| 致谢 | 第4-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-18页 |
| 1.1 植物的光周期现象及其分子机制的研究进展 | 第11-14页 |
| 1.1.1 植物的光周期现象 | 第11页 |
| 1.1.2 光周期的途径 | 第11页 |
| 1.1.3 感受光信号的光受体 | 第11-12页 |
| 1.1.4 信号输入途径作用机制 | 第12-13页 |
| 1.1.5 中央震荡器 | 第13-14页 |
| 1.1.6 生物钟系统对光周期信号的输出 | 第14页 |
| 1.2 转录组学及相关研究 | 第14-16页 |
| 1.2.1 转录组的概念、原理及分类 | 第14-15页 |
| 1.2.2 转录组的应用 | 第15页 |
| 1.2.3 RNA-seq的应用 | 第15-16页 |
| 1.3 转录组在玉米中的研究进展 | 第16-18页 |
| 2 引言 | 第18-19页 |
| 3 材料方法 | 第19-28页 |
| 3.1 试验材料 | 第19-20页 |
| 3.1.1 材料处理与取样 | 第19-20页 |
| 3.1.2 总RNA的提取与检测 | 第20页 |
| 3.2 转录组测序及分析 | 第20-23页 |
| 3.2.1 使用的数据库和软件 | 第20-21页 |
| 3.2.2 测序流程 | 第21-22页 |
| 3.2.3 数据过滤 | 第22-23页 |
| 3.3 数据处理及生物信息学分析 | 第23-25页 |
| 3.3.1 与参考序列比对 | 第23页 |
| 3.3.2 基因表达量统计 | 第23页 |
| 3.3.3 基因差异表达分析(DEGs) | 第23-24页 |
| 3.3.4 基因差异表达模式聚类分析 | 第24页 |
| 3.3.5 GO功能显著性富集分析 | 第24-25页 |
| 3.3.6 Pathway显著性富集分析 | 第25页 |
| 3.4 茎尖形态学观察 | 第25-26页 |
| 3.4.1 实验材料及取样方法 | 第25页 |
| 3.4.2 实验器材与试剂 | 第25页 |
| 3.4.3 实验方法 | 第25-26页 |
| 3.5. RT-PCR验证 | 第26-28页 |
| 3.5.1 实验材料 | 第26页 |
| 3.5.2 RNA提取及检测 | 第26页 |
| 3.5.3 反转录 | 第26-27页 |
| 3.5.4 荧光定量PCR反应 | 第27-28页 |
| 4 结果及分析 | 第28-46页 |
| 4.1 材料表型鉴定 | 第28页 |
| 4.2 茎尖形态观察 | 第28-29页 |
| 4.3 转录组测序数据处理 | 第29-31页 |
| 4.3.1 RNA质量检测 | 第29页 |
| 4.3.2 原始数据质量检测 | 第29-31页 |
| 4.4 测序得到的总Reads数在各个样本中的分布情况： | 第31-32页 |
| 4.5 生物信息学分析 | 第32-46页 |
| 4.5.1 同一时期不同材料特异表达的基因 | 第32-33页 |
| 4.5.2 所有差异基因的聚类分析 | 第33-34页 |
| 4.5.3 同一时期两材料差异表达基因比较 | 第34-35页 |
| 4.5.4 基因GO功能的整体分析 | 第35-38页 |
| 4.5.5 差异基因在生物过程中的详细功能分类及代谢网络分析 | 第38-41页 |
| 4.5.6 差异基因中光周期相关基因的分析 | 第41-44页 |
| 4.5.7 差异基因的定量验证 | 第44-46页 |
| 5 结论与讨论 | 第46-50页 |
| 5.1 数据概述 | 第46页 |
| 5.2 所有差异表达基因的分析 | 第46-47页 |
| 5.3 差异表达关周期基因 | 第47-50页 |
| 5.3.1 差异表达光周期基因的表达量变化及分类 | 第47页 |
| 5.3.2 差异表达光周期基因在花期调控上的表现 | 第47-48页 |
| 5.3.3 差异表达光周期基因的其它功能 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 附页 | 第53-57页 |
| abstract | 第57-58页 |