猪肌内脂肪全基因组甲基化差异分析及候选基因研究
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-18页 |
| 1.1 DNA甲基化研究进展 | 第12-15页 |
| 1.1.1 DNA甲基化的作用 | 第12-13页 |
| 1.1.2 DNA甲基化的研究方法 | 第13-15页 |
| 1.1.3 DNA甲基化在猪选育上的研究现状 | 第15页 |
| 1.2 猪脂肪性状候选基因研究进展 | 第15-17页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第17-18页 |
| 第二章 猪肌内脂肪候选基因甲基化研究 | 第18-31页 |
| 2.1 试验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第18页 |
| 2.1.2 样品采集 | 第18页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第18-19页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第19页 |
| 2.2 试验方法 | 第19-23页 |
| 2.2.1 肌内脂肪含量测定 | 第19-20页 |
| 2.2.2 背最长肌组织DNA提取与质检 | 第20页 |
| 2.2.3 各组织RNA提取与质检 | 第20页 |
| 2.2.4 NUDT3基因cDNA序列全长扩增 | 第20-21页 |
| 2.2.5 NUDT3组织表达谱分析 | 第21页 |
| 2.2.6 NUDT3生物信息学分析 | 第21-22页 |
| 2.2.7 亚硫酸盐处理 | 第22页 |
| 2.2.8 BSP引物设计 | 第22页 |
| 2.2.9 PCR扩增 | 第22页 |
| 2.2.10 克隆测序 | 第22-23页 |
| 2.3 试验结果 | 第23-29页 |
| 2.3.1 NUDT3 cDNA全长克隆 | 第23-24页 |
| 2.3.2 NUDT3生物信息学分析 | 第24-25页 |
| 2.3.3 NUDT3的组织表达 | 第25页 |
| 2.3.4 PCR产物抽检 | 第25-26页 |
| 2.3.5 克隆测序结果分析 | 第26-29页 |
| 2.4 讨论 | 第29-30页 |
| 2.5 本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 猪肌内脂肪全基因组甲基化差异分析 | 第31-52页 |
| 3.1 试验材料 | 第31页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第31页 |
| 3.1.2 样品采集 | 第31页 |
| 3.1.3 主要仪器设备 | 第31页 |
| 3.1.4 主要试剂 | 第31页 |
| 3.2 试验方法 | 第31-33页 |
| 3.2.1 肌内脂肪含量测定 | 第31页 |
| 3.2.2 背最长肌组织DNA提取与质检 | 第31页 |
| 3.2.3 基因文库构建 | 第31-32页 |
| 3.2.4 文库质检 | 第32页 |
| 3.2.5 WGBS测序与甲基化位点检测 | 第32页 |
| 3.2.6 生物信息学分析 | 第32-33页 |
| 3.3 试验结果 | 第33-49页 |
| 3.3.1 参考序列比对分析 | 第33-36页 |
| 3.3.2 甲基化水平分析 | 第36-39页 |
| 3.3.3 甲基化密度分析 | 第39-44页 |
| 3.3.4 甲基化组DMR分析 | 第44-48页 |
| 3.3.5 DMR区域分析 | 第48-49页 |
| 3.4 讨论 | 第49-51页 |
| 3.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 全文结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-62页 |
| 附录 | 第62-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 作者简历 | 第70页 |
