| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 前言 | 第14-16页 |
| 文献综述 | 第16-28页 |
| 第一章 基因组遗传变异研究进展 | 第16-26页 |
| 1.1 单核苷酸多态性（SNPs）研究概况 | 第16-17页 |
| 1.1.1 SNPs的检测方法 | 第16页 |
| 1.1.2 SNPs与家畜表型 | 第16-17页 |
| 1.2 拷贝数变异（CNVs）研究概况 | 第17-26页 |
| 1.2.1 CNVs的基本概念及主要形式 | 第17-18页 |
| 1.2.2 CNVs的形成机制 | 第18-20页 |
| 1.2.3 CNVs的效应机制 | 第20-21页 |
| 1.2.4 CNV的检测方法 | 第21页 |
| 1.2.5 CNV在人上的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.2.6 CNV在畜禽中的研究 | 第22-24页 |
| 1.2.7 展望 | 第24-26页 |
| 第二章 LEPR基因研究进展 | 第26-28页 |
| 2.1 LEPR结构与功能 | 第26-27页 |
| 2.2 LEPR基因的突变研究 | 第27-28页 |
| 试验研究 | 第28-70页 |
| 第三章 LEPR基因拷贝数变异在黄牛群体中的分布及对表型的影响 | 第28-36页 |
| 3.1 材料与方法 | 第28-30页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第28页 |
| 3.1.2 试验试剂与仪器 | 第28-29页 |
| 3.1.3 血液DNA的提取 | 第29页 |
| 3.1.4 DNA质量检测 | 第29页 |
| 3.1.5 引物设计 | 第29页 |
| 3.1.6 荧光定量PCR检测 | 第29-30页 |
| 3.1.7 统计分析 | 第30页 |
| 3.2 试验结果 | 第30-34页 |
| 3.2.1 基因组DNA提取结果 | 第30页 |
| 3.2.2 qPCR扩增效果 | 第30-31页 |
| 3.2.3 LEPR拷贝数在四个黄牛品种的分布 | 第31-32页 |
| 3.2.4 LEPR CNV与南阳牛和秦川牛表型的关联分析 | 第32-34页 |
| 3.3 讨论 | 第34-35页 |
| 3.4 小结 | 第35-36页 |
| 第四章 LEPR基因拷贝数变异对基因表达的影响 | 第36-44页 |
| 4.1 材料与方法 | 第36-37页 |
| 4.1.1 试验样品 | 第36页 |
| 4.1.2 试验试剂与仪器 | 第36页 |
| 4.1.3 基因组DNA和总RNA提取 | 第36页 |
| 4.1.4 定量引物设计 | 第36-37页 |
| 4.1.5 实时定量检测 | 第37页 |
| 4.1.6 试验数据分析 | 第37页 |
| 4.2 试验结果 | 第37-42页 |
| 4.2.1 组织样总RNA提取 | 第37页 |
| 4.2.2 qPCR扩增效果 | 第37-38页 |
| 4.2.3 LEPR基因在秦川牛两个时期的表达模式 | 第38-39页 |
| 4.2.4 LEPR基因拷贝数在26个秦川牛个体中的分布 | 第39页 |
| 4.2.5 LEPR基因在秦川牛26个个体肝脏组织中的相对表达量 | 第39-40页 |
| 4.2.6 LEPR基因在26个个体脂肪组织中的相对表达量 | 第40-41页 |
| 4.2.7 LEPR CNV位点对基因表达的影响 | 第41-42页 |
| 4.3 讨论 | 第42页 |
| 4.4 小结 | 第42-44页 |
| 第五章 LEPR基因启动子区遗传变异检测及分析 | 第44-59页 |
| 5.1 材料和方法 | 第44-47页 |
| 5.1.1 试验动物及样品采集 | 第44页 |
| 5.1.2 试验试剂与仪器 | 第44-45页 |
| 5.1.3 基因组DNA和总RNA提取 | 第45页 |
| 5.1.4 DNA池构建 | 第45页 |
| 5.1.5 引物设计 | 第45页 |
| 5.1.6 引物稀释和PCR扩增 | 第45-47页 |
| 5.1.7 DNA池测序及变异位点分析 | 第47页 |
| 5.1.8 RFLP法检测变异位点 | 第47页 |
| 5.1.9 统计分析 | 第47页 |
| 5.2 试验结果 | 第47-56页 |
| 5.2.1 基因组DNA和组织样RNA提取 | 第47-48页 |
| 5.2.2 牛LEPR启动子区PCR扩增结果 | 第48-49页 |
| 5.2.3 LEPR启动子遗传变异分析 | 第49页 |
| 5.2.4 g.-1285C>T位点测序图和酶切分型图 | 第49-50页 |
| 5.2.5 g.17T>C位点测序图和酶切分型图 | 第50页 |
| 5.2.6 LEPR基因g.-1285C>T位点在三个黄牛品种的遗传特征分析 | 第50-51页 |
| 5.2.7 LEPR基因g.17T>C位点在三个黄牛品种的遗传特征分析 | 第51-52页 |
| 5.2.8 变异位点g.-1285C>T和黄牛生长性状间的关联分析 | 第52-53页 |
| 5.2.9 变异位点g.17T>C和黄牛生长性状间的关联分析 | 第53-55页 |
| 5.2.10 g.-1285C>T位点对LEPR基因表达的影响 | 第55页 |
| 5.2.11 g.17T>C位点对LEPR基因表达的影响 | 第55-56页 |
| 5.3 讨论 | 第56-57页 |
| 5.4 小结 | 第57-59页 |
| 第六章 LEPR基因遗传变异对启动子活性的影响 | 第59-70页 |
| 6.1 试验材料与方法 | 第59-63页 |
| 6.1.1 试验材料 | 第59页 |
| 6.1.2 试验试剂与仪器 | 第59页 |
| 6.1.3 引物设计 | 第59页 |
| 6.1.4 空载体pGL3-Basic、pRL-TK、pGL3-Control的获得 | 第59-60页 |
| 6.1.5 LEPR基因启动子不同截短体荧光报告载体的构建 | 第60-61页 |
| 6.1.6 含有两个变异位点不同基因型的荧光报告载体构建 | 第61-62页 |
| 6.1.7 启动子区变异位点结合相关转录因子的预测 | 第62页 |
| 6.1.8 293T和C2C12细胞系的培养 | 第62页 |
| 6.1.9 脂质体和重组载体共转染 | 第62页 |
| 6.1.10 双荧光素酶活性测定 | 第62页 |
| 6.1.11 数据分析 | 第62-63页 |
| 6.2 试验结果 | 第63-69页 |
| 6.2.1 LEPR基因启动子五个截短体pGL3-Basic载体的构建 | 第63-65页 |
| 6.2.2 C2C12和 293T细胞培养 | 第65页 |
| 6.2.3 LEPR基因核心启动子区域筛选 | 第65-66页 |
| 6.2.4 LEPR基因核心启动子区域转录因子结合预测 | 第66-67页 |
| 6.2.5 g.-1285C>T和g.17T>C位点对LEPR基因启动子活性的影响 | 第67-69页 |
| 6.3 讨论 | 第69页 |
| 6.4 小结 | 第69-70页 |
| 结论与创新点 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-82页 |
| 附录 | 第82-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 作者简介 | 第98页 |
