| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-24页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-23页 |
| 1.1.1 氮污染的研究现状 | 第13页 |
| 1.1.2 厌氧氨氧化机理 | 第13-15页 |
| 1.1.3 厌氧氨氧化菌的特征和分类 | 第15-16页 |
| 1.1.4 不同电子受体的厌氧氨氧化反应 | 第16-19页 |
| 1.1.5 厌氧氨氧化的生物学研究方法 | 第19-23页 |
| 1.2 文章的内容、目的和意义 | 第23-24页 |
| 1.2.1 研究主要内容 | 第23页 |
| 1.2.2 研究目的及意义 | 第23-24页 |
| 第二章 利用PCR-DGGE技术对AAOB微生物多样性的鉴定 | 第24-36页 |
| 2.1 引言 | 第24页 |
| 2.2 材料与方法 | 第24-27页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第24-25页 |
| 2.2.2 核酸提取与PCR扩增 | 第25页 |
| 2.2.3 PCR退火温度的优化 | 第25页 |
| 2.2.4 变性梯度酰胺凝胶电泳的时间和电压优化 | 第25-26页 |
| 2.2.5 变性梯度酰胺凝胶电泳的上样量的优化 | 第26页 |
| 2.2.6 变性梯度酰胺凝胶电泳凝胶浓度优化 | 第26页 |
| 2.2.7 变性梯度酰胺凝胶电泳 | 第26页 |
| 2.2.8 DGGE图谱数据分析 | 第26页 |
| 2.2.9 切胶回收与测序分析 | 第26-27页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第27-35页 |
| 2.3.1 土壤基因组DNA的提取 | 第27页 |
| 2.3.2 PCR扩增的退火温度优化 | 第27页 |
| 2.3.3 电泳时间和电压的优化 | 第27-28页 |
| 2.3.4 电泳的上样量的优化 | 第28-29页 |
| 2.3.5 凝胶浓度优化 | 第29页 |
| 2.3.6 Amx反应器与Fmx反应器样品的DGGE图谱 | 第29-31页 |
| 2.3.7 两种样品的未加权聚类分析 （ UPGMA ） 与微生物多样性（SHANNON）指数分析 | 第31页 |
| 2.3.8 两种样品中细菌群落的结构多样性 | 第31-35页 |
| 2.4 本章小节 | 第35-36页 |
| 2.4.1 PCR-DGGE优化分析 | 第35页 |
| 2.4.2 PCR-DGGE电泳及测序结果分析 | 第35-36页 |
| 第三章 利用 16S rDNA宏测序分析不同电子受体Anammox反应器的AAOB多样性 | 第36-44页 |
| 3.1 引言 | 第36页 |
| 3.2 材料和方法 | 第36-37页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第36页 |
| 3.2.2 DNA的提取与PCR扩增 | 第36页 |
| 3.2.3 建库与测序 | 第36-37页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第37-43页 |
| 3.3.1 稀释性曲线 | 第37页 |
| 3.3.2 不同电子受体Anammox反应器的序列数目与alpha多样性指数 | 第37-38页 |
| 3.3.3 不同电子受体Anammox反应器的门（Phylum）水平相对丰度 | 第38-40页 |
| 3.3.4 不同电子受体Anammox反应器的纲（Class）水平相对丰度 | 第40-41页 |
| 3.3.5 不同电子受体Anammox反应器的科（Family）和属（Genus）的水平相对丰度 | 第41-43页 |
| 3.4 本章小结 | 第43-44页 |
| 第四章 利用qPCR分析不同电子受体反应器内功能细菌的差异 | 第44-57页 |
| 4.1 引言 | 第44页 |
| 4.2 材料与方法 | 第44-46页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第44页 |
| 4.2.2 引物选择 | 第44页 |
| 4.2.3 qPCR扩增程序和体系 | 第44-45页 |
| 4.2.4 标准品的制备 | 第45-46页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第46-56页 |
| 4.3.1 不同电子受体Anammox反应器的标准曲线方程和拷贝数分析结果 | 第46-47页 |
| 4.3.2 不同电子受体Anammox反应器Amx809F/ Amx1066R引物qPCR定量分析 | 第47-49页 |
| 4.3.3 不同电子受体Anammox反应器Amx808F/ Amx1040R引物qPCR定量分析 | 第49-50页 |
| 4.3.4 不同电子受体Anammox反应器的amoA基因qPCR定量分析 | 第50-52页 |
| 4.3.5 不同电子受体Anammox反应器的NOB细菌qPCR定量分析 | 第52-53页 |
| 4.3.6 不同电子受体Anammox反应器的NarG基因qPCR定量分析 | 第53-54页 |
| 4.3.7 不同电子受体Anammox反应器的NirS基因qPCR定量分析 | 第54-56页 |
| 4.4 本章小结 | 第56-57页 |
| 第五章 结论与展望 | 第57-59页 |
| 5.1 主要结论 | 第57-58页 |
| 5.2 展望 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 作者简介 | 第66页 |
