| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第1章 前言 | 第9-13页 |
| ·宏基因组介绍 | 第9-10页 |
| ·测序平台的介绍 | 第10-13页 |
| ·Sanger测序平台 | 第10页 |
| ·454测序平台 | 第10-11页 |
| ·Illumina测序平台 | 第11-13页 |
| 第2章 错误模型的统计与模拟数据集的收集 | 第13-26页 |
| ·错误模型的统计 | 第13-22页 |
| ·研究背景 | 第13-15页 |
| ·材料与方法 | 第15-22页 |
| ·材料收集 | 第15-16页 |
| ·总错误率的统计 | 第16-18页 |
| ·各错误类型的错误率统计 | 第18-22页 |
| ·模拟数据集的收集 | 第22-26页 |
| ·研究背景 | 第22页 |
| ·数据集介绍 | 第22-26页 |
| 第3章 第二代测序模拟系统(NeSSM)的设计和实现 | 第26-37页 |
| ·GPU并行化运算的介绍 | 第26-28页 |
| ·NeSSM系统的介绍 | 第28-37页 |
| ·研究背景 | 第28-29页 |
| ·设计流程介绍 | 第29-31页 |
| ·模拟测序系统的操作步骤说明 | 第31-37页 |
| 第4章 NeSSM系统的测试及应用 | 第37-52页 |
| ·拼接结果的测试 | 第37-46页 |
| ·研究背景 | 第37-42页 |
| ·结果和分析 | 第42-46页 |
| ·种群组成结构分析 | 第46-50页 |
| ·研究背景 | 第46-47页 |
| ·结果和分析 | 第47-50页 |
| ·MEGAN分析 | 第47-50页 |
| ·MetaBi nG分析 | 第50页 |
| ·系统运行速度的测试和与MetaSim的比较 | 第50-52页 |
| ·研究背景 | 第50-51页 |
| ·结果和分析 | 第51-52页 |
| 第5章 总结与展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-55页 |
| 攻读硕士学位论文期间发表学术论文 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 附录1 | 第57-59页 |
| 附录2 | 第59-60页 |
| 附录3 | 第60-61页 |
| 附录4 | 第61-65页 |
| 附录5 | 第65-68页 |