| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| 插图索引 | 第12-15页 |
| 表格索引 | 第15-16页 |
| 第一章 前言 | 第16-36页 |
| ·生物学基本概念 | 第16-22页 |
| ·细胞 | 第16-18页 |
| ·核酸 | 第18-21页 |
| ·蛋白质 | 第21-22页 |
| ·中心法则 | 第22页 |
| ·系统生物学概述 | 第22-31页 |
| ·系统生物学的产生与发展 | 第24-25页 |
| ·系统生物学研究对象 | 第25-30页 |
| ·系统生物学研究特点 | 第30-31页 |
| ·复杂疾病生物标志物 | 第31-34页 |
| ·癌症 | 第32页 |
| ·生物标志物 | 第32-33页 |
| ·癌症生物标志物 | 第33-34页 |
| ·论文的结构与研究内容 | 第34-36页 |
| 第二章 基于生物通路相互作用网络的复杂疾病标志物识别 | 第36-66页 |
| ·引言 | 第36-37页 |
| ·数据来源与处理 | 第37-39页 |
| ·癌症基因表达数据 | 第37-38页 |
| ·生物信号通路 | 第38页 |
| ·人类蛋白质-蛋白质相互作用数据 | 第38-39页 |
| ·癌症标志物识别方法 | 第39-42页 |
| ·生物学通路的活动水平得分 | 第39-40页 |
| ·构建生物学通路相互作用网络 | 第40页 |
| ·失调生物学通路网络识别 | 第40-42页 |
| ·结果 | 第42-59页 |
| ·癌症标志物识别结果 | 第42-47页 |
| ·失调生物学通路的鲁棒性检验 | 第47-48页 |
| ·癌症标志物对癌症影响分析 | 第48-59页 |
| ·讨论 | 第59-60页 |
| ·本章小结 | 第60-66页 |
| 第三章 复杂疾病关联microRNAs识别及其调控网络分析 | 第66-88页 |
| ·miRNA简介 | 第66-67页 |
| ·数据来源与处理 | 第67-69页 |
| ·癌症基因表达数据 | 第67-68页 |
| ·microRNA靶基因数据集 | 第68-69页 |
| ·生物信号通路 | 第69页 |
| ·microRNA鉴别方法 | 第69-72页 |
| ·筛选显著变化的生物学通路 | 第69-70页 |
| ·与癌症相关的miRNA鉴别 | 第70-71页 |
| ·与生物通路相关联的miRNA识别 | 第71页 |
| ·miRNA关联得分计算与排序 | 第71-72页 |
| ·结果 | 第72-80页 |
| ·与癌症相关的miRNA预测结果 | 第72-78页 |
| ·构建与癌症相关的miRNA调控网络 | 第78页 |
| ·miRNA关联网络分析 | 第78-80页 |
| ·讨论 | 第80-81页 |
| ·本章小结 | 第81-88页 |
| 第四章 总结和展望 | 第88-92页 |
| ·总结 | 第88-89页 |
| ·展望 | 第89-92页 |
| 参考文献 | 第92-100页 |
| 攻读博士学位期间完成的工作 | 第100-102页 |
| 致谢 | 第102页 |