| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1.1 抗菌药物的发展和现状 | 第10-11页 |
| 1.2 脂肪酸的生物合成途径 | 第11-13页 |
| 1.2.1 脂肪酸合成途径的分类 | 第11页 |
| 1.2.2 细菌脂肪酸合成途径 | 第11-13页 |
| 1.3 β-酮脂酰-ACP-合成酶I(FabB) | 第13-14页 |
| 1.4 β-酮脂酰-ACP-合成酶I(FabB)抑制剂 | 第14-16页 |
| 1.4.1 浅蓝菌素 | 第14-15页 |
| 1.4.2 硫乳霉素 | 第15-16页 |
| 1.5 计算机辅助药物设计 | 第16-20页 |
| 1.5.1 分子对接 | 第17-19页 |
| 1.5.1.1 分子对接的分类与方法 | 第17-18页 |
| 1.5.1.2 常用分子对接软件简介绍 | 第18-19页 |
| 1.5.2 分子动力学模拟 | 第19-20页 |
| 1.6 小结 | 第20-22页 |
| 1.6.1 研究目的及意义 | 第20页 |
| 1.6.2 主要研究内容 | 第20-21页 |
| 1.6.3 研究的创新计点 | 第21-22页 |
| 第二章 硫乳霉素及其衍生物对FabB作用机制研究 | 第22-32页 |
| 2.1 分子作用机制模拟实验 | 第22-23页 |
| 2.1.1 FabB结构的获得 | 第22-23页 |
| 2.1.2 分子动力学模拟 | 第23页 |
| 2.1.3 结合自由能计算 | 第23页 |
| 2.2 结果分析与讨论 | 第23-31页 |
| 2.2.1 动力学平衡的稳定性 | 第23-24页 |
| 2.2.2 各体系残基波动分析 | 第24-25页 |
| 2.2.3 七种体系中蛋白二级结构变化情况 | 第25-27页 |
| 2.2.4 聚类及氢键分析 | 第27-30页 |
| 2.2.5 MM-PBSA结合自由能分析 | 第30-31页 |
| 2.3 小结 | 第31-32页 |
| 第三章 基于FabB的虚拟筛选 | 第32-44页 |
| 3.1 实验内容 | 第32-34页 |
| 3.1.1 化合物库及靶点结构准备 | 第32页 |
| 3.1.2 ADME/T预测 | 第32-33页 |
| 3.1.3 分子对接 | 第33-34页 |
| 3.1.4 一致性打分 | 第34页 |
| 3.2 结论与讨论 | 第34-43页 |
| 3.2.1 ADME/T预测及分子对接 | 第34-35页 |
| 3.2.2 化合物性质分析 | 第35页 |
| 3.2.3 化合物结构及对接能量 | 第35-41页 |
| 3.2.4 化合物结构相关性分析 | 第41-42页 |
| 3.2.5 结合模式分析 | 第42-43页 |
| 3.3 小结 | 第43-44页 |
| 第四章 三唑类化合物对细菌多靶标作用机制研究 | 第44-59页 |
| 4.1 实验方法 | 第44-45页 |
| 4.1.1 对接受体与配体的准备 | 第44页 |
| 4.1.2 分子对接 | 第44-45页 |
| 4.1.3 一致性打分 | 第45页 |
| 4.2 实验结果与讨论 | 第45-58页 |
| 4.2.1 三唑类化合物的分类 | 第45-47页 |
| 4.2.2 第Ⅰ类化合物 | 第47-50页 |
| 4.2.2.1 对接打分 | 第47-48页 |
| 4.2.2.2 代表化合物与FabB结合模式分析 | 第48-49页 |
| 4.2.2.3 代表化合物与FabI结合模式分析 | 第49页 |
| 4.2.2.4 代表化合物与FtsZ结合模式分析 | 第49-50页 |
| 4.2.3 第Ⅱ类化合物 | 第50-53页 |
| 4.2.3.1 对接打分 | 第50-52页 |
| 4.2.3.2 代表化合物与FabB结合模式分析 | 第52-53页 |
| 4.2.4 第Ⅲ类化合物 | 第53-56页 |
| 4.2.4.1 对接打分 | 第53-55页 |
| 4.2.4.2 代表化合物与FabB结合模式分析 | 第55页 |
| 4.2.4.3 代表化合物与FabI结合模式分析 | 第55-56页 |
| 4.2.4.4 代表化合物与FtsZ结合模式分析 | 第56页 |
| 4.2.5 第Ⅳ类化合物 | 第56-58页 |
| 4.2.5.1 对接打分 | 第56-57页 |
| 4.2.5.2 代表化合物与FabB结合模式分析 | 第57-58页 |
| 4.3 小结 | 第58-59页 |
| 第五章 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |