摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
1 绪论 | 第10-16页 |
1.1 课题背景和意义 | 第10-11页 |
1.2 DNA计算研究现状 | 第11-12页 |
1.3 DNA计算问题难点 | 第12-14页 |
1.3.1 DNA计算模型设计问题 | 第13页 |
1.3.2 DNA计算编码设计问题 | 第13-14页 |
1.4 本文的主要内容 | 第14页 |
1.5 本文创新之处 | 第14-16页 |
2 DNA计算的分子生物学基础及编码问题 | 第16-31页 |
2.1 DNA分子的理化性质 | 第16-18页 |
2.1.1 DNA的分子组成 | 第16页 |
2.1.2 DNA的结构及特点 | 第16-18页 |
2.2 DNA分子的相关操作 | 第18-24页 |
2.2.1 DNA的变性和复性 | 第19-20页 |
2.2.2 PCR扩增 | 第20-21页 |
2.2.3 凝胶电泳分离 | 第21页 |
2.2.4 DNA链的外切 | 第21页 |
2.2.5 DNA链的内切 | 第21-23页 |
2.2.6 DNA链的连接 | 第23-24页 |
2.3 DNA计算中的编码问题 | 第24-30页 |
2.3.1 DNA编码问题的定义 | 第24页 |
2.3.2 DNA编码研究意义 | 第24-26页 |
2.3.3 DNA编码的分子生物学约束 | 第26-29页 |
2.3.4 DNA编码问题的研究现状 | 第29-30页 |
2.4 小结 | 第30-31页 |
3 基于蚁群算法和随机搜索算法的DNA编码集合设计 | 第31-42页 |
3.1 引言 | 第31页 |
3.2 蚁群算法的模型 | 第31-34页 |
3.2.1 蚁群转移策略 | 第31-32页 |
3.2.2 局部信息素的更新过程 | 第32-33页 |
3.2.3 全局信息素的更新过程 | 第33-34页 |
3.3 随机搜索算法 | 第34-35页 |
3.4 算法描述 | 第35-36页 |
3.5 实验结果及分析 | 第36-41页 |
3.5.1 参数设置 | 第36-37页 |
3.5.2 蚂蚁转移策略运行时间对比 | 第37-38页 |
3.5.3 结果及分析 | 第38-41页 |
3.6 结论 | 第41-42页 |
4 基于Bloch量子混沌算法的DNA编码集合设计 | 第42-54页 |
4.1 引言 | 第42页 |
4.2 混沌系统 | 第42页 |
4.3 量子混沌算法模型 | 第42-48页 |
4.3.1 量子位Bloch球坐标的编码方案 | 第42-43页 |
4.3.2 种群初始化 | 第43-44页 |
4.3.3 解空间的变换 | 第44页 |
4.3.4 量子旋转门的更新 | 第44-46页 |
4.3.5 量子染色体的交叉 | 第46-47页 |
4.3.6 量子染色体的变异 | 第47-48页 |
4.4 适应度函数 | 第48页 |
4.5 算法描述 | 第48-49页 |
4.6 实验结果及分析 | 第49-53页 |
4.6.1 参数设置 | 第49-50页 |
4.6.2 结果及分析 | 第50-53页 |
4.7 结论 | 第53-54页 |
5 总结和展望 | 第54-56页 |
5.1 总结 | 第54页 |
5.2 展望 | 第54-56页 |
参考文献 | 第56-60页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第60-61页 |
致谢 | 第61页 |