基于网络结构推理和拓扑相似性的致病基因预测算法
摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
第一章 绪论 | 第8-16页 |
1.1 研究背景与意义 | 第8-10页 |
1.2 国内外致病基因预测的研究现状 | 第10-13页 |
1.3 本文研究的内容 | 第13-14页 |
1.4 本文的组织结构 | 第14-16页 |
第二章 致病基因预测的概述 | 第16-26页 |
2.1 人类疾病的分类 | 第16-18页 |
2.1.1 单基因疾病 | 第16-17页 |
2.1.2 多基因疾病 | 第17页 |
2.1.3 染色体疾病 | 第17-18页 |
2.2 传统的致病基因预测方法 | 第18-20页 |
2.2.1 连锁分析 | 第18-20页 |
2.2.2 关联研究 | 第20页 |
2.3 疾病相关联的生物网络 | 第20-24页 |
2.3.1 蛋白质-蛋白质关联网络 | 第21-22页 |
2.3.2 疾病相似网络 | 第22-23页 |
2.3.3 疾病-基因关联网络 | 第23-24页 |
2.4 相关生物数据库 | 第24-25页 |
2.5 本章小结 | 第25-26页 |
第三章 基于网络结构推理算法预测致病基因 | 第26-40页 |
3.1 引言 | 第26-27页 |
3.2 网络结构推理算法 | 第27-31页 |
3.3 疾病-基因关联网络的构建 | 第31页 |
3.4 疾病-基因网络资源的扩散 | 第31-33页 |
3.5 实验结果与分析 | 第33-39页 |
3.5.1 实验数据的选取 | 第33-34页 |
3.5.2 疾病-基因关联网络的特性 | 第34页 |
3.5.3 性能评估标准 | 第34-35页 |
3.5.4 对比实验 | 第35-38页 |
3.5.5 常见疾病致病基因的预测 | 第38-39页 |
3.6 小结 | 第39-40页 |
第四章 基于INBI算法预测致病基因 | 第40-52页 |
4.1 基因和疾病网络拓扑相似性的计算 | 第40-42页 |
4.2 疾病-基因邻接矩阵的构建 | 第42-43页 |
4.3 INBI算法预测致病基因的流程 | 第43-47页 |
4.4 实验结果与分析 | 第47-51页 |
4.4.1 对比实验 | 第47-49页 |
4.4.2 常见疾病致病基因的预测 | 第49-51页 |
4.5 本章小结 | 第51-52页 |
第五章 总结与展望 | 第52-54页 |
参考文献 | 第54-59页 |
致谢 | 第59-60页 |
攻读硕士研究生期间发表的论文和参与的科研项目 | 第60页 |