| 缩略词表 | 第4-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-21页 |
| 1.1 番茄斑萎病毒病的发生与流行 | 第12页 |
| 1.2 番茄斑萎病毒（TSWV）的传播介体 | 第12-13页 |
| 1.3 番茄斑萎病的防治 | 第13-14页 |
| 1.4 番茄斑萎病毒的生物学特征 | 第14页 |
| 1.5 番茄斑萎病毒的分子生物学特性 | 第14-15页 |
| 1.6 番茄斑萎病毒的检测 | 第15-17页 |
| 1.6.1 生物接种 | 第15-16页 |
| 1.6.2 电子显微镜技术 | 第16页 |
| 1.6.3 血清学技术检测 | 第16页 |
| 1.6.4 分子生物学技术 | 第16-17页 |
| 1.7 番茄斑萎病毒的编码蛋白 | 第17-18页 |
| 1.7.1 RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp） | 第17页 |
| 1.7.2 非结构蛋白NSs | 第17页 |
| 1.7.3 核衣壳蛋白N | 第17页 |
| 1.7.4 移动蛋白NSm | 第17-18页 |
| 1.7.5 糖蛋白Gn-Gc | 第18页 |
| 1.8 负义RNA的亚基因组转录终止机制 | 第18-19页 |
| 1.9 植物RNA病毒的基因表达调控 | 第19-20页 |
| 1.10 本研究的目的和意义 | 第20-21页 |
| 2 材料和方法 | 第21-34页 |
| 2.1 材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 质粒，种子和菌株 | 第21页 |
| 2.1.2 番茄斑萎病的疑似样品 | 第21页 |
| 2.1.3 分子生物学试剂 | 第21页 |
| 2.1.4 试验仪器及设备 | 第21页 |
| 2.1.5 引物及测序 | 第21-22页 |
| 2.2 方法 | 第22-34页 |
| 2.2.1 植物总RNA的提取 | 第22页 |
| 2.2.2 RT-PCR检测 | 第22-23页 |
| 2.2.3 重叠PCR | 第23-24页 |
| 2.2.4 3’RACE(cDNA末端快速扩增) | 第24页 |
| 2.2.5 核酸的沉淀和浓缩 | 第24页 |
| 2.2.6 PCR产物或酶切产物的胶回收 | 第24-25页 |
| 2.2.7 连接反应 | 第25页 |
| 2.2.8 大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第25-26页 |
| 2.2.9 大肠杆菌感受态细胞的转化 | 第26页 |
| 2.2.10 菌落PCR筛选重组质粒 | 第26-27页 |
| 2.2.11 Cracking快速鉴定 | 第27页 |
| 2.2.12 酶切鉴定法 | 第27页 |
| 2.2.13 碱裂解法小量提质粒 | 第27-28页 |
| 2.2.14 酶切反应 | 第28页 |
| 2.2.15 体外转录 | 第28-29页 |
| 2.2.16 5’加帽体外转录反应体系 | 第29页 |
| 2.2.17 麦胚提取物（Wheat Germ Extract）中的体外翻译 | 第29-30页 |
| 2.2.18 拟南芥原生质体的制备与侵染 | 第30-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-58页 |
| 3.1 不同寄主上的TSWV中国分离物全基因组克隆与序列分析 | 第34-37页 |
| 3.1.1 云南烟草、辣椒、甜椒的番茄斑萎病疑似病样的TSWV检测 | 第34-35页 |
| 3.1.2 烟草、辣椒和甜椒中TSWV全基因组克隆 | 第35-37页 |
| 3.2 TSWV的分子变异与进化机制分析 | 第37-46页 |
| 3.2.1 TSWV的分子变异 | 第37-39页 |
| 3.2.2 TSWV系统进化分析 | 第39-41页 |
| 3.2.3 TSWV RNA重组分析 | 第41-46页 |
| 3.3 TSWV RNA M和S亚基因组的 3’末端的精确定位 | 第46-52页 |
| 3.3.1 3’RACE及测序 | 第46-49页 |
| 3.3.2 TSWV RNA M、S亚基因组的 3’末端在基因间隔区的位置 | 第49-50页 |
| 3.3.3 TSWV RNA M、S亚基因组的 3’末端的保守性分析 | 第50-52页 |
| 3.4 TSWV亚基因组的翻译调控研究 | 第52-58页 |
| 3.4.1 亚基因组sgRNA-NSs、sgRNA-N的 5’UTR和 3’UTR对翻译的作用 | 第52-53页 |
| 3.4.2 亚基因组sgRNA-NSs、sgRNA-N的 5’UTR的反式竞争实验 | 第53-54页 |
| 3.4.3 亚基因组sgRNA-NSs、sgRNA-N的 5’UTR核心调控区域的定位 | 第54-55页 |
| 3.4.4 亚基因组sgRNA-NSs、sgRNA-N的 3’UTR A-rich区对翻译的作用 | 第55-58页 |
| 4 讨论 | 第58-61页 |
| 4.1 TSWV分子变异及进化机制分析 | 第58-59页 |
| 4.2 源于TSWV RNA M和S的亚基因组的3’末端定位 | 第59页 |
| 4.3 源自TSWV RNA S的亚基因组的翻译调控 | 第59-61页 |
| 5 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 硕士期间发表的期刊论文 | 第70页 |
| 硕士期间发表的会议论文 | 第70-71页 |
| 附表 1 引物列表 | 第71-77页 |
| 附表 2 质粒列表 | 第77-83页 |
| 附表 3 世界范围内TSWV不同分离物的信息汇总 | 第83-89页 |
| 附表 4 TSWV RNA L全长基因组的重组信息 | 第89-92页 |
| 附表 5 TSWV RNA M全长基因组的重组信息 | 第92-99页 |
| 附表 6 TSWV RNA S全长基因组的重组信息 | 第99-105页 |
