| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-7页 |
| 1 前言 | 第15-25页 |
| 1.1 支原体概述 | 第15-16页 |
| 1.1.1 支原体的概念与分类 | 第15页 |
| 1.1.2 支原体的特征 | 第15-16页 |
| 1.1.3 支原体生理学 | 第16页 |
| 1.2 羊支原体性肺炎 | 第16-20页 |
| 1.2.1 羊支原体性肺炎病原学 | 第16-18页 |
| 1.2.2 羊支原体性肺炎病原菌的培养方法 | 第18页 |
| 1.2.3 羊支原体性肺炎病原菌代谢的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.3 羊支原体性肺炎检疫方法 | 第20-22页 |
| 1.3.1 病原的分离培养 | 第20页 |
| 1.3.2 病理诊断 | 第20-21页 |
| 1.3.3 分子生物学诊断 | 第21页 |
| 1.3.4 血清学诊断 | 第21-22页 |
| 1.4 羊支原体性肺炎疫苗的研究进展 | 第22-23页 |
| 1.5 RNA-Seq技术、支原体转录组学研究进展 | 第23-24页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 2 研究一丝状支原体山羊亚种与绵羊肺炎支原体生长曲线的测定 | 第25-30页 |
| 2.1 试验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1 菌种 | 第25页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第25页 |
| 2.1.3 试验器材 | 第25-26页 |
| 2.1.4 主要溶液的配制 | 第26页 |
| 2.2 试验方法 | 第26-27页 |
| 2.2.1 菌株的复苏与培养 | 第26页 |
| 2.2.2 活菌计数 | 第26-27页 |
| 2.2.3 生长曲线的测定 | 第27页 |
| 2.2.4 菌株的保存 | 第27页 |
| 2.3 试验结果 | 第27-28页 |
| 2.3.1 PG3株和NM151株的生长曲线测定结果 | 第27-28页 |
| 2.4 讨论 | 第28-29页 |
| 2.5 小结 | 第29-30页 |
| 3 研究二MmcPG3株的不同生长时期的转录组测序与分析 | 第30-58页 |
| 3.1 试验材料 | 第30-31页 |
| 3.1.1 菌种 | 第30页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第30页 |
| 3.1.3 试验器材 | 第30-31页 |
| 3.1.4 主要溶液的配制 | 第31页 |
| 3.2 试验方法 | 第31-37页 |
| 3.2.1 菌株培养 | 第31页 |
| 3.2.2 总RNA的提取 | 第31-32页 |
| 3.2.3 样品检测、制备和测序 | 第32-33页 |
| 3.2.4 生物信息分析流程 | 第33-34页 |
| 3.2.5 基因表达水平 | 第34页 |
| 3.2.6 差异表达基因的分析 | 第34页 |
| 3.2.7 差异基因KEGG注释和富集分析 | 第34-35页 |
| 3.2.8 RT/q-PCR对RNA-seq分析结果的验证 | 第35-37页 |
| 3.3 结果 | 第37-54页 |
| 3.3.1 PG3株四个生长时期的样品总RNA提取结果 | 第37-38页 |
| 3.3.2 PG3株四个生长时期总RNA样品质量检测结果 | 第38-39页 |
| 3.3.3 PG3株四个生长时期转录组测序结果 | 第39-42页 |
| 3.3.4 PG3株四个生长时期基因表达水平 | 第42页 |
| 3.3.5 PG3株四个生长时期差异表达基因的分析 | 第42-43页 |
| 3.3.6 PG3株四个生长时期差异表达基因KEGG富集分析 | 第43-54页 |
| 3.3.7 RT/q-PCR对PG3株RNA-seq分析结果的验证结果 | 第54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-57页 |
| 3.4.1 PG3株生长时期糖酵解途径的代谢差异 | 第55页 |
| 3.4.2 PG3株生长时期核苷酸代谢的差异 | 第55-56页 |
| 3.4.3 PG3株生长时期甘油磷脂代谢途径的代谢差异 | 第56页 |
