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组蛋白甲基化与DNA甲基化的相互作用及其表观遗传机制的研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-12页
1 前言第12-39页
   ·DNA序列外的遗传和调控信息第12-13页
     ·表观基因组第12-13页
     ·表观调控与表观遗传第13页
   ·基于染色质的表观调控和表观遗传第13-32页
     ·染色质承载着遗传和调控信息第13-14页
     ·DNA甲基化第14-17页
     ·组蛋白、组蛋白变体和组蛋白修饰第17-23页
       ·组蛋白的复制和遗传第17-18页
       ·组蛋白变体与表观遗传调控第18-19页
       ·组蛋白修饰第19-23页
     ·非组蛋白染色质结合蛋白第23-25页
     ·非编码RNA第25-26页
     ·染色质的空间构象第26-30页
     ·表观基因组的重编程(Reprogramming)第30-31页
     ·表观基因组的变异与进化第31-32页
   ·组蛋白甲基化与组蛋白去甲基化酶第32-38页
     ·组蛋白甲基化第32页
     ·组蛋白去甲基化酶第32-36页
     ·组蛋白甲基化与DNA甲基化的相互作用第36-38页
   ·本研究的目的与意义第38-39页
2 材料与方法第39-49页
   ·实验材料第39-40页
     ·水稻材料和烟草材料第39页
     ·菌株第39页
     ·质粒第39-40页
     ·抗体第40页
   ·基因序列信息获取第40页
   ·实验方法第40-49页
     ·载体构建第40页
     ·农杆菌介导的水稻遗传转化和烟草瞬时转化第40-41页
     ·转基因材料中目的基因的表达水平分析第41-42页
     ·蛋白质互作分析方法第42-43页
     ·染色质特异位点的组蛋白修饰的分析方法第43-44页
     ·DNA甲基化分析方法第44-45页
     ·荧光免疫染色(Immuno-staining)第45-46页
     ·本研究的引物信息第46-49页
3 结果与分析第49-84页
   ·组蛋白去甲基化酶基因JMJ703的功能研究第49-63页
     ·JMJ703是一个组蛋白H3K4去甲基化酶第49-53页
     ·JMJ703参与调控细胞分裂第53-57页
       ·JMJ703转基因材料的构建第53页
       ·JMJ703的缺失影响水稻茎杆伸长第53-57页
     ·JMJ703在基因诱导表达中的作用第57-58页
     ·JMJ703与DNA甲基化第58-60页
     ·JMJ703互作蛋白的研究第60-61页
     ·JM J703抗体的制备及其染色质定位分析第61-63页
   ·染色质修饰的相互作用及表观遗传记忆的研究第63-84页
     ·一个愈伤组织特异表达的基因CXS第63页
     ·CXS的转录模式第63页
     ·CXS的表达受顺式调控(cis-regulated)第63-67页
     ·CXS的表观修饰情况第67-74页
       ·CXS受DNA甲基化调控第67-70页
       ·small RNA不参与CXS的调控第70页
       ·CXS转录起始位点H3K4三甲基化(H3K4me3)的富集第70-72页
       ·组蛋白变体H2A.Z在调控CXS中的作用第72页
       ·活跃表达的CXS位点染色质更松散第72-74页
     ·CXS的表观遗传记忆第74-77页
       ·CXS的DNA去甲基化状态可遗传给后代第75-77页
       ·组蛋白H3K4me3的稳定遗传第77页
     ·CXS调控因子的鉴定第77-83页
       ·寻找CXS表达受抑制的材料第77页
       ·组蛋白H3K27甲基转移酶CLF对CXS表达的调控第77-79页
       ·染色质变构因子CHR729对CXS表达的调控第79-80页
       ·组蛋白H3K4去甲基化酶基因JMJ703对CXS表达的调控第80-82页
       ·JMJ703、CLF和CHR729对CXS的调控发生在细胞脱分化过程第82-83页
     ·CXS的表观调控记忆模型第83-84页
4 讨论第84-94页
   ·JMJ703的组蛋白去甲基化活性第84-86页
   ·JMJ蛋白功能的多样性第86页
   ·JMJ703与DNA甲基化第86-87页
   ·表观修饰和基因表达的重编程第87-88页
     ·CXS离重编程第87-88页
     ·重编程过程中染色质修饰因子的作用第88页
   ·DNA甲基化与组蛋白H3K4me3的相互关系第88-91页
     ·DNA去甲基化引起组蛋白H3K4me3上升第90页
     ·H3K4me3去甲基化促进DNA甲基化第90页
     ·DNA甲基化与H3K4me3的表观遗传第90-91页
   ·DNA甲基化和组蛋白甲基化,基因表达的原因还是结果第91页
   ·组蛋白变体在表观遗传中的作用第91-92页
   ·进化中的表观遗传第92页
   ·表观遗传研究展望第92-94页
参考文献第94-109页
附录第109-117页
作者简介第117-118页
致谢第118页

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