| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 引言 | 第9-16页 |
| 1.1 CSFV基因组及ORF编码蛋白的结构和功能 | 第9-12页 |
| 1.1.1 5 ’端非编码区(5’UTR) | 第9页 |
| 1.1.2 Npro基因和蛋白 | 第9-10页 |
| 1.1.3 C基因和蛋白 | 第10页 |
| 1.1.4 EO基因和蛋白 | 第10页 |
| 1.1.5 E1基因和蛋白 | 第10-11页 |
| 1.1.6 E2基因和蛋白 | 第11页 |
| 1.1.7 P7蛋白和基因 | 第11页 |
| 1.1.8 NS2、NS3基因和蛋白 | 第11页 |
| 1.1.9 NS4A、NS4B基因和蛋白 | 第11-12页 |
| 1.1.10 NS5A、NS5B基因和蛋白 | 第12页 |
| 1.1.11 3’端非编码区(3’UTR) | 第12页 |
| 1.2 CSFV分子流行病学研究进展 | 第12-15页 |
| 1.2.1 基因分群标准的确立 | 第12-13页 |
| 1.2.2 我国CSFV基因分群研究 | 第13-14页 |
| 1.2.3 CSFV全基因组研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3 研究问题的提出 | 第15页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-21页 |
| 2.1 材料 | 第16-17页 |
| 2.1.1 样品来源 | 第16页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第16页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第16-17页 |
| 2.2 方法 | 第17-21页 |
| 2.2.1 引物合成 | 第17页 |
| 2.2.2 病料的处理 | 第17-18页 |
| 2.2.3 病毒的分离 | 第18-19页 |
| 2.2.4 总RNA的提取 | 第19页 |
| 2.2.5 RT-nestPCR扩增E2 190bp片段 | 第19页 |
| 2.2.6 RT-nestPCR扩增E2全基因 | 第19页 |
| 2.2.7 全基因的扩增 | 第19-20页 |
| 2.2.8 PCR扩增产物的凝胶电泳 | 第20页 |
| 2.2.9 E2基因序列测定及结果分析 | 第20页 |
| 2.2.10 全基因组PCR产物的克隆及测序 | 第20-21页 |
| 3 结果与分析 | 第21-35页 |
| 3.1 扩增及测序结果分析 | 第21-23页 |
| 3.1.1 E2高变区190片段基因RT-nestPCR扩增结果 | 第21页 |
| 3.1.2 E2全基因RT-nestPCR扩增结果 | 第21-22页 |
| 3.1.3 HuN23/2013、GXF29/2013全基因PCR扩增结果 | 第22页 |
| 3.1.4 HuN23/2013、GXF29/2013序列拼接结果 | 第22-23页 |
| 3.2 E2全基因及主要抗原区基因系统进化树构建 | 第23-26页 |
| 3.3 2013～2014年流行毒株及HCLV、Shimen株同源性比较 | 第26-27页 |
| 3.4 2013～2014年流行毒株E2蛋白变异分析 | 第27-30页 |
| 3.5 HuN23/2013、GXF29/2013核苷酸与氨基酸分析 | 第30-35页 |
| 3.5.1 HuN23/2013、GXF29/2013与参考毒株核苷酸与氨基酸同源性分析 | 第30-32页 |
| 3.5.2 HuN23/2013、GXF29/2013系统进化树的绘制 | 第32-33页 |
| 3.5.3 HuN23/2013、GXF29/2013细胞表位变异分析 | 第33页 |
| 3.5.4 HuN23/2013、GXF29/2013 E2蛋白氨基酸序列分析 | 第33-35页 |
| 4 讨论 | 第35-40页 |
| 4.1 我国CSFV流行毒株变异分析 | 第35-36页 |
| 4.2 E2基因抗原区氨基酸变异特点 | 第36-37页 |
| 4.3 全基因扩增策略 | 第37-38页 |
| 4.4 CSFV全基因分析 | 第38-40页 |
| 5 结论 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-46页 |
| 攻读硕士期间的主要科研成果 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47页 |
