| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一部分：文献综述 | 第12-31页 |
| 1 转基因大豆及其研究现状 | 第12-14页 |
| 1.1 转基因大豆概述 | 第12-13页 |
| 1.2 抗除草剂转基因大豆研究现状 | 第13-14页 |
| 2 土壤固氮菌群与豆科植物共生体系 | 第14-18页 |
| 2.1 土壤固氮菌的分类 | 第14-15页 |
| 2.2 根瘤菌与豆科植物的共生体系 | 第15-18页 |
| 2.2.1 豆科植物与根瘤菌的共生结瘤 | 第15-16页 |
| 2.2.2 功能基因表征的固氮研究 | 第16-18页 |
| 3 转基因作物对土壤生态安全的影响 | 第18-22页 |
| 3.1 转基因外源产物与土壤的相互作用 | 第18-20页 |
| 3.1.1 外源基因及其产物在土壤中的残留途径 | 第18-20页 |
| 3.1.2 外源基因在土壤中的行为 | 第20页 |
| 3.2 转基因作物对土壤理化性质的影响 | 第20-21页 |
| 3.3 转基因作物对微生物多样性的影响 | 第21-22页 |
| 3.3.1 转基因作物对土壤中特定微生物的影响 | 第21-22页 |
| 3.3.2 转基因作物对微生物群落的影响 | 第22页 |
| 4 土壤微生物多样性及其研究方法 | 第22-30页 |
| 4.1 土壤多样性及其表示方法 | 第23页 |
| 4.2 土壤微生物多样性实验研究方法 | 第23-27页 |
| 4.2.2 常规的土壤微生物研究方法 | 第23-27页 |
| 4.2.2.1 传统微生物培养法 | 第24页 |
| 4.2.2.2 Biolog微平板法 | 第24-25页 |
| 4.2.2.3 磷脂脂肪酸谱图分析法(PLFA) | 第25页 |
| 4.2.2.4 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第25-26页 |
| 4.2.2.5 荧光实时定量PCR技术 | 第26-27页 |
| 4.3 宏基因组学(Metagenomics)技术 | 第27-30页 |
| 4.3.1 宏基因组学的概念 | 第27-28页 |
| 4.3.2 高通量测序技术简介 | 第28页 |
| 4.3.3 高通量测序技术在宏基因组学中的应用 | 第28-30页 |
| 5 本课题的提出、主要研究内容及意义 | 第30-31页 |
| 第二部分：实验部分 | 第31-64页 |
| 一、转EPSPS基因抗除草剂大豆对土壤固氮菌群和结瘤效应的影响 | 第31-52页 |
| 引言 | 第31页 |
| 1. 材料与方法 | 第31-39页 |
| 1.0 实验材料 | 第31-32页 |
| 1.1 土壤样品的采集与保存 | 第32-34页 |
| 1.1.1 采样前准备 | 第33页 |
| 1.1.2 布点和样品数容量 | 第33页 |
| 1.1.3 样品采集 | 第33页 |
| 1.1.4 样品的保存 | 第33-34页 |
| 1.2 实验方法 | 第34-39页 |
| 1.2.1 土壤理化性质的分析 | 第34-35页 |
| 1.2.1.1 土壤含水量(WHC,water-holding capacity)测定(风干法) | 第34-35页 |
| 1.2.1.2 土壤pH的测定(电位法) | 第35页 |
| 1.2.2 N循环关键酶活性测定(分光光度法) | 第35-37页 |
| 1.2.2.1 土壤固氮酶活测定 | 第35页 |
| 1.2.2.2 脲酶活性测定 | 第35-36页 |
| 1.2.2.3 硝酸还原酶活性测定 | 第36页 |
| 1.2.2.4 亚硝酸还原酶活性测定 | 第36-37页 |
| 1.2.3 土壤、大豆植株及种子N含量测定 | 第37页 |
| 1.2.4 土壤固氮菌群结瘤效应分析 | 第37页 |
| 1.2.5 根际土可培养固氮菌多样性分析(稀释平板法) | 第37-38页 |
| 1.2.6 固氮菌群总体丰度分析 | 第38-39页 |
| 1.2.6.1 土壤微生物总DNA的提取 | 第38-39页 |
| 1.2.6.2 real-time PCR进行固氮菌群总体丰度分析 | 第39页 |
| 2. 结果与分析 | 第39-49页 |
| 2.1 土壤部分理化性质 | 第39-41页 |
| 2.1.1 土壤含水量 | 第39-40页 |
| 2.1.2 土壤pH值 | 第40-41页 |
| 2.2 N循环关键酶活性 | 第41-45页 |
| 2.2.1 土壤脲酶 | 第41-42页 |
| 2.2.2 土壤硝酸还原酶 | 第42-43页 |
| 2.2.3 土壤亚硝酸还原酶 | 第43-44页 |
| 2.2.4 土壤固氮酶 | 第44-45页 |
| 2.3 N含量测定 | 第45-47页 |
| 2.3.1 土壤和植株地上部分N含量 | 第45-46页 |
| 2.3.2 大豆种子N含量 | 第46-47页 |
| 2.4 土壤固氮菌群结瘤效应分析 | 第47页 |
| 2.5 土壤可培养固氮菌多样性分析 | 第47-48页 |
| 2.6 土壤固氮菌群总体丰度分析 | 第48-49页 |
| 3. 讨论 | 第49-52页 |
| 3.1 转EPSPS基因抗除草剂大豆对根际土壤固氮菌群的影响 | 第50页 |
| 3.2 转EP3PS基因抗除草剂大豆对大豆结瘤效应的影响 | 第50-52页 |
| 二、大豆根际土壤微生物群落的宏基因组学分析 | 第52-64页 |
| 引言 | 第52页 |
| 1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 1.1 实验材料 | 第52-53页 |
| 1.2 土壤样品的采集与保存 | 第53页 |
| 1.3 DNA的提取与宏基因组测序 | 第53页 |
| 1.4 数据分析 | 第53-54页 |
| 2 结果与分析 | 第54-62页 |
| 2.1 测序原始数据的整理 | 第54页 |
| 2.2 物种丰度分析 | 第54-58页 |
| 2.2.1 稀释曲线 | 第54-55页 |
| 2.2.2 秩-丰度曲线 | 第55-56页 |
| 2.2.3 Alpha多样性分析 | 第56页 |
| 2.2.4 物种丰度差异分析 | 第56-57页 |
| 2.2.5 多样品物种分布 | 第57-58页 |
| 2.3 基因丰度分析 | 第58-62页 |
| 2.3.1 基因注释 | 第58-59页 |
| 2.3.2 N循环相关基因丰度分析 | 第59-62页 |
| 3. 讨论 | 第62-64页 |
| 全文结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
