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绵羊肉用性状全基因组关联分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-16页
第一章 文献与综述第16-28页
   ·绵羊肉用性状概述第16-18页
     ·研究绵羊肉用性状的意义第16页
     ·绵羊肉用性状主效基因及 QTL 研究第16-17页
     ·绵羊基因组研究进展第17-18页
   ·全基因组关联分析第18-26页
     ·GWAS 概述第18-19页
     ·样本选择与数据控制第19-20页
     ·GWAS 试验设计第20页
     ·GWAS 分析方法第20页
     ·GWAS 多重假设检验校正(Multiple Testing Adjusting)第20-21页
     ·群体分层(Population Stratification)第21-22页
     ·关联研究模型之混合模型第22页
     ·GWAS 存在的问题第22-23页
     ·GWAS 研究进展第23-26页
   ·SNP 芯片技术第26-27页
     ·SNP 芯片第26页
     ·SNP 芯片原理第26-27页
     ·SNP 芯片的数据分析第27页
   ·本研究的目的意义第27-28页
第二章 材料与方法第28-44页
   ·试验材料第28-31页
     ·试验动物第28页
     ·样品采集、运输及保存第28页
     ·主要试剂、溶液和仪器设备第28-29页
     ·软件及在线资源第29-31页
   ·试验方法第31-44页
     ·技术路线第31页
     ·表型测定及方法第31-33页
     ·绵羊基因组 DNA 提取与检测第33-34页
     ·SNP 基因型判定第34-38页
     ·数据分析第38-44页
第三章 试验结果第44-81页
   ·绵羊肉用性状表型数据分析结果第44-49页
     ·描述性统计分析第44-47页
     ·肉用性状表型相关性分析第47-49页
   ·基因组 DNA 检测第49页
   ·SNP 分型及质量控制第49-55页
   ·肉用性状全基因组关联分析结果第55-66页
     ·不同染色体显著水平第55-56页
     ·各肉用性状 GWAS 结果第56-63页
     ·群体分层评估结果第63-66页
     ·单倍型分析结果第66页
   ·GWAS 结果显著 SNPs 基因注释第66-70页
     ·断奶后日增重第66-67页
     ·断奶前日增重第67-68页
     ·日增重第68页
     ·胸围第68页
     ·管围第68-69页
     ·六月龄重第69页
     ·断奶重第69-70页
     ·其他肉用性状第70页
   ·基于绵羊基因组 Ovis_aries_v1.0 的 SNPs 功能注释第70-75页
   ·候选基因数据挖掘第75-81页
第四章 讨论第81-90页
   ·关于表型值的选择第81页
   ·群体分层讨论第81页
   ·关联分析模型讨论第81-82页
   ·单倍型分析讨论第82页
   ·重要候选基因讨论第82-90页
第五章 全文结论第90-91页
   ·结论第90页
   ·展望第90-91页
参考文献第91-102页
致谢第102-103页
作者简历第103页

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