| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 0 前言 | 第13-14页 |
| 1 综述 | 第14-21页 |
| ·水产养殖环境微生物生态学研究 | 第14-16页 |
| ·微生物生态学（Microbial ecology）的概念 | 第14页 |
| ·水产养殖生态系统 | 第14页 |
| ·微生物在生态系统的地位 | 第14-15页 |
| ·微生物在生源要素循环中的作用 | 第15-16页 |
| ·微生物群落结构和多样性的研究 | 第16-20页 |
| ·养殖环境的微生物群落多样性研究的现实意义 | 第17页 |
| ·微生物多样性的研究方法 | 第17-20页 |
| ·传统的培养分离方法 | 第18页 |
| ·BIOLOG 微平板方法 | 第18页 |
| ·生物标记方法 | 第18-19页 |
| ·现代分子生态学方法 | 第19-20页 |
| ·本研究立题依据和主要研究内容 | 第20-21页 |
| ·立题依据 | 第20页 |
| ·主要研究内容 | 第20-21页 |
| 2 草鱼混养系统参与生源要素循环的菌群数量变动研究 | 第21-35页 |
| ·引言 | 第21页 |
| ·材料与方法 | 第21-27页 |
| ·采样池塘与各种鱼放养量 | 第21-22页 |
| ·样品采集与预处理 | 第22-23页 |
| ·培养方法 | 第23页 |
| ·微生物生物量的统计方法 | 第23-24页 |
| ·荧光原位杂交（FISH） | 第24-27页 |
| ·结果与分析 | 第27-33页 |
| ·养殖水体和底泥细菌在碳素（有机含碳化合物）代谢中的特征 | 第27-29页 |
| ·水体中参与含碳有机化合物代谢的生理类群细菌数量 | 第27-28页 |
| ·底泥中参与含碳有机化合物代谢的生理类群细菌数量 | 第28-29页 |
| ·养殖水体和底泥参与磷循环的生理类群的细菌数量 | 第29-32页 |
| ·水体中参与磷循环的生理类群细菌数量 | 第29-30页 |
| ·底泥中参与磷循环的生理类群细菌数量 | 第30-32页 |
| ·养殖水体中参与氮循环的菌群数量变动 | 第32-33页 |
| ·讨论 | 第33-35页 |
| 3 草鱼混养系统微生物群落功能多样性的研究 | 第35-52页 |
| ·引言 | 第35页 |
| ·材料与方法 | 第35-37页 |
| ·采样池塘与各种鱼放养量 | 第35页 |
| ·样品采集与预处理 | 第35-36页 |
| ·异养菌和弧菌计数 | 第36-37页 |
| ·培养基 | 第36页 |
| ·异养菌计数 | 第36-37页 |
| ·弧菌计数 | 第37页 |
| ·Biolog 分析 | 第37页 |
| ·Biolog-ECO 板反应 | 第37页 |
| ·数据处理 | 第37页 |
| ·结果与分析 | 第37-50页 |
| ·水体和底泥中异养菌和弧菌数量变动 | 第37-39页 |
| ·水体中异养菌和弧菌数量变动 | 第37-38页 |
| ·底泥中异养菌和弧菌数量变动 | 第38-39页 |
| ·水体和底泥微生物群落平均活性（AWCD） | 第39-41页 |
| ·不同模式中水体微生物群落对同一碳源利用 | 第41-45页 |
| ·不同模式中底泥微生物群落对同一碳源利用 | 第45-48页 |
| ·养殖环境微生物群落多样性指数分析 | 第48-49页 |
| ·养殖环境微生物群落的碳源代谢主成分分析 | 第49-50页 |
| ·讨论 | 第50-52页 |
| ·水体、底泥中异养菌和弧菌数量变动 | 第50页 |
| ·水体、底泥中微生物群落的 Biolog 分析 | 第50-52页 |
| 4 草鱼混养系统微生物群落组成的研究 | 第52-72页 |
| ·引言 | 第52-53页 |
| ·材料和方法 | 第53-59页 |
| ·材料 | 第53页 |
| ·采样池塘与各种鱼放养量 | 第53页 |
| ·样品采集与预处理 | 第53页 |
| ·方法 | 第53-59页 |
| ·DNA 的提取 | 第53-54页 |
| ·DNA 纯度和浓度的检测 | 第54页 |
| ·16S rDNA 片段的扩增 | 第54-55页 |
| ·DGGE 电泳 | 第55-57页 |
| ·优势条带的回收 | 第57页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第57页 |
| ·PCR 产物的克隆 | 第57-59页 |
| ·结果与分析 | 第59-70页 |
| ·总 DNA 的抽提 | 第59-60页 |
| ·16SrDNA-V3 区的 PCR 扩增 | 第60页 |
| ·DGGE 分离 PCR 产物 | 第60-66页 |
| ·水体细菌 DGGE 分析 16S rDNA V3 区片段 PCR 产物 | 第61-63页 |
| ·底泥细菌 DGGE 分析 16S rDNA V3 区片段 PCR 产物 | 第63-66页 |
| ·DGGE 条带序列测定和系统发育分析 | 第66-70页 |
| ·讨论 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-78页 |
| 5 附录 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 个人简历 | 第81页 |
| 发表的学术论文 | 第81页 |
