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弧菌基因组内16S rRNA基因拷贝数及异质性的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
引言第9-11页
1 绪论第11-25页
   ·原核生物 16S rRNA 基因多重拷贝及其序列异化第11-15页
     ·原核生物基因组内的 CN-rrs 是原核生物种的基本特征之一第11-12页
     ·原核生物 CN-rrs 与其利用环境资源的生态策略有关第12-13页
     ·原核生物基因组内 rrs 拷贝间的异化第13页
     ·原核生物基因组内 rrs 拷贝间异化与其对环境的适应有关第13-14页
     ·小结与展望第14-15页
   ·弧菌概述第15-18页
     ·弧菌的分类地位第15页
     ·弧菌的生态学意义第15-16页
     ·弧菌 16S rRNA 基因拷贝数及序列异化研究进展第16-18页
   ·rrs 拷贝数与异质性检测方法第18-25页
2 弧菌菌株的鉴定第25-35页
   ·前言第25页
   ·材料和方法第25-27页
     ·菌株和引物第25页
     ·培养基第25-26页
     ·主要试剂和仪器第26页
     ·菌株的多基因鉴定第26-27页
   ·结果第27-32页
   ·讨论第32-33页
   ·本章小结第33-35页
3 弧菌基因组内 16S rRNA 基因拷贝数的研究第35-54页
   ·前言第35页
   ·材料与方法第35-41页
     ·菌株和引物第35-36页
     ·培养基第36页
     ·主要试剂和仪器第36页
     ·弧菌基因组 DNA 提取第36-37页
     ·定量引物设计及扩增效果验证第37页
     ·标准质粒构建第37-40页
     ·标准曲线绘制第40页
     ·弧菌菌株 16S rDNA 拷贝数的确定第40-41页
   ·结果第41-50页
     ·引物的设计及扩增效果第41-42页
     ·标准质粒的构建第42-44页
     ·标准曲线的绘制第44-47页
     ·弧菌 16S rRNA 基因拷贝数第47-50页
   ·讨论第50-53页
     ·荧光定量 PCR 确定 16S rRNA 基因拷贝数第50-51页
     ·16S rRNA 基因拷贝数的波动第51-53页
   ·本章小结第53-54页
4 V. alginolyticus ATCC 17749~T的16S-ITS rDNA 研究第54-74页
   ·前言第54页
   ·材料与方法第54-58页
     ·菌株及引物第54页
     ·主要试剂和仪器第54-55页
     ·培养基第55页
     ·16S-ITS rDNA 克隆文库的构建第55-56页
     ·克隆文库阳性克隆检测第56-57页
     ·初步测序及序列分析第57页
     ·16S-ITS 的酶切筛选及测通第57-58页
     ·序列分析第58页
   ·结果第58-71页
     ·ITS 长度及种类第58页
     ·16S-ITS rDNA 序列酶切分析第58-65页
     ·序列分析第65-71页
   ·讨论第71-73页
     ·菌株 ATCC 17749~T的16S rRNA 基因拷贝数第71页
     ·菌株 ATCC 17749~T的16S rRNA 基因异质性第71-72页
     ·菌株 ATCC 17749~T的ITS 序列特点第72-73页
   ·本章小结第73-74页
5 结论与创新点第74-76页
   ·结论第74-75页
     ·弧菌菌株的鉴定第74页
     ·弧菌基因组内 16S rRNA 基因的拷贝数第74页
     ·V. alginolyticus ATCC 17749~T的16S-ITS rDNA 序列第74-75页
   ·创新点第75-76页
     ·研究方法第75页
     ·研究内容第75-76页
参考文献第76-81页
附录A pMD19-T simple vector 图谱第81-82页
在学研究成果第82-83页
致谢第83页

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