| 3.4.4 PG3株四个生长时期氨酰-tRNA连接酶相关的差异 | 第56-57页 |
| 3.5 结论 | 第57-58页 |
| 4 研究三绵羊肺炎支原体NM151株不同生长时期转录组测序分析 | 第58-76页 |
| 4.1 试验材料 | 第58页 |
| 4.1.1 菌种 | 第58页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第58页 |
| 4.1.3 试验器材 | 第58页 |
| 4.1.4 主要溶液的配制 | 第58页 |
| 4.2 试验方法 | 第58-61页 |
| 4.2.1 菌株培养 | 第58页 |
| 4.2.2 总RNA的提取 | 第58-59页 |
| 4.2.3 样品检测、制备和测序 | 第59页 |
| 4.2.4 生物信息分析流程 | 第59-60页 |
| 4.2.5 基因表达水平 | 第60页 |
| 4.2.6 差异表达基因的分析 | 第60页 |
| 4.2.7 差异基因KEGG注释和富集分析 | 第60页 |
| 4.2.8 RT/q-PCR对RNA-seq分析结果的验证 | 第60-61页 |
| 4.3 结果 | 第61-73页 |
| 4.3.1 NM151株五个生长时期样品总RNA提取结果 | 第61-62页 |
| 4.3.2 NM151株五个生长时期总RNA样品质量检测结果 | 第62-63页 |
| 4.3.3 NM151株五个生长时期转录组测序数据结果 | 第63-66页 |
| 4.3.4 NM151株五个生长时期基因表达水平 | 第66页 |
| 4.3.5 NM151株五个生长时期差异表达基因的分析 | 第66-68页 |
| 4.3.6 NM151株个五不同生长时期差异表达基因KEGG富集分析 | 第68-72页 |
| 4.3.7 RT/q-PCR对NM151株RNA-seq分析结果的验证结果 | 第72-73页 |
| 4.4 讨论 | 第73-75页 |
| 4.4.1 NM151株五个生长时期富集到糖酵解的差异表达基因 | 第73-74页 |
| 4.4.2 NM151株五个时期富集到核苷酸代谢的差异表达基因 | 第74页 |
| 4.4.3 NM151株五个时期与氨酰-tRNA连接酶相关差异表达基因 | 第74-75页 |
| 4.5 结论 | 第75-76页 |
| 5 研究四Mmc与Mo的代谢差异的比较分析及培养基优化方案提出 | 第76-102页 |
| 5.1 试验数据 | 第76页 |
| 5.2 MmcPG3株与MoNM151株代谢差异的比较分析方法 | 第76-77页 |
| 5.2.1 MmcPG3株与MoNM151株代谢特点的总体比较 | 第76页 |
| 5.2.2 MmcPG3株与MoNM151株对应生长时期点对点比较分析 | 第76-77页 |
| 5.3 结果 | 第77-98页 |
| 5.3.1 MmcPG3株与MoNM151株代谢特点的总体比较 | 第77-78页 |
| 5.3.2 MmcPG3株与MoNM151株对应生长时期点对点比较分析 | 第78-97页 |
| 5.3.3 Mo培养基改良方案的提出 | 第97-98页 |
| 5.4 讨论 | 第98-101页 |
| 5.5 结论 | 第101-102页 |
| 6 研究五Mo培养基的优化 | 第102-106页 |
| 6.1 试验材料 | 第102页 |
| 6.1.1 菌种 | 第102页 |
| 6.1.2 主要试剂 | 第102页 |
| 6.1.3 试验器材 | 第102页 |
| 6.1.4 主要溶液的配制 | 第102页 |
| 6.2 试验方法 | 第102-103页 |
| 6.2.1 菌株的复苏与培养 | 第102-103页 |
| 6.2.2 活菌计数 | 第103页 |
| 6.2.3 pH值的测定 | 第103页 |
| 6.2.4 生长曲线的测定 | 第103页 |
| 6.3 试验结果 | 第103-105页 |
| 6.3.1 NM151株在四种不同改良培养基中的生长曲线 | 第103-105页 |
| 6.3.2 NM151株在四种改良培养基中的pH值测定 | 第105页 |
| 6.4 讨论 | 第105-106页 |
| 6.5 结论 | 第106页 |
| 7 全文结论 | 第106-107页 |
| 致谢 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-117页 |
| 作者简介 | 第117页 |
