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玉米紫色叶鞘基因的定位及其候选基因预测

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
1 前言第10-21页
    1.1 植株花青素的研究进展第10-17页
        1.1.1 花青素合成途径第11-13页
        1.1.2 花青素合成途径中重要基因的研究进展第13-16页
            1.1.2.1 结构基因第13-14页
            1.1.2.2 调控基因第14-16页
        1.1.3 环境因子第16-17页
    1.2 图位克隆和分子标记第17-19页
        1.2.1 图位克隆原理第17页
        1.2.2 分子标记第17-19页
            1.2.2.1 基于已公布信息的分子标记的利用第17-18页
            1.2.2.2 基于测序技术的分子标记开发第18-19页
    1.3 混合分组分析(BSA)法与QTL-seq第19-20页
    1.4 本研究的目的与意义第20-21页
2 材料与方法第21-28页
    2.1 群体材料第21页
    2.2 常用分子生物学试剂第21页
    2.3 表型鉴定第21页
    2.4 玉米基因组DNA提取第21-22页
    2.5 PCR反应体系和程序第22页
    2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳第22-23页
    2.7 分子标记开发第23页
        2.7.1 CAPS标记第23页
        2.7.2 InDel标记第23页
    2.8 基因定位第23-26页
        2.8.1 初步定位第23-24页
            2.8.1.1 基于RIL群体进行基因的初步定位第23-24页
            2.8.1.2 基于F_2群体进行基因的初步定位第24页
        2.8.2 利用QTL-seq技术快速定位目的基因第24-25页
            2.8.2.1 建库测序第24页
            2.8.2.2 信息分析第24-25页
        2.8.3 利用图位克隆法对基因进行精细定位第25-26页
    2.9 候选基因预测和分析第26页
    2.10 总RNA提取、第一链cDNA合成和Real-Time PCR分析第26-28页
        2.10.1 总RNA提取第26-27页
        2.10.2 第一链cDNA合成第27页
        2.10.3 Real-Time PCR分析第27-28页
3 结果与分析第28-37页
    3.3 紫色叶鞘基因的定位第28-34页
        3.3.1 紫色叶鞘基因初步定位第28-30页
            3.3.1.1 基于RIL群体进行紫色叶鞘基因的初步定位第28页
            3.3.1.2 基于F_2群体进行紫色叶鞘基因的初步定位第28-30页
        3.3.2 利用QTL-seq技术快速定位第30-32页
        3.3.3 紫色叶鞘基因精细定位第32-34页
    3.4 候选基因预测和分析第34-37页
        3.4.1 候选基因预测第34-35页
        3.4.2 候选基因(GRMZM5G822829)的序列分析第35页
        3.4.3 候选基因(GRMZM5G822829)的组织特异性表达分析第35-36页
        3.4.4 候选基因(GRMZM5G822829)蛋白结构与功能的预测第36-37页
4 小结与讨论第37-39页
结论与展望第39-40页
参考文献第40-46页
附录第46-50页
致谢第50-51页
攻读学位期间发表的学术论文目录第51-52页

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