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南极产木质纤维素酶菌株的筛选及转录组的研究

中文摘要第10-12页
Abstract第12-13页
缩略词第14-15页
第一章 文献综述第15-24页
    1.1 极地微生物第15页
    1.2 南极微生物多样性第15-16页
        1.2.1 南极细菌研究进展第15-16页
        1.2.2 南极真菌研究进展第16页
    1.3 南极低温微生物和低温酶特性第16-17页
    1.4 木质纤维素第17-21页
        1.4.1 木质纤维素的结构第18页
        1.4.2 降解木质纤维素的微生物第18-19页
        1.4.3 木质纤维素降脂酶第19-21页
    1.5 转录组第21-22页
    1.6 本论文研究内容与意义第22-24页
第二章 南极菲尔德斯半岛菌株的分离培养及分子鉴定第24-39页
    2.1 材料与方法第25-29页
        2.1.1 样品采集第25-26页
        2.1.2 试验试剂与仪器第26页
        2.1.3 培养基第26-27页
        2.1.4 菌株筛选纯化及保存第27页
        2.1.5 南极菌株的形态学研究第27-28页
        2.1.6 菌株的分子鉴定第28页
        2.1.7 菌株生理生化特征分析第28-29页
    2.2 结果与分析第29-37页
        2.2.1 真菌的分离和形态学鉴定第29-30页
        2.2.2 细菌的菌落计数和形态特征第30-32页
        2.2.3 菌株分子鉴定与系统进化分析第32-35页
        2.2.4 菌株的生理生化特征第35-36页
        2.2.5 菌株产胞外酶活性测定第36-37页
    2.3 讨论第37-39页
第三章 产木质纤维素南极菌的筛选及酶活性的研究第39-52页
    3.1 主要材料与仪器第39-42页
        3.1.1 试验试剂与仪器第39-40页
        3.1.2 其他试验药品第40页
        3.1.3 试剂的配制第40-41页
        3.1.4 培养基的配制第41-42页
    3.2 试验方法第42-45页
        3.2.1 样品采集第42页
        3.2.2 产木质纤维素酶菌的分离纯化第42页
        3.2.3 产木质纤维素酶菌的初筛第42-43页
        3.2.4 产木质纤维素酶细菌的复筛第43-44页
        3.2.5 菌株生长曲线的测定第44页
        3.2.6 南极产木质纤维素酶细菌的鉴定第44-45页
    3.3 结果与分析第45-50页
        3.3.1 产木质纤维素酶菌的分离和初筛第45-47页
        3.3.2 产木质纤维素酶菌的复筛第47页
        3.3.3 菌株的纤维素酶活性测定第47-48页
        3.3.4 菌株的生长曲线第48页
        3.3.5 菌株形态学与生理生化特征第48-49页
        3.3.6 菌株的分子鉴定第49-50页
    3.4 讨论第50-52页
第四章 木质素降解菌Pseudomonas sp.E4-1转录组学研究第52-69页
    4.1 材料与方法第52-53页
        4.1.1 试验材料第52页
        4.1.2 试验试剂和仪器第52-53页
        4.1.3 总RNA提取及质量检测第53页
        4.1.4 转录组测序第53页
        4.1.5 生物信息学分析第53页
    4.2 结果第53-67页
        4.2.1 RNA样品检测第53-54页
        4.2.2 总RNA提取第54页
        4.2.3 HiSeq 2000测序拼接第54页
        4.2.4 转录组COG注释分析第54-56页
        4.2.5 Unigene的GO分类第56-58页
        4.2.6 Unigene代谢通路分析第58-65页
        4.2.7 预测编码蛋白框(CDS)第65-67页
    4.3 讨论第67-69页
附录第69-74页
参考文献第74-85页
致谢第85-86页
硕士期间发表论文第86-87页
附件第87页

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