| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 英文缩写词表 | 第10-13页 |
| 文献综述 | 第13-19页 |
| 引言 | 第19-20页 |
| 主要技术路线 | 第20-21页 |
| 1 材料与方法 | 第21-32页 |
| 1.1 试验材料 | 第21-22页 |
| 1.1.1 实验菌株 | 第21页 |
| 1.1.2 实验动物 | 第21页 |
| 1.1.3 主要试剂及试剂盒 | 第21页 |
| 1.1.4 主要培养基及试剂的配制 | 第21-22页 |
| 1.1.5 仪器设备 | 第22页 |
| 1.2 实验方法 | 第22-32页 |
| 1.2.1 PhoP/Q二元调控对禽致病性大肠杆菌生物学特性及毒力的影响 | 第22-23页 |
| 1.2.2 运用基因芯片筛选禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的基因 | 第23-27页 |
| 1.2.3 RNA-Seq筛选APEC与PhoP/Q双缺株攻毒后肠道应答基因 | 第27-32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-43页 |
| 2.1 禽致病性大肠杆菌PhoP/Q缺失株对宿主菌生物学特性及毒力的影响 | 第32-33页 |
| 2.1.1 菌体超微结构观察 | 第32页 |
| 2.1.2 过氧化氢敏感性差异 | 第32页 |
| 2.1.3 血清杀菌试验 | 第32-33页 |
| 2.1.4 组织载菌量实验 | 第33页 |
| 2.2 运用基因芯片筛选禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的基因 | 第33-35页 |
| 2.2.1 PhoP/Q对APEC基因转录水平的影响 | 第33页 |
| 2.2.2 差异表达基因 | 第33-34页 |
| 2.2.3 GO分类结果 | 第34-35页 |
| 2.2.4 荧光定量PCR验证差异基因 | 第35页 |
| 2.3 RNA-Seq筛选APEC与PhoP/Q双缺株攻毒后肠道应答基因 | 第35-43页 |
| 2.3.1 组织病理学观察结果 | 第35-36页 |
| 2.3.2 测序质量评估 | 第36页 |
| 2.3.3 基因组比对结果 | 第36页 |
| 2.3.4 差异基因筛选 | 第36-37页 |
| 2.3.5 GO功能显著性富集分析 | 第37-38页 |
| 2.3.6 KEGG富集分析 | 第38-40页 |
| 2.3.7 荧光定量PCR验证差异基因 | 第40-43页 |
| 3 讨论 | 第43-48页 |
| 3.1 PhoP/Q基因缺失对APEC生物学特性及毒力的影响 | 第43-44页 |
| 3.1.1 PhoP/Q基因缺失对 PEC菌体超微结构的影响 | 第43页 |
| 3.1.2 PhoP/Q基因缺失对APEC过氧化氢敏感性的影响 | 第43页 |
| 3.1.3 PhoP/Q基因缺失对APEC血清杀菌实验的影响 | 第43-44页 |
| 3.1.4 PhoP/Q基因缺失对APEC菌体组织载菌量的影响 | 第44页 |
| 3.2 运用基因芯片筛选禽致病性大肠杆菌PhoP/Q调控的基因 | 第44-45页 |
| 3.3 RNA-Seq筛选APEC与PhoP/Q双缺株攻毒后肠道应答基因 | 第45-48页 |
| 4 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 作者简介 | 第56页 |
| 附作者在读研期间发表的学术论文 | 第56页 |
