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刺参Apostichopus japonicus(Selenka)夏眠期间基因表达模式及DNA甲基化基础特征研究

致谢第1-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-15页
第一章 动物夏眠研究进展第15-29页
   ·动物夏眠的起源与特征第15-16页
   ·动物夏眠的调控理论第16-23页
     ·夏眠基因表达模式研究第17-18页
     ·夏眠基因表达抑制调控研究第18-23页
   ·刺参夏眠研究进展第23-25页
     ·刺参夏眠的组织学研究第23-24页
     ·刺参夏眠的生理生化研究第24-25页
     ·刺参夏眠的分子调控机理探索第25页
   ·本研究的研究目的、意义及研究思路第25-29页
     ·研究目的与意义第25-26页
     ·研究思路第26-27页
     ·预期成果第27-28页
     ·本章小结第28-29页
第二章 刺参夏眠期间最适内参系统的筛选第29-44页
   ·前言第29-30页
   ·材料与方法第30-33页
     ·样品采集第30页
     ·cDNA合成第30-31页
     ·引物设计和qRT-PCR分析第31-32页
     ·数据分析第32-33页
   ·实验结果第33-42页
     ·候选内参基因的表达特征第33-37页
     ·候选内参基因的表达稳定性第37-42页
   ·讨论第42页
   ·本章小结第42-44页
第三章 刺参关键夏眠阶段肠道表达谱构建第44-80页
   ·前言第44-45页
   ·材料与方法第45-51页
     ·实验动物采捕与暂养第45页
     ·室内诱导刺参夏眠实验第45-46页
     ·总RNA提取第46-47页
     ·cDNA文库构建与测序第47页
     ·序列过滤、比对和质量评估第47-48页
     ·基因表达分析及差异表达基因(DEG)筛选第48-49页
     ·GO功能(Gene ontology)和通路(Pathway)富集分析第49页
     ·qRT-PCR验证第49-51页
   ·实验结果第51-74页
     ·RNA-seq测序结果统计分析第51-53页
     ·差异表达基因筛选第53-61页
     ·qRT-PCR验证结果第61-63页
     ·差异表达基因的GO富集分析第63页
     ·差异表达基因的Pathway富集分析第63-70页
     ·夏眠相关关键差异表达基因筛选第70-74页
   ·讨论第74-79页
     ·差异表达基因的GO富集分析第75-76页
     ·差异表达基因的Pathway富集分析第76页
     ·关键差异表达基因筛选第76-79页
   ·本章小结第79-80页
第四章 刺参关键夏眠阶段呼吸树表达谱构建第80-109页
   ·前言第80-81页
   ·材料与方法第81-83页
     ·实验动物采捕与暂养第81页
     ·室内诱导刺参夏眠实验第81页
     ·总RNA提取第81页
     ·cDNA文库构建与测序第81页
     ·序列过滤、比对和质量评估第81页
     ·基因表达分析及差异表达基因(DEG)筛选第81页
     ·差异表达基因的GO富集分析第81页
     ·qRT-PCR验证第81-83页
   ·实验结果第83-105页
     ·测序结果统计分析第83-85页
     ·qRT-PCR验证第85-87页
     ·差异表达基因筛选第87-95页
     ·肠道与呼吸树表达谱共同DEG和呼吸树特异性DEG筛选第95-103页
     ·差异表达基因的GO富集分析第103-105页
   ·讨论第105-108页
   ·本章小结第108-109页
第五章 刺参甲基化修饰系统关键基因的克隆与表达分析第109-125页
   ·前言第109-110页
   ·材料与方法第110-115页
     ·实验动物采捕与暂养第110页
     ·室内诱导刺参夏眠实验第110-111页
     ·总RNA提取第111页
     ·dnmt1和mbd2/3 基因cDNA全长克隆第111-114页
     ·序列分析第114页
     ·qRT-PCR分析dnmt1和mbd2/3 基因表达水平第114-115页
   ·实验结果第115-123页
     ·刺参Dnmt1基因全长cDNA克隆及序列分析第115-117页
     ·刺参Dnmt1基因序列同源性与进化分析第117-119页
     ·刺参Mbd2/3 基因全长cDNA克隆及序列分析第119页
     ·刺参Mbd2/3 基因序列同源性与进化分析第119-121页
     ·夏眠不同时期刺参各组织中Dnmt1与Mbd2/3 基因的mRNA的表达分析第121-123页
   ·讨论第123-124页
   ·本章小结第124-125页
第六章 刺参关键夏眠阶段基因组DNA甲基化特征分析第125-138页
   ·前言第125-126页
   ·材料与方法第126-129页
     ·样品的采集第126-127页
     ·基因组DNA提取第127页
     ·F-MSAP分析第127-129页
   ·实验结果第129-135页
     ·刺参非夏眠期不同组织基因组DNA甲基化水平第129-133页
     ·不同夏眠阶段刺参各组织甲基化水平第133-135页
   ·讨论第135-137页
   ·本章小结第137-138页
第七章 总结与展望第138-141页
   ·研究总结第138-139页
   ·创新性第139-140页
   ·存在问题第140页
   ·研究展望第140-141页
参考文献第141-164页
作者简介第164-165页
攻读学位期间撰写与发表的学术论文第165页

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