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玉米体细胞胚胎发生的转录组分析及相关基因克隆

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 文献综述第13-27页
    1.1 体细胞胚胎发生第13-18页
        1.1.1 体细胞胚胎起源第14页
        1.1.2 诱导因子第14-17页
        1.1.3 细胞胚胎直接与间接诱导第17-18页
    1.2 体细胞胚胎发生的分子调控第18-24页
        1.2.1 胁迫响应相关分子调控第18-20页
        1.2.2 激素相关分子调控第20-22页
        1.2.3 促进胚胎发生的转录调控第22-24页
    1.3 胚胎发生基因表达的研究第24-25页
    1.4 研究的目的与意义第25-27页
第二章 玉米体细胞胚胎发生过程中内源激素变化研究第27-35页
    2.1 实验材料第27-28页
    2.2 实验方法第28-29页
        2.2.1 材料收集第28页
        2.2.2 IAA,ABA,CTK的浓度测定第28-29页
    2.3 结果与分析第29-33页
        2.3.1 玉米体细胞胚胎发生第29-30页
        2.3.2 体胚诱导过程中内源激素的动态变化第30-33页
    2.4 讨论第33-34页
    2.5 结论第34-35页
第三章 玉米体胚发生的转录组分析第35-67页
    3.1 实验材料第35页
    3.2 实验方法第35-41页
        3.2.1 总RNA提取第35-36页
        3.2.2 RNA-seq文库构建与测序第36-37页
        3.2.3 序列比对与分析第37-38页
        3.2.4 基因注释与表达模式分类第38页
        3.2.5 转录组数据库验证与候选基因的表达模式分析第38-41页
    3.3 结果与分析第41-60页
        3.3.1 RNA质量分析第41-42页
        3.3.2 差异表达序列分析第42-45页
        3.3.3 差异表达转录本的鉴定第45-46页
        3.3.4 DEGs的功能注释与分类第46-53页
        3.3.5 DEGs的聚类分析第53-54页
        3.3.6 RNA-seq数据库中的DEGs验证第54页
        3.3.7 玉米体胚发生中差异表达的转录因子(TFs)分析第54-56页
        3.3.8 体胚发生相关基因分析第56-59页
        3.3.9 候选基因的表达模式分析第59-60页
    3.4 讨论第60-65页
        3.4.1 体胚发生过程中胁迫可诱导基因表达调控第62页
        3.4.2 体胚发生过程中的激素相关分子调控第62-64页
        3.4.3 体细胞胚胎发生的转录调控第64-65页
    3.5 结论第65-67页
第四章 胚胎发生相关基因的克隆与分析第67-85页
    4.1 实验材料第67-68页
        4.1.1 材料准备第67页
        4.1.2 载体与菌株第67页
        4.1.3 实验试剂第67-68页
    4.2 实验方法第68-72页
        4.2.1 核酸提取与RNA反转录第68页
        4.2.2 基因克隆第68-70页
        4.2.3 载体构建第70-71页
        4.2.4 序列比对分析第71页
        4.2.5 拟南芥农杆菌侵染与筛选第71-72页
        4.2.6 基因功能验证第72页
    4.3 结果与分析第72-83页
        4.3.1 核酸提取第72-73页
        4.3.2 基因克隆与载体构建第73-75页
        4.3.3 候选基因的生物信息学分析第75-80页
        4.3.5 转基因拟南芥抗性筛选第80-82页
        4.3.6 基因功能验证(补充实验)第82-83页
    4.4 讨论第83-84页
    4.5 结论第84-85页
第五章 全文结论第85-86页
参考文献第86-98页
作者简介及科研成果第98-99页
致谢第99页

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