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土壤病原真菌的检测及土壤中真菌群落多样性的研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词第11-12页
第一章 文献综述第12-30页
   ·病原真菌的检测鉴定方法第12-15页
     ·病原真菌的传统检测鉴定方法第12页
     ·病原真菌的分子检测鉴定方法第12-14页
     ·真菌核糖体基因转录间隔区序列分析在真菌分类鉴定中的应用第14-15页
   ·土壤病原真菌引起的病害与防控第15-18页
     ·西瓜枯萎病害与生物防控第15-16页
     ·夏季草坪斑枯病害与杀菌剂第16-17页
     ·杀菌剂对农田微生物的影响第17-18页
   ·土壤真菌第18-21页
     ·土壤真菌与土壤环境第18-19页
     ·土壤真菌的多样性第19页
     ·土壤根际微生物第19-21页
     ·土壤真菌的群落演替第21页
   ·土壤真菌群落多样性的研究方法第21-27页
     ·土壤真菌的传统分离和计数方法第21-22页
     ·土壤真菌多样性的分子生物学研究方法第22-27页
   ·研究目的和意义第27-30页
第二章 SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR和Macroarray检测技术对病原真菌Fusarium oxysporum的快速定量检测第30-42页
   ·材料与方法第30-34页
     ·实验材料第30-31页
     ·盆栽试验设计第31-32页
     ·实验方法第32-34页
     ·数据分析第34页
   ·结果与分析第34-39页
     ·施用微生物有机肥对西瓜枯萎病害发病率的影响第34-35页
     ·SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR反应条件的优化第35-36页
     ·SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR标准曲线的制作第36-37页
     ·SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR对尖孢镰刀菌的检测及相对定量第37页
     ·Macroarray技术对尖孢镰刀菌的检测第37-39页
   ·讨论第39-42页
第三章 DGGE和分子克隆技术对微生物有机肥施用后土壤中真菌变化的研究第42-52页
   ·材料与方法第42-46页
     ·实验材料第42页
     ·实验方法第42-46页
   ·结果与分析第46-50页
     ·N~-P~-与N~++P~+根际土壤的18S rDNA ITS基因克隆文库分析第46-48页
     ·微生物有机肥施用后土壤真菌群落结构的DGGE分析第48-50页
   ·讨论第50-52页
第四章 Macroarray检测技术对夏季草坪斑枯病原菌的检测第52-64页
   ·材料与方法第52-59页
     ·菌种来源及其DNA的提取第52-54页
     ·PCR扩增及测序第54-57页
     ·系统发育分析第57-58页
     ·Macroarray探针的设计第58-59页
   ·结果与分析第59-62页
     ·六个基因的PCR扩增结果第59-60页
     ·六个基因位点系统发育分析第60-61页
     ·Macrorray检测结果第61-62页
   ·讨论第62-64页
第五章 TaqMan Real-time PCR方法对夏季草坪斑枯病病原菌Magnaporthe poae的快速定量检测第64-78页
   ·材料与方法第64-69页
     ·菌株的收集与培养第64页
     ·土壤理化性质及样品的采集第64-66页
     ·发病指数统计第66页
     ·菌种DNA的提取第66页
     ·Taqman荧光定量PCR引物和探针的设计第66-68页
     ·普通PCR扩增第68页
     ·Taqman荧光定量PCR扩增第68-69页
   ·结果与分析第69-76页
     ·普通PCR和Taqman荧光定量PCR对M.poae检测极限第69页
     ·Taqman real-time荧光定量PCR特异性检验第69-71页
     ·Taqman real-time荧光定量PCR标准曲线的绘制第71-72页
     ·三种M.poae检测方法的比较第72-76页
   ·讨论第76-78页
第六章 DGGE、分子克隆和Illumina高通量测序技术对两种杀菌剂施用后土壤真菌群落结构变化的研究第78-106页
   ·材料与方法第78-86页
     ·土壤样品的采集第78-79页
     ·根际土壤真菌的分离培养第79页
     ·18S rDNA ITS基因分子克隆文库的建立第79-80页
     ·ITS基因的Metagenomic文库建立与Illumina高通量测序第80-84页
     ·优势真菌Phoma medicaginis回接实验第84-86页
   ·结果与分析第86-103页
     ·根际土壤真菌的分离培养第86页
     ·18S rDNA 1TS基因的分子克隆文库第86-89页
     ·利用DGGE分析杀菌剂处理后土壤中真菌群落的多样性第89-92页
     ·Illumina高通量测序结果的分析方法第92-96页
     ·氯苯嘧啶醇喷施后草坪根际土壤中真菌种类变化第96-97页
     ·氯苯嘧啶醇使用后根际土壤中真菌的分布第97-98页
     ·氯苯嘧啶醇使用后根际土壤中优势真菌第98-100页
     ·氯苯嘧啶醇施用后草坪病原真菌和根际土壤真菌的变化第100-102页
     ·土壤稀释分离培养,基因克隆文库及Illumina高通量测序方法的比较第102-103页
   ·讨论第103-106页
参考文献第106-122页
全文总结第122-124页
创新点第124-126页
在读博士期间撰写和(待)发表的学术论文第126-128页
致谢第128页

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