鳜鱼生长性状数字基因表达谱分析
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-23页 |
| 1 鱼类生长调控研究进展 | 第12-17页 |
| 1.1 生长轴相关调控因子 | 第12-15页 |
| 1.1.1 生长激素基因 | 第12-14页 |
| 1.1.2 生长激素受体基因 | 第14页 |
| 1.1.3 胰岛素样因子 | 第14-15页 |
| 1.1.4 其他生长轴相关激素 | 第15页 |
| 1.2 肌肉生长调控因子 | 第15-17页 |
| 1.2.1 肌生成抑制蛋白 | 第15-17页 |
| 1.2.2 肌形成调节因子 | 第17页 |
| 2. 转录组与数字基因表达谱技术研究进展 | 第17-21页 |
| 2.1 测序技术的发展简介 | 第17-18页 |
| 2.2 转录组技术的概述 | 第18-20页 |
| 2.3 数字基因表达谱技术概述 | 第20-21页 |
| 3. 鳜鱼概况及养殖现状 | 第21-22页 |
| 4. 研究内容 | 第22页 |
| 5. 研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 试验材料与方法 | 第23-34页 |
| 1 试验材料 | 第23-25页 |
| 1.1 试验鳜鱼 | 第23页 |
| 1.2 实验仪器 | 第23-24页 |
| 1.3 实验试剂及试剂盒 | 第24页 |
| 1.4 实验常用溶液配制 | 第24-25页 |
| 2 实验方法 | 第25-34页 |
| 2.1 技术路线 | 第25页 |
| 2.2 引物设计 | 第25-26页 |
| 2.3 总RNA提取 | 第26-27页 |
| 2.4 RNA质量检测 | 第27-28页 |
| 2.4.1 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第27-28页 |
| 2.4.2 RNA吸光度检测 | 第28页 |
| 2.4.3 RNA浓度检测 | 第28页 |
| 2.5 Tag制备与测序 | 第28-29页 |
| 2.6 DGE测序评估 | 第29-30页 |
| 2.6.1 质量评估 | 第29页 |
| 2.6.2 与参考基因比对 | 第29页 |
| 2.6.3 测序饱和度分析 | 第29页 |
| 2.6.4 Reads在参考基因上的分布统计 | 第29-30页 |
| 2.7 基因表达量统计及差异表达基因筛选 | 第30-31页 |
| 2.7.1 基因覆盖度 | 第30页 |
| 2.7.2 差异基因的GO功能显著性富集分析 | 第30页 |
| 2.7.3 Pathway显著性富集分析 | 第30-31页 |
| 2.8 定量cDNA样品的制备及检测 | 第31-32页 |
| 2.9 实时荧光定量PCR | 第32-34页 |
| 第三章 试验结果与分析 | 第34-45页 |
| 1 RNA质量分析 | 第34-35页 |
| 2 测序结果及质量分析 | 第35-38页 |
| 3 鳜鱼生长相关差异基因统计 | 第38-39页 |
| 4 鳜鱼生长相关基因所在通路筛选 | 第39-42页 |
| 5 差异表达基因的验证 | 第42-45页 |
| 第四章 总结与展望 | 第45-47页 |
| 1 总结 | 第45-46页 |
| 1.1 数字基因表达谱测序 | 第45-46页 |
| 1.2 差异基因的验证 | 第46页 |
| 2 展望 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-57页 |
| 硕士期间发表论文 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
