33页
    1.1 土壤盐渍化和全球高温胁迫现状第16页
    1.2 棉花种质耐盐性及其机理研究进展第16-25页
        1.2.1 盐害对棉花生长发育影响及棉花耐盐特性第16-18页
        1.2.2 棉花耐盐性鉴定方法第18-21页
        1.2.3 棉花耐盐生理机制研究进展第21-23页
        1.2.4 棉花盐性分子机制研究进展第23-25页
    1.3 棉花耐热性研究进展第25-28页
        1.3.1 高温对棉花生长与发育的影响第26页
        1.3.2 高温对棉花雄性生殖系统的影响第26页
        1.3.3 棉花种质耐热性鉴定与筛选方法第26-27页
        1.3.4 棉花耐热性机理研究进展第27-28页
    1.4 利用组学筛选棉花耐盐和耐热相关基因的研究进展第28-32页
        1.4.1 棉花基因组学研究进展第28-29页
        1.4.2 转录组学筛选棉花耐盐和耐热相关基因进展第29-32页
    1.5 本研究的目的与意义第32-33页
第二章 陆地棉苗期耐盐性的高效鉴定方法第33-45页
    2.1 前言第33页
    2.2 材料与方法第33-36页
        2.2.1 供试材料第33-34页
        2.2.2 材料种植与盐处理第34页
        2.2.3 测定指标与方法第34-35页
        2.2.4 数据分析第35-36页
    2.3 结果与分析第36-42页
        2.3.1 盐胁迫形态特征与13个耐盐指标的相关性分析第36-38页
        2.3.2 不同品种各指标的灰色关联聚类分析第38-42页
    2.4 讨论第42-44页
        2.4.1 基于灰色关联聚类和主成分分析的耐盐性综合评价方法的优点第42-43页
        2.4.2 适用于棉花品种资源苗期耐盐性大规模鉴定的方法第43-44页
    2.5 小结第44-45页
第三章 盐胁迫下陆地棉幼苗体内离子区隔化分布研究第45-64页
    3.1 前言第45-46页
    3.2 材料与方法第46-49页
        3.2.1 试验材料第46页
        3.2.2 材料处理第46页
        3.2.3 试验方法第46-49页
        3.2.4 数据统计第49页
    3.3 结果与分析第49-58页
        3.3.1 土培和水培条件短期盐胁迫陆地棉叶片泌盐现象的观察第49页
        3.3.2 短期盐胁迫后组织水平陆地棉体内外Na~+、K~+相对含量比较第49-52页
        3.3.3 短期盐胁迫后细胞水平陆地棉叶片和根中Na~+、K~+相对含量比较第52-53页
        3.3.4 棉花叶片腺毛泌盐部位的初步研究第53-55页
        3.3.5 短期盐胁迫诱导的陆地棉叶肉细胞Na~+、H~+离子流速变化第55-57页
        3.3.6 维持细胞内PH稳态和细胞膜离子转运蛋白相关候选基因的表达分析第57-58页
    3.4 讨论第58-62页
        3.4.1 陆地棉叶片腺毛泌盐是一个新的Na~+区隔化机制第58-59页
        3.4.2 叶片Na~+区隔化的高效性是陆地棉种质耐盐性的关键因素第59-62页
    3.5 结论第62-64页
第四章 不同陆地棉品种苗期叶片盐胁迫诱导的差异基因表达与转录调控分析第64-103页
    4.1 前言第64页
    4.2 材料与方法第64-70页
        4.2.1 试验材料第64-65页
        4.2.2 材料种植第65页
        4.2.3 盐胁迫处理第65页
        4.2.4 生理指标测定方法第65页
        4.2.5 总RNA提取及荧光定量PCR(qRT-PCR and stem-loop qRT-PCR)第65-67页
        4.2.6 转录组测序(mRNA-seq)与De novo从头拼接第67-68页
        4.2.7 差异基因的筛选与功能分析第68-69页
        4.2.8 小RNA测序(small RNA-seq)与已知miRNA鉴定第69页
        4.2.9 差异miRNA表达谱及靶基因预测第69-70页
    4.3 结果与分析第70-94页
        4.3.1 盐胁迫后两个耐盐性不同陆地棉品种的生理生化水平的差异第70-71页
        4.3.2 从头组装的转录组测序(mRNA-seq)与非冗余Unigene注释第71-73页
        4.3.3 盐胁迫响应相关的差异转录Unigene鉴定筛选第73-74页
        4.3.4 陆地棉盐胁迫响应基因的共表达模式分析第74-79页
        4.3.5 盐胁迫响应的转录因子和其他耐盐相关的功能基因分析第79-82页
        4.3.6 盐胁迫响应的小RNA测序(small RNA-seq)及已知miRNA鉴定第82-85页
        4.3.7 盐胁迫响应的差异表达的已知miRNA及其靶基因预测第85-94页
    4.4 讨论第94-101页
        4.4.1 材料选择是筛选棉花候选耐盐相关基因以及研究miRNA表达调控机制的关键第94-95页
        4.4.2 参与盐应答响应的耐盐相关转录因子第95-98页
        4.4.3 参与盐应答响应的耐盐相关信号转导基因和抗性基因第98-100页
        4.4.4 陆地棉耐盐品种盐应答响应的miRNA潜在的调控网络第100-101页
    4.5 结论第101-103页
第五章 比较转录组学鉴定和筛选陆地棉苗期耐热相关基因第103-123页
    5.1 前言第103-104页
    5.2 材料与方法第104-108页
        5.2.1 供试材料第104页
        5.2.2 材料种植与高温处理第104-105页
        5.2.3 测定生理指标与方法第105页
        5.2.4 生理数据处理与统计方法第105-106页
        5.2.5 总RNA提取及荧光定量PCR第106-107页
        5.2.6 转录组测序(mRNA-seq)与De novo从头拼接第107页
        5.2.7 差异基因的筛选与功能分析第107-108页
    5.3 结果与分析第108-118页
        5.3.1 基于田间和室内生理生化数据评估和比较陆地棉品种耐热性第108-110页
        5.3.2 从头组装的转录组测序与非冗余Unigene注释第110-112页
        5.3.3 高温胁迫响应的差异表达基因鉴定第112-114页
        5.3.4 比较两品种之间的差异表达基因筛选耐热性相关基因第114-118页
    5.4 讨论第118-122页
        5.4.1 棉花耐热性能够反映其在田间成株期耐热表现第118-119页
        5.4.2 棉花蛋白激酶和转录因子基因在响应高温胁迫的积极作用第119-121页
        5.4.3 热激蛋白基因能潜在提高棉花耐热性第121-122页
    5.5 结论第122-123页
参考文献第123-146页
致谢第146-147页
附录第147-162页
攻读博士学位期间发表的学术论文第162页

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