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CDK2抑制剂结合机理的计算机研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
引言第8-9页
1 文献综述第9-23页
    1.1 蛋白质激酶家族第9-11页
        1.1.1 结构特征第9-10页
        1.1.2 ATP结合位点第10-11页
    1.2 细胞周期素依赖性激酶家族及其抑制剂第11-15页
        1.2.1 细胞周期素依赖性激酶第11-13页
        1.2.2 细胞周期素依赖性激酶的抑制剂第13-15页
    1.3 细胞周期素依赖性激酶2第15-20页
        1.3.1 CDK2的结构第15-16页
        1.3.2 CDK2和细胞周期素复合物的结合位点第16-20页
    1.4 本文研究的内容及意义第20-23页
2 实验原理及实验方法第23-28页
    2.1 定量构效关系方法第23-25页
    2.2 分子对接第25-26页
    2.3 分子动力学第26-28页
3 数据和实验方法第28-33页
    3.1 数据集和生物活性第28页
    3.2 建模方法第28-33页
        3.2.1 3D-QSAR模型构建第28-29页
        3.2.2 CoMFA和CoMSIA研究第29-30页
        3.2.3 PLS分析和统计验证第30-31页
        3.2.4 分子对接第31页
        3.2.5 分子动力学第31-33页
4 结果与讨论第33-48页
    4.1 3D-QSAR模型的有效性第33-34页
    4.2 最优模型图形阐述第34-37页
    4.3 结合模式分析第37-48页
        4.3.1 对接研究第37-39页
        4.3.2 MD验证第39页
        4.3.3 结合模式比较分析第39-48页
结论第48-49页
参考文献第49-63页
附录A PHTPP衍生物作CDK2/cyclinA复合物抑制剂的结构活性关系第63-69页
附录B CDK2/cyclinA抑制剂活的实验值和预测值及残差第69-72页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第72-73页
致谢第73-74页

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