致谢 | 第1-10页 |
摘要 | 第10-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-21页 |
1 平菇概述 | 第11-13页 |
·平菇的现状及存在问题 | 第11页 |
·平菇的出菇机理研究进展 | 第11-12页 |
·平菇的价值及前景 | 第12-13页 |
·经济价值 | 第12页 |
·食用价值 | 第12页 |
·药用价值 | 第12-13页 |
·发展前景 | 第13页 |
2 漆酶研究进展 | 第13-15页 |
·漆酶酶学特性 | 第13页 |
·漆酶的研究及前景分析 | 第13-15页 |
·漆酶分子生物学研究 | 第13-15页 |
·漆酶基因的结构分析 | 第14页 |
·漆酶基因的克隆研究 | 第14页 |
·漆酶基因的表达调节 | 第14-15页 |
·漆酶基因的异源表达 | 第15页 |
·漆酶的应用研究及前景 | 第15页 |
3 亲缘关系鉴定方法 | 第15-17页 |
·传统生物学方法 | 第15-16页 |
·生物化学方法 | 第16页 |
·分子生物学方法 | 第16-17页 |
4 转录组学研究进展 | 第17-19页 |
·转录组学的发展 | 第17-18页 |
·转录组测序技术的发展应用 | 第18-19页 |
5 食用菌基因表达研究 | 第19页 |
6 研究目的及意义 | 第19-21页 |
第二章 平菇单双核菌丝亲缘关系鉴定 | 第21-28页 |
1 材料与方法 | 第21-23页 |
·材料 | 第21页 |
·菌株 | 第21页 |
·试剂 | 第21页 |
·主要仪器 | 第21页 |
·试验方法 | 第21-23页 |
·平菇天达与13×3等菌株生长速度比较 | 第21页 |
·出菇产量比较 | 第21-22页 |
·平菇单双核菌丝RAPD分析 | 第22-23页 |
·平菇单双核菌丝DNA提取 | 第22-23页 |
·随机引物的PCR扩增 | 第23页 |
2 结果与分析 | 第23-27页 |
·平板菌丝生长情况比较 | 第23-24页 |
·子实体生长发育情况比较 | 第24-25页 |
·平菇天达、13×3、13和3四个菌株RAPD分析 | 第25-27页 |
·平菇菌株DNA电泳检测 | 第25页 |
·四个平菇单双核菌株亲缘关系分析 | 第25-26页 |
·RAPD结果聚类分析 | 第26-27页 |
3 本章小结 | 第27-28页 |
第三章 平菇单双核菌丝转录组分析 | 第28-41页 |
1 材料与方法 | 第28-30页 |
·材料 | 第28页 |
·菌株 | 第28页 |
·培养基的配制 | 第28页 |
·试验方法 | 第28-30页 |
·Illumina高通量测序 | 第28页 |
·产量统计 | 第28页 |
·序列组装 | 第28-29页 |
·Unigene功能注释 | 第29页 |
·Unigene的GO分类 | 第29页 |
·Unigene代谢通路分析 | 第29-30页 |
·Unigene表达差异分析 | 第30页 |
2 结果与分析 | 第30-39页 |
·产量统计 | 第30-31页 |
·组装结果质量分析 | 第31-32页 |
·Unigene功能注释 | 第32-33页 |
·GO分类结果 | 第33-34页 |
·Unigene代谢通路分析 | 第34-35页 |
·Unigene表达差异分析 | 第35-38页 |
·所有表达差异基因 | 第35-36页 |
·表达差异显著基因 | 第36-37页 |
·单双核菌丝特有基因差异 | 第37-38页 |
·差异表达基因的GO分类 | 第38-39页 |
3 本章小结 | 第39-41页 |
第四章 平菇基因组DNA中四个漆酶基因的克隆测序 | 第41-58页 |
1 村料与方法 | 第41-45页 |
·材料 | 第41页 |
·菌株 | 第41页 |
·培养基的配制 | 第41页 |
·试剂 | 第41页 |
·主要仪器 | 第41页 |
·试验方法 | 第41-45页 |
·引物设计 | 第41-42页 |
·菌株的液体培养 | 第42页 |
·平菇基因组总DNA提取 | 第42页 |
·目的基因的PCR扩增 | 第42-43页 |
·PCR产物回收纯化 | 第43页 |
·漆酶基因PCR回收产物与pMD19-T克隆载体连接 | 第43-44页 |
·连接产物转化感受态细胞 | 第44页 |
·感受态细胞的制备 | 第44页 |
·转化感受态细胞 | 第44页 |
·重组质粒提取及检测 | 第44-45页 |
·DNA序列测定及分析 | 第45页 |
2 结果与分析 | 第45-57页 |
·DNA的质量检测 | 第45页 |
·基因组DNA水平上四个漆酶基因的克隆与序列分析 | 第45-57页 |
·平菇pox1基因的扩增及测序分析 | 第45-49页 |
·平菇poxc基因的扩增及测序分析 | 第49-52页 |
·平菇poxa3基因的扩增及测序分析 | 第52-55页 |
·平菇poxa1b的扩增及测序分析 | 第55-57页 |
3 本章小结 | 第57-58页 |
第五章 平菇基因组RNA水平上四个漆酶基因的克隆测序 | 第58-72页 |
1 材料与方法 | 第58-63页 |
·材料 | 第58-59页 |
·菌株 | 第58页 |
·培养基的配制 | 第58页 |
·试剂 | 第58页 |
·主要仪器 | 第58-59页 |
·试验方法 | 第59-63页 |
·引物设计 | 第59页 |
·平菇基因组总RNA提取 | 第59页 |
·CDNA第一条链的合成 | 第59-60页 |
·RT-PCR | 第60页 |
·PCR条件优化 | 第60页 |
·RT-PCR及产物检测 | 第60页 |
·目的基因的PCR扩增 | 第60-61页 |
·PCR产物回收纯化 | 第61页 |
·漆酶基因PCR回收产物与pMD19-T克隆载体连接 | 第61-62页 |
·连接产物转化感受态细胞 | 第62页 |
·感受态细胞的制备 | 第62页 |
·转化感受态细胞 | 第62页 |
·重组质粒提取及检测 | 第62页 |
·cDNA序列测定及分析 | 第62-63页 |
2 结果与分析 | 第63-71页 |
·发酵液和栽培料菌丝提取的RNA质量检测 | 第63页 |
·平菇四个漆酶基因RT-PCR分析 | 第63-67页 |
·RT-PCR条件优化 | 第63-65页 |
·发酵液菌丝漆酶基因表达差异 | 第65-66页 |
·栽培料菌丝漆酶基因表达差异 | 第66-67页 |
·漆酶cDNA克隆测序 | 第67-71页 |
·pox1 cDNA的克隆测序 | 第67-68页 |
·poxc cDNA克隆测序 | 第68-69页 |
·poxa3 cDNA克隆测序 | 第69-70页 |
·poxa1b cDNA克隆测序 | 第70-71页 |
3 本章小结 | 第71-72页 |
第六章 讨论 | 第72-74页 |
1 平菇亲缘关系鉴定的探究 | 第72页 |
2 平菇转录组测序结果分析 | 第72-74页 |
参考文献 | 第74-78页 |
ABSTRACT | 第78-79页 